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LYRM1基因过表达对P19细胞分化、增殖和凋亡的影响

发布时间:2020-11-04 22:38
   先天性心脏病(CHD)一直以来都是婴儿死亡的一个主要病因。大多数学者认为CHD主要与遗传和环境有关,其中遗传因素的作用起着主要作用。虽然目前已发现多个与心肌细胞发育、先天性心脏病发生相关的基因,但其确切机制并不十分清楚。因此,从分子水平上开展先天性心脏病的病因研究,发现新的靶基因十分必要。 LYRM1(LYR motif containing 1)是一个新发现的基因,一篇有关其与肥胖关系的文献报道表明其可以促进前体脂肪细胞的增殖和抑制前体脂肪细胞的凋亡,多组织表达谱提示该基因中等丰度表达于人类心脏组织,且与线粒体功能密切相关。由于在脊椎动物的器官发育中,心脏与脂肪组织均起源中胚层、细胞增殖和细胞凋亡是心脏形态建成的两个重要进程、线粒体是心脏组织重要的能量来源,而目前有关其与先天性心脏病的关系尚未见报道,因此本文拟以该基因为研究对象,初步阐明其生物学特性及其对心肌细胞株P19细胞功能的影响。 生物信息学分析提示,LYRM1基因全长1589 bp(NM_020424),开放阅读框302~670 bp,编码122个氨基酸(NP_065157);定位于染色体16p11.2区域,有4个外显子和3个内含子。LYRM1基因编码的蛋白是一亲水性的可溶蛋白,未发现信号肽序列,可能为非分泌蛋白;不存在跨膜结构域,应不属于膜蛋白。亚细胞定位分析提示,LYRM1基因定位于胞核的可能性较大;蛋白结构域分析发现,LYRM1基因编码蛋白存在一LYR结构域,提示可能参与线粒体功能及能量代谢;蛋白序列比对提示,LYRM1基因编码蛋白相对保守。 P19细胞是从C3H/He雄性小鼠畸胎瘤中分离得到的,是一种能够在体外培养的胚胎干细胞,二甲基亚砜(DMSO)可将其诱导分化为心肌样细胞。 进一步构建LYRM1基因稳定过表达P19细胞株,观察LYRM1基因过表达(overexpression)对P19细胞分化、增殖及凋亡的影响。通过倒置显微镜观察过表达LYRM1的P19细胞和含空载体的P19细胞向心肌细胞分化过程,LYRM1基因对P19细胞分化无明显影响;MTT比色法测定及细胞周期分析结果显示,LYRM1基因具有促进P19细胞增殖的作用;磷脂酰丝氨酸外翻分析及Caspase 3活性检测结果提示,LYRM1基因对P19细胞凋亡具有抑制作用。 总之,本研究初步探讨了LYRM1基因的生物学特性及其对P19细胞功能的影响,为先天性心脏病的研究提供新的线索。
【学位单位】:南京医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2010
【中图分类】:R725.4
【部分图文】:

序列,核酸,内含子,组序


图 1. LYRM1 基因的核酸及蛋白序列阴影部分表示起始密码子及终止密码子;下划线部分表示加尾信号AATAAA 序列。运用Spidey工具,将LYRM1基因 mRNA序列与人类基因组序列进行比对,结果显示其含 4 个外显子和 3 个内含子(图 2),所有内含子都以 GT 开始,以AG 结束,遵守 GT-AG 规律。

序列,外显子,内含子,基因组序列


南京医科大学硕士学位论文图 1. LYRM1 基因的核酸及蛋白序列阴影部分表示起始密码子及终止密码子;下划线部分表示加尾信号AATAAA 序列。运用Spidey工具,将LYRM1基因 mRNA序列与人类基因组序列进行比对,结果显示其含 4 个外显子和 3 个内含子(图 2),所有内含子都以 GT 开始,以AG 结束,遵守 GT-AG 规律。

疏水性,亲水性,标度值


图 4. LYRM1 基因编码蛋白的疏水性/亲水性分析标为序列,纵坐标为氨基酸的标度值,值越高表示疏水性越强构域是膜中蛋白与膜脂相结合的主要部位,一般由 20 个组成,形成α-螺旋,它固着于细胞膜上起锚定作用。跨,对于了解蛋白质的结构、功能以及在细胞中的作用部MHMM 工具对 LYRM1 氨基酸序列的跨膜结构域进行预未找到跨膜结构域。
【参考文献】

相关期刊论文 前2条

1 许婵婵;韩卫青;肖冰;李宁宁;朱鼎良;高平进;;微小RNA在自发性高血压大鼠主动脉的差异表达[J];生理学报;2008年04期

2 钱玲梅,曹克将,黄元铸,孔祥清,单其俊;房间隔缺损患者心肌组织基因表达谱系特征的初步分析[J];中华心血管病杂志;2003年03期



本文编号:2870707

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