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二代测序诊断一例HBB外显子自发显性突变导致异常血红蛋白

发布时间:2021-03-30 02:36
  遗传性血红蛋白病是世界上最常见的单基因遗传病,约有3.4%的5岁以下儿童的死亡是由这类遗传病导致的,因此,遗传性血红蛋白病也是严重威胁人类健康的一组遗传性血液病。这类疾病被分为两类:异常血红蛋白及地中海贫血。地中海贫血,简称地贫,是全球广为流传的遗传性溶血性疾病。在临床上,地中海贫血主要分为αα-地中海贫血和β-地中海贫血,它们分别由αα-珠蛋白基因簇及β-珠蛋白基因簇上的突变引起。其中,β-地中海贫血是由β-珠蛋白基因簇上的基因发生变异,从而引起的一类血液遗传病。异常血红蛋白是世界上最常见的血红蛋白病之一,根据HbVar数据库,目前已经有1771条珠蛋白基因的突变的记录,而其中有超过1300种珠蛋白基因突变与异常血红蛋白有关,这当中就包括导致著名的镰刀型细胞贫血症(Sickle cell disease,SCD)的异常血红蛋白HbS。不同的血红蛋白变异体在人体内会引起不同程度的症状,许多血红蛋白变异体通常没有临床症状,而有一些血红蛋白变异体可能会导致血红蛋白与氧气的亲和性增高从而引起红细胞增多症,另一些血红蛋白变异体是不稳定的异常血红蛋白,并且会导致溶血性贫血。还有一些相对比较少见的... 

【文章来源】:南方医科大学广东省

【文章页数】:58 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

二代测序诊断一例HBB外显子自发显性突变导致异常血红蛋白


图1-1人体发育过程中,P-基因簇上基因表达转换的时间顺序??Figure?1-1?Timing?of?P-like?globin?subunit?switchin?

家系图,家系图,先证者


亲子狻定??蛋白质二级结构预测??图3-1技术路线图??Figure?3-1?Workflow?of?this?study??3.2家系样本采集??先证者于4岁时,在北京儿童医院被诊断出患有溶血性贫血,同时伴有黄疸??Me.lpimol/L)及脾肿大(1.5x〇.6cm2),并且没有铁、维生素B12或叶酸的缺??乏。先证者当时在北京儿童医院进行了她的首次输血治疗。??先证者(图3-2中箭头标出)及其父母(1-1、1-2、II-1)的EDTA抗凝血样从??他们当地医院采集,放于干冰中通过快递寄送到我们的实验室之后,即进行后??续的处理工作及试验。同时,由于病人当时还未满10周岁,不具有民事行为能??力,因此,他父母均签写了知情同意书,并一同寄送至我们的实验室。??18??

程序界面


????亲时,结果(称为亲权)为0%,而当所谓的父母是孩子的生物学双亲时,亲权??鉴定的概率为99.99%。??根据亲子鉴定AGCU?Expressmarker22?STR试剂盒说明书,对病人及其父母??的DNA进行扩增后,利用ABI?3130x1仪器对PCR产物进行分析,以进行亲子鉴定。??3.11蛋白质二级结构预测??我们使用在线的Hierachical?neural?network?(HNN)程序对正常的血红蛋白??肽链及异常血红蛋白肽链进行了二级结构的预测,该程序的url链接地址为:??https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa?automat.pr?page=/NPSA/npsa_hnn.html〇??HNN程序最早由Qian及Sejnowski于1988年提出151)1,是一种基于训练集的蛋??白质二级结构预测神经网络程序,因此,如果所要预测的蛋白质与训练集中存??在的某些蛋白质相类似,那么此时预测结果的准确性也会相应地比那些与训练??集中的蛋白质都不相似的预测结果更为准确。??


本文编号:3108686

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