不同临床表型过敏性紫癜患儿肠道菌群的差异分析

发布时间：2021-11-03 11:24

　　目的:本实验通过检测不同临床表型过敏性紫癜（Henoch-Schonlein purpura,HSP）患儿肠道菌群的变化,初步探究肠道菌群的变化是否参与了HSP及脏器损伤的发生及发展,为我们寻找和研究HSP的病因、发病机制以及治疗提供新的理论依据。方法:收集自2018年5月至2019年5月江西省儿童医院初次就诊且诊断为HSP患儿共30例,其中单纯紫癜型（B组）、消化道出血型（C组）、肾脏损伤型（D组）患儿各10例,以10名健康儿童粪便作为对照组（A组）,提取粪便DNA,对16S rRNA基因的V4区进行高通量测序,并进行生物信息学分析。并应用ELISA法检测受试者血清中IL-6、IL-8和IL-10的水平,采用免疫散射比浊法检测血清IgA、IgG、IgM和IgE的水平。应用Spearman相关性分析方法,探讨肠道菌群与炎症因子的相关性。结果:与健康儿童相比,单纯紫癜型HSP患儿中双歧杆菌属（门到属水平）丰度明显降低（P<0.05）;消化道出血型HSP患儿中变形菌门、δ变形菌纲、脱硫弧菌科（目到科水平）、Oscillospira属、Parabacteroides属丰度明显增高,而双... 

【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

不同临床表型肠道菌群和健康儿童组OTUVenn图

第3章结果11图1不同临床表型肠道菌群和健康儿童组OTUVenn图注释：图中不同颜色代表不同组，两两交叠部分数字为组与组之间共同拥有的OTU个数。3.2.2测序与质量控制通过测序得到RawReads共6551486条，对其进行优化后得到CleanReads共6418300条，平均每个样本160456条，最多为160544条/样本，最少为160306测序覆盖度较好，序列拼接使用软件FLASH（FastLengthAdjustmentofShortreads，v1.2.11），利用重叠关系将双末端测序得到的成对reads组装成一条序列，得到高变区的Tags。序列拼接的要求：最小匹配长度15bp；重叠区域允许错配率为0.1。拼接后获得序列3200920条，总序列平均读长504bp，共注释获得OTU总数692。Shannon指数曲线随测序深度的增加趋向于平坦，表明测序数据足够大，足以反映各组微生物信息（见图2）。图2四组研究对象的Shannon指数值与样品深度的关系稀释曲线即为上图，用从样本中随机抽取的序列数表示横坐标，用抽取的序列其所属的Shannon指数表示纵坐标；图中每个样本用一个曲线表示，不同的组别用不同的颜色标识。

第3章结果123.2.3肠道菌群的丰度及多样性分析（1）Alpha多样性分析通过用Qimme软件得出Chao、Ace、Simpson、Shannon指数，并且对四组儿童这四个指数进行差异性分析，得出P值分别为0.14、0.13、0.68、0.65，即P＞0.05，提示四个指数均无统计学差异（见图3，表2）。图3四组样本肠道菌群的Alpha多样性比较表2四组样本肠道菌群的Alpha多样性比较（X±S）Alpha指数A组B组C组D组P值Chao203.2±58.4234.3±73.9236.9±63.7278.2±66.80.14Ace211.0±52.8235.1±61.1236.9±53.3276.6±61.70.13Shannon2.96±0.392.88±0.593.07±0.603.16±0.540.65Simpson0.11±0.030.14±0.080.11±0.060.13±0.090.68（2）OTU的PLS-DA分析PLS-DA结果显示，提示过不同临床表型敏性紫癜患儿(B、C、D组)和A组的健康儿童存在肠道菌群组内分布相似，但是各组之间的肠道菌群被明显分开，则提示四组肠道菌群存在显著差异，可以进行

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3473595