肛门直肠畸形大鼠盆底肌发育异常的分子机制及其宫内移植干细胞修复作用的研究
发布时间:2021-12-17 01:22
目的:先天性肛门直肠畸形(Anorectal malformations,ARMs)是最常见的小儿消化道畸形,同时也是世界卫生组织常规监测的先天畸形之一,其发病率为1/5000~1/1500,居消化道畸形首位。研究至今,ARMs的病因仍不清晰,且病理类型及改变繁多而复杂。虽然手术方式不断改进,总病死率及手术死亡率显著下降,但是国内外学者随访发现,部分患儿术后仍存在不同程度的排便功能障碍,对患儿的生活质量及心理健康造成不同程度的影响,给患儿家庭和社会带来沉重的医疗负担和经济压力。便秘、便失禁等不良预后与畸形类型及伴发畸形,如盆底肌发育异常、盆底肌的支配神经发育异常和骶尾椎发育不良等发育缺陷密切相关。在诸多因素中,盆底横纹肌复合体(Striated Muscle Complex,SMC),是控制排便的关键因素之一,SMC中的肌肉神经发育异常是影响AMRs患儿预后的重要原因之一。相关前期研究已证实,ARMs患儿及实验动物模型中均存在着不同程度的SMC发育异常。表现为肌纤维发育异常、肌梭发育异常与运动终板发育异常。胚胎期SMC的发育过程较为复杂,是诸多环境与遗传因素共同作用的结果。参与其中的分...
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:153 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
E19天对照组与ARMs组SMC组织中差异mRNA的表达分析
lularcomponent);分子功能(molecularfunction);生物学途径(biologicalprocess)。根据实验目的筛选差异基因后,对差异表达基因进行GO分类分析,研究差异基因在GO中的分布状况,阐明实验中样本差异在基因功能上的体现[50]。对差异基因和本实验中所有基因即背景基因在GO的二级水平进行分类,得到差异基因及背景基因在每个二级条目的分布情况。从GO分析结果(图3.2)可知,生物学途径(biologicalprocess)层次占主要地位,其中占前五位的生物学过程如下:cellularprocess、singleorganismprocess、cell、bingding、cellpart。图3.2E19时SMC组织差异表达mRNA的GO二级频率图横坐标为GO数据库的分类内容,纵坐标左边为基因数目所占百分比,右边为基因数目。此图展示的是在差异基因背景和全部基因背景下GO数据库各二级功能的基因分布的情况,体ENSRNOG000000015973:-:60718847-60796006Atf27.650.015364798upENSRNOG000000152222:-:202794187-202816562Fam46c-9.600.038901188downENSRNOG000000078516:+:93422923-93444240Psma3-8.920.020100963downENSRNOG0000003721113:+:53350061-53422216Kif14-8.340.001073843downENSRNOG0000004644513:-:110807913-110864702Rcor3-8.327.40791E-06downENSRNOG000000079057:+:3354561-3384675Itga7-8.137.52753E-05downENSRNOG000000329222:+:144646148-144939391Dclk1-7.880.001275207downENSRNOG0000001834218:-:71463486-71883470Ctif-7.870.001421508downENSRNOG000000103793:+:79768797-79842082Celf1-7.780.002030827downENSRNOG00000060542X:+:112019772-112121979Mid2-7.750.000165337downENSRNOG0000000038320:+:26988774-27074138Mypn-7.660.000510495down
中国医科大学博士学位论文16现两个背景下各二级功能的地位。GO功能显著性富集分析(图3.3)是根据差异与背景相比,分析差异表达基因与哪些生物学功能显著相关。该分析首先把所有差异表达基因向GO数据(http://www.geneontology.org/)的各个条目映射,计算每个条目的基因数目,利用超几何分布进行假设检验,得到富集结果的p-value,此时得到的p-value假阳性较高,利用BH多重假设检验对p-value进行校正可降低假阳性,校正后可得到Correctedp-Value,Correctedp-Value越低富集结果越显著。由GO富集分析可得,前五位的条目如下:myofibril、contractilefiber、musclesystemprocess、sarcomere、musclecontraction。图3.3E19时SMC组织差异表达mRNA的GOontology层次图选取差异分析中得到的差异表达基因,进行Pathway注释和富集。基于Pathway的分析有助于进一步了解基因的生物学功能。KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据差异基因所属不同类别,对差异基因进行分类并排序,取排名前20得到富集散点图(图3.4),前五位通路是Hypertrophiccardiomyopathy(HCM)、Cardiacmusclecontraction、Dilatedcardiomyopathy、Adrenergicsignalingincardiomyocytes、Neuroactiveligandreceptorinteraction。
【参考文献】:
期刊论文
[1]先天性肛门直肠畸形术后合并便秘患儿排便功能评定及病因探讨[J]. 杨中华,王大斌,刘丹,贾慧敏,白玉作,王维林,袁正伟. 临床小儿外科杂志. 2020(01)
[2]Long noncoding RNAs in neurodevelopment and Parkinson’s disease[J]. Ying Lyu,Lin Bai,Chuan Qin. Animal Models and Experimental Medicine. 2019(04)
[3]Wnt信号调控骨骼肌生长、发育与再生的机制[J]. 张宗明,金成龙,严会超,王修启. 动物营养学报. 2019(02)
[4]肛门直肠畸形术后排便功能的中期评估[J]. 吉耿锋,张志波. 中华小儿外科杂志. 2018 (12)
[5]长链非编码RNA在肌肉分化发育及疾病中的研究进展[J]. 贺健,王飞,张鹏,陈晓萍. 航天医学与医学工程. 2017(05)
[6]先天性肛门直肠畸形患儿母亲照顾体验的质性研究[J]. 刘晓然,胡丽君,刘丽,应本娟. 解放军护理杂志. 2016(23)
[7]先天性肛门直肠畸形的影像学检查[J]. 王刚. 发育医学电子杂志. 2016(01)
[8]肛管内超声及肛直肠测压在肛门闭锁术后肛门功能评估的意义[J]. 黄妍,金先庆,李晓庆,刘磊,袁亮,郭振华. 重庆医学. 2014(28)
[9]改良股薄肌移植联合生物反馈对肌源性肛门失禁患儿肛门节制的疗效[J]. 鲍俊涛,张书峰,王晓晖,王旭辉,孟庆磊. 广东医学. 2014(03)
[10]两种人工肛门括约肌节制排便效果的比较[J]. 肖钟,黄宗海,史福军,陈飞,郭雄波. 安徽医科大学学报. 2013(04)
博士论文
[1]肛门直肠畸形胎鼠腰骶髓发育异常机制及其宫内骨髓间充质干细胞移植修复的实验研究[D]. 杨中华.中国医科大学 2018
硕士论文
[1]基于无线经皮供能的反馈式人工肛门括约肌系统及实验研究[D]. 刘志强.上海交通大学 2014
本文编号:3539151
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:153 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
E19天对照组与ARMs组SMC组织中差异mRNA的表达分析
lularcomponent);分子功能(molecularfunction);生物学途径(biologicalprocess)。根据实验目的筛选差异基因后,对差异表达基因进行GO分类分析,研究差异基因在GO中的分布状况,阐明实验中样本差异在基因功能上的体现[50]。对差异基因和本实验中所有基因即背景基因在GO的二级水平进行分类,得到差异基因及背景基因在每个二级条目的分布情况。从GO分析结果(图3.2)可知,生物学途径(biologicalprocess)层次占主要地位,其中占前五位的生物学过程如下:cellularprocess、singleorganismprocess、cell、bingding、cellpart。图3.2E19时SMC组织差异表达mRNA的GO二级频率图横坐标为GO数据库的分类内容,纵坐标左边为基因数目所占百分比,右边为基因数目。此图展示的是在差异基因背景和全部基因背景下GO数据库各二级功能的基因分布的情况,体ENSRNOG000000015973:-:60718847-60796006Atf27.650.015364798upENSRNOG000000152222:-:202794187-202816562Fam46c-9.600.038901188downENSRNOG000000078516:+:93422923-93444240Psma3-8.920.020100963downENSRNOG0000003721113:+:53350061-53422216Kif14-8.340.001073843downENSRNOG0000004644513:-:110807913-110864702Rcor3-8.327.40791E-06downENSRNOG000000079057:+:3354561-3384675Itga7-8.137.52753E-05downENSRNOG000000329222:+:144646148-144939391Dclk1-7.880.001275207downENSRNOG0000001834218:-:71463486-71883470Ctif-7.870.001421508downENSRNOG000000103793:+:79768797-79842082Celf1-7.780.002030827downENSRNOG00000060542X:+:112019772-112121979Mid2-7.750.000165337downENSRNOG0000000038320:+:26988774-27074138Mypn-7.660.000510495down
中国医科大学博士学位论文16现两个背景下各二级功能的地位。GO功能显著性富集分析(图3.3)是根据差异与背景相比,分析差异表达基因与哪些生物学功能显著相关。该分析首先把所有差异表达基因向GO数据(http://www.geneontology.org/)的各个条目映射,计算每个条目的基因数目,利用超几何分布进行假设检验,得到富集结果的p-value,此时得到的p-value假阳性较高,利用BH多重假设检验对p-value进行校正可降低假阳性,校正后可得到Correctedp-Value,Correctedp-Value越低富集结果越显著。由GO富集分析可得,前五位的条目如下:myofibril、contractilefiber、musclesystemprocess、sarcomere、musclecontraction。图3.3E19时SMC组织差异表达mRNA的GOontology层次图选取差异分析中得到的差异表达基因,进行Pathway注释和富集。基于Pathway的分析有助于进一步了解基因的生物学功能。KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据差异基因所属不同类别,对差异基因进行分类并排序,取排名前20得到富集散点图(图3.4),前五位通路是Hypertrophiccardiomyopathy(HCM)、Cardiacmusclecontraction、Dilatedcardiomyopathy、Adrenergicsignalingincardiomyocytes、Neuroactiveligandreceptorinteraction。
【参考文献】:
期刊论文
[1]先天性肛门直肠畸形术后合并便秘患儿排便功能评定及病因探讨[J]. 杨中华,王大斌,刘丹,贾慧敏,白玉作,王维林,袁正伟. 临床小儿外科杂志. 2020(01)
[2]Long noncoding RNAs in neurodevelopment and Parkinson’s disease[J]. Ying Lyu,Lin Bai,Chuan Qin. Animal Models and Experimental Medicine. 2019(04)
[3]Wnt信号调控骨骼肌生长、发育与再生的机制[J]. 张宗明,金成龙,严会超,王修启. 动物营养学报. 2019(02)
[4]肛门直肠畸形术后排便功能的中期评估[J]. 吉耿锋,张志波. 中华小儿外科杂志. 2018 (12)
[5]长链非编码RNA在肌肉分化发育及疾病中的研究进展[J]. 贺健,王飞,张鹏,陈晓萍. 航天医学与医学工程. 2017(05)
[6]先天性肛门直肠畸形患儿母亲照顾体验的质性研究[J]. 刘晓然,胡丽君,刘丽,应本娟. 解放军护理杂志. 2016(23)
[7]先天性肛门直肠畸形的影像学检查[J]. 王刚. 发育医学电子杂志. 2016(01)
[8]肛管内超声及肛直肠测压在肛门闭锁术后肛门功能评估的意义[J]. 黄妍,金先庆,李晓庆,刘磊,袁亮,郭振华. 重庆医学. 2014(28)
[9]改良股薄肌移植联合生物反馈对肌源性肛门失禁患儿肛门节制的疗效[J]. 鲍俊涛,张书峰,王晓晖,王旭辉,孟庆磊. 广东医学. 2014(03)
[10]两种人工肛门括约肌节制排便效果的比较[J]. 肖钟,黄宗海,史福军,陈飞,郭雄波. 安徽医科大学学报. 2013(04)
博士论文
[1]肛门直肠畸形胎鼠腰骶髓发育异常机制及其宫内骨髓间充质干细胞移植修复的实验研究[D]. 杨中华.中国医科大学 2018
硕士论文
[1]基于无线经皮供能的反馈式人工肛门括约肌系统及实验研究[D]. 刘志强.上海交通大学 2014
本文编号:3539151
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