呼吸道感染住院儿童中HBoV1的流行情况及其基因突变与病毒载量关系研究

发布时间：2017-08-09 11:14

  本文关键词：呼吸道感染住院儿童中HBoV1的流行情况及其基因突变与病毒载量关系研究

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【摘要】：目的：研究人博卡病毒（HBoV1）在重庆地区呼吸道感染住院患儿中的流行情况，分析HBoV1病毒载量与病情相关关系；对HBoV1阳性样本进行基因测序，分析HBoV1基因突变与临床症状、病毒载量的关系。 方法：收集2009年6月至2011年5月因呼吸道感染（RTI）于重庆医科大学附属儿童医院呼吸科住院患儿的鼻咽抽吸物（NPA）标本，共846份。 Real-Time Quantitative PCR检测HBoV1，分析HBoV1病毒载量与临床症状之间的关系；对HBoV1阳性样本进行基因测序，分析基因突变与临床症状、病毒载量的关系。将HBoV1阳性样本扩增后测序获得的HBoV1临床株与st2株进行比对（GenBank acces sion no.DQ000496），序列比对使用MAGA5软件进行。实验数据应用SPSS17.0软件进行统计分析。 结果：846份NPA中，HBoV1阳性112例（13.2%），以夏季流行为主，主要感染6月-2岁患儿。病毒定量研究发现，高载量的HBoV1更容易引起肺炎与腹泻。对HBoV1阳性样本进行测序，，得到27个HBoV1全基因组序列，2个NS1基因序列，15个NP1基因序列和10个VP1/VP2基因序列，三个基因中分别发现23个、10个和43个突变位点。HBoV1基因突变与患儿的临床表现没有明显的统计学关系。在有NP1基因236位点（G236A）、447位点（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位点突变的样本中，病毒拷贝数明显低于未发生突变的样本。 结论： HBoV1主要感染6月至2岁儿童，在重庆地区夏季为HBoV1流行季节。高载量HBoV1更容易引起肺炎和腹泻。HBoV1基因突变与临床症状无明显关系，NP1基因236位点（G236A）、447位点（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位点突变可能影响病毒的复制。
【关键词】：呼吸道感染 人博卡病毒 基因突变 腹泻
【学位授予单位】：重庆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R725.6
【目录】：

• 英汉缩略语名词对照5-6
• 摘要6-8
• ABSTRACT8-11
• 前言11-13
• 第一部分 呼吸道感染住院儿童中 HBoV1 流行情况13-23
• 1 材料与方法13-18
• 1.1 研究对象13
• 1.2 主要仪器13
• 1.3 试验方法13-18
• 1.3.1 标本收集和处理13-14
• 1.3.2 病毒 DNA/RNA 提取14
• 1.3.3 制备 HBoV1 质粒 DNA14-17
• 1.3.4 Real-Time PCR 检测 HBoV117-18
• 1.3.5 HBoV1 阳性患儿临床特点及病毒定量分析18
• 2 研究结果18-20
• 2.1 人群特征及临床诊断18
• 2.2 HBoV1 流行情况18-19
• 2.3 HBoV1 病毒载量与临床表现19-20
• 3 讨论20-23
• 第二部分 呼吸道感染住院患儿 NPA 检出 HBoV1 基因突变与病毒载量相关关系23-31
• 1 材料与方法23-24
• 1.1 研究对象23
• 1.2 主要仪器23
• 1.3 试验方法23-24
• 1.3.1 PCR 扩增 HBoV123-24
• 1.3.2 序列结果分析24
• 2 研究结果24-28
• 2.1 NS1、NP1 和 VP1/VP2 的基因突变分析24-27
• 2.2 基因突变与病毒载量的关系分析27-28
• 3 讨论28-31
• 参考文献31-34
• 文献综述34-42
• 参考文献37-42
• 致谢42-43
• 攻读硕士学位期间发表文章及科研情况43-44

【参考文献】

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1 修文琼;刘光华;康玉兰;沈晓娜;谢剑锋;王美爱;张文清;郑奎城;;人博卡病毒全基因组序列测定与种系分析[J];中国人兽共患病学报;2010年02期

本文编号：644978