高通量测序分析乙肝疫苗接种失败儿童及母亲HBV全基因变异

发布时间：2017-08-22 22:37

  本文关键词：高通量测序分析乙肝疫苗接种失败儿童及母亲HBV全基因变异

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【摘要】：目的：探讨乙型肝炎病毒（HBV）母婴传播的特征，以及乙肝疫苗接种失败儿童及母亲HBV全基因变异情况。 方法:选择8对重庆地区乙肝疫苗接种失败的儿童及其慢性HBV携带母亲，从血清中提取HBV DNA，应用PCR方法扩增HBV感染母子对的HBV基因组全长，将HBV全基因组打断成小的片段，并通过PCR反应在每个样本的5’端加上特有的Barcode序列，胶回收250bp~500bp的目的片段。将胶回收产物进行solexa高通量测序，并对测序数据进行生物信息学和统计学分析。同时检测HBV感染母子对乙肝两对半、肝功能、HBV DNA等相关临床指标。 结果：（1）solexa测序平台对HBV基因组测序的数据利用率约为39%，在HBV序列的nt900，nt1800和nt2600附近区域的测序深度低于其他区域。（2）HBV感染母子对之间的HBV全长序列总相对香农熵（TRE）可明显聚类，非母子对之间不能聚类；母子对HBV序列同源性为99%-100%。（3）8对母子HBV基因型均为B+C混合型，其中6对优势基因型为B型，2对为C型，母子对优势基因型相同。（4）8例免疫失败儿童在HBV全基因组各区段均有多态性显著增高核苷酸位点，其中较集中的区域为HBV S区的nt200-300和nt700-800，Pre C区nt1814-1901，C区的nt1950-2100，P区的nt2650-2850。（5）所有儿童均在“a”决定簇存在多态性显著增高位点；8对母子中“a”决定簇区多态性显著增高的氨基酸位点共有10个，，仅存在于儿童的有1个为aa143，仅存在于母亲的有1个为aa124，发生优势氨基酸改变的位点有2个，分别为aa126位异亮氨酸突变为苏氨酸（I126T），和aa145位甘氨酸突变为精氨酸（G145R）。 结论：高通量测序技术可以检测HBV低频率变异，母婴宫内传播可能是儿童HBV感染的重要途径，是乙肝疫苗接种失败的重要原因，重庆地区HBV感染者以B型为主导，乙肝疫苗免疫失败儿童的HBV全基因组各区段均有多态性显著增高位点，“a”决定簇区多态性显著增高位点多数为母亲传播所致。
【关键词】：高通量测序 乙型肝炎病毒 母婴传播 变异 免疫接种
【学位授予单位】：重庆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R725.1
【目录】：

• 符号说明5-7
• 摘要7-9
• ABSTRACT9-11
• 前言11-13
• 1 材料与方法13-22
• 2 结果22-29
• 3 讨论29-32
• 全文总结32-33
• 参考文献33-35
• 文献综述35-44
• 参考文献40-44
• 致谢44-45

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 江南;罗红叶;曾丽蓉;邹榕;冯启明;苏启深;;广西某医学院校大学生乙肝防治知识知晓程度调查[J];广西医科大学学报;2014年05期

2 唐瑟,李运星,王德成;血中携带乙肝病毒孕妇及新生儿外周血和初乳中HBV DNA含量比较[J];四川医学;2005年05期

3 侯稳;王健;高克发;;HBV垂直传播途径细胞分子机制[J];现代预防医学;2007年05期

4 王健;高克发;侯稳;;乙型肝炎病毒母婴垂直传播及阻断的总结分析[J];中国妇幼保健;2007年20期

5 Mihaela Petrova;Victor Kamburov;;Breastfeeding and chronic HBV infection: Clinical and social implications[J];World Journal of Gastroenterology;2010年40期

6 王华钧,章文珍,邵国强;17909名婚检青年HBs Ag阳性率分析[J];浙江预防医学;2001年09期

7 黄琦敏;;2008—2012年南京市乙型病毒性肝炎流行病学分析[J];职业与健康;2014年07期

8 王宇;;中国乙型肝炎疫苗接种及其成效[J];中国疫苗和免疫;2014年02期

9 董蒲梅;李军;郭万申;徐谨;郭永豪;叶莹;;河南省1～14岁人群乙型肝炎疫苗接种率调查[J];现代预防医学;2014年08期

10 吴萍;刘波;余文周;;2013年媒体报道的乙型肝炎疫苗事件中公众质疑和应对[J];中国疫苗和免疫;2014年03期

中国博士学位论文全文数据库 前2条

1 牟瑞丽;乙型肝炎病毒母婴传播机制的分子生物学研究[D];山东大学;2004年

2 张磊;免疫预防乙型肝炎病毒母婴传播及乙肝疫苗接种效果的研究[D];武汉大学;2013年

本文编号：721495