胰岛因子1基因多态性与先天性心脏病的相关性研究

发布时间：2017-10-02 08:31

  本文关键词：胰岛因子1基因多态性与先天性心脏病的相关性研究

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【摘要】：目的： 探讨心脏发育相关基因胰岛因子1(Isletl, ISL1) SNP位点(rs41268421、 rs1017)与先天性心脏病(Congenital Heart Disease, CHD)的相关性,为阐明CHD的发生机制并进行遗传学干预提供理论依据,为其他先天畸形的研究提供科学的方法。 方法： 1利用NCBI网站SNPs数据库查找ISL1基因内部和周围所有SNPs,同时参考相关文献,确定所要研究的SNPs位点。 2采用病例-对照研究方法,选取2011年12月至2012年12月在天津市儿童医院心内科住院接受治疗的35名CHD患儿纳入本研究,其中男孩18例,女孩17例,男女之比为1.06：1,年龄7月至3岁,平均年龄23±6月。患儿均符合CHD的诊断标准,具有典型的临床症状,并经心脏彩色超声、心导管或手术证实,其中室间隔缺损类型患儿18例,房间隔缺损类型患儿17例。来自我院同期外科收治的除外CHD的30名儿童作为对照组,其中男孩15例,女孩15例,男女之比为1：1,年龄6月至3岁,平均年龄22±9月,经心脏彩色超声明确未患有CHD。采集所有研究对象的外周静脉血2ml,枸橼酸钠抗凝,于-80℃保存备用。 3基因测序并评价SNP位点和CHD的相关性。从血液中提取DNA,应用聚合酶链反应(PCR)联合直接基因测序技术对研究对象的ISL1基因SNPrs41268421、rs1017多态性进行检测。分别比较两个SNP位点基因型频率和等位基因频率在两组的分布情况,并进行单体型分析。 结果： 1ISLl基因SNP位点rs41268421存在GG、GT、TT3种基因型,CHD组携带T等位基因的基因型(包括GT和TT)频率与对照组相比具有明显的差异,差异显著(χ2=4.169,P0.05),并且CHD组携带T等位基因的基因型频率高于对照组。携带T等位基因的儿童患CHD的危险是G等位基因的4.833倍。 2ISL1基因SNP位点rsl017存在AA、AT、TT3种基因型,CHD组携带T等位基因的基因型(包括AT和TT)频率与对照组相比具有明显的差异,差异显著(χ2=6.807,P0.01),并且CHD组携带T等位基因的基因型频率高于对照组。携带T等位基因的儿童患CHD的危险是A等位基因的4.491倍。 3对ISL1基因SNPrs41268421、rs1017这两个位点单体型进行分析,共检出4种单体型,分别是GA、GT、TA、TT,其中表现TT单体型的儿童患CHD的危险度最高(OR=7.813)。 结论： 1ISL1基因SNP rs41268421、rs1017位点多态性可能与中国汉族儿童CHD易感性相关。 2ISL1基因SNPrs41268421位点等位基因T可能为中国汉族儿童患CHD的危险因素。 3ISL1基因SNPrs1017位点等位基因T可能增加中国汉族患儿童患CHD的危险性。 4对ISL1基因SNPrs41268421、rs1017两位点进行单体型分析,得出在这两个位点表现TT型的儿童具有较高的患先天性心脏病的风险。
【关键词】：先天性心脏病 ISL1基因 单核苷酸多态性 单体型 儿童
【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R725.4
【目录】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-10
• 缩略语/符号说明10-12
• 前言12-16
• 研究现状、成果12-14
• 研究目的、方法14-16
• 1 对象和方法16-27
• 1.1 研究对象16-17
• 1.2 实验原理17-19
• 1.2.1 PCR的基本原理17-18
• 1.2.2 单核苷酸多态性和单体型分析的原理18-19
• 1.3 主要仪器设备及实验试剂19-22
• 1.3.1 主要仪器设备19-20
• 1.3.2 主要实验试剂20-22
• 1.4 血液标本的采集和处理22
• 1.5 血液基因组DNA提取22
• 1.6 基因组DNA的鉴定22
• 1.7 引物准备22-23
• 1.8 PCR扩增23-24
• 1.9 2%琼脂糖凝胶电泳判断PCR产物24-25
• 1.10 质量控制25
• 1.11 PCR产物测序及测序图的分析25-26
• 1.12 统计学分析26-27
• 2 结果27-31
• 2.1 DNA质量的鉴定27
• 2.2 PCR扩增产物的鉴定27
• 2.3 病例组-对照组ISL1基因SNPrs41268421、rs1017测序结果27-29
• 2.4 统计结果29
• 2.4.1 Hardy-Weinberg平衡检验29-31
• 2.4.2 CHD病例组与对照组等位基因与基因型频率分布的比较29-30
• 2.4.3 单体型分析30-31
• 3 讨论31-37
• 3.1 简述先天性心脏病31-32
• 3.2 单核苷酸多态性的研究进展32-33
• 3.3 ISL1基因与先天性心脏病33-37
• 结论37-38
• 研究不足及展望38-39
• 参考文献39-43
• 发表论文和参加科研情况说明43-44
• 附录44-47
• 综述47-62
• 综述参考文献58-62
• 致谢62

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

1 陈新民;;先天性心脏病的病因-基因突变与染色体异常[J];中国全科医学;2006年16期

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本文编号：958577