染色体核型分析、荧光原位杂交及高通量测序用于检测流产绒毛染色体的研究

发布时间：2017-10-15 03:23

  本文关键词：染色体核型分析、荧光原位杂交及高通量测序用于检测流产绒毛染色体的研究

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【摘要】：目的比较染色体核型分析、荧光原位杂交、高通量测序三种方法检测流产绒毛染色体的成功率及异常核型检出率,探讨三种方法用于流产绒毛染色体检测的优势与局限性,为临床检测流产绒毛染色体的方法选择提供实验数据。方法收集2002年5月13日-2015年12月31日间因自然流产就诊于天津医科大学总医院产前诊断中心的307例患者,在知情同意情况下对其流产绒毛组织进行染色体检测,同时记录患者的基本信息,包括年龄、病史、夫妇双方染色体情况等。2002年5月13日-2010年9月28日,采用染色体核型分析技术对53例流产绒毛样本进行检测;在2010年9月29日-2013年1月31日间,采用荧光原位杂交技术对35例流产绒毛样本检测;在2013年2月1日-2015年12月31日间,采用高通量测序技术对219例流产绒毛样本检测。比较这三种方法检测成功率、异常核型检出率的差异,应用SPSS17.0软件进行统计学分析,p0.05有统计学意义。结果1.应用染色体核型分析技术检测53例流产绒毛样本,检测成功41例,检测成功率为77.35%(41/53)。检出染色体异常核型18例,占43.90%(18/41),检出正常核型23例,占56.10%(23/41)。异常核型包括常染色体核型异常15例,占异常核型的83.33%(15/18),其中数目异常12例,结构异常1例,数目及结构均异常1例,嵌合体1例。未检测出单独性染色体异常的样本。常染色体及性染色体均异常为3例,占16.67%(3/18)。所检出的异常核型涉及2、3、4、7、8、13、14、16、21、22号常染色体以及X,Y染色体,以22-三体最常见,共5例,占27.78%(5/18)。2.应用荧光原位杂交技术对35例流产绒毛样本的13、16、18、21、22号及性染色体进行检测,均检测成功,成功率为100%。检出异常核型11例,占所有受检者31.43%(11/35),检出正常核型24例,占68.57%(24/36)。异常核型分别为:21-三体4例,占36.36%(4/11);18-三体2例,占18.18%(2/11);16-三体、16-三体+22-三体、45,X/46,XY、三倍体及性染色体异常各1例,分别占9.09%(1/11)。3.应用高通量测序技术检测219例流产绒毛组织样本,检测成功194例,检测成功率为88.58%(194/219);检出异常核型109例,占56.19%(109/194),正常核型共76例,占39.18%(76/194)。异常核型中包括常染色体异常核型87例,占异常核型的79.82%(87/109),性染色体异常核型15例,占13.76%(15/109),常染色体及性染色体均异常6例,占5.50%(6/109)。常染色体异常核型包括数目异常66例,占75.86%(66/87),结构异常17例,19.54%(17/87),嵌合体4例,占4.60%(4/87)。性染色体异常核型包括45,X11例,结构异常1例,嵌合体3例。常染色体及性染色体均异常包括数目异常5例,结构异常1例。检出致病性已知的结构异常19例,占17.43%(19/109),涉及3、4、5、6、8、9、11、14、15、16、18、22号常染色体及性染色体,均为片段缺失和重复,缺失或重复的片段大小从0.22Mb-104.90Mb不等,其中10Mb以下的微缺失微重复占15例。异常核型中还包括1例单亲二倍体。在检出的微缺失微重复另有9例样本为致病性未知,占4.64%(9/194),涉及1、3、7、8、9、11及12号染色体。检测失败25例,占11.42%(25/219),其中7例因DNA降解,4例因测序背景高,14例因母源性污染。4.比较染色体核型分析技术、荧光原位杂交、高通量测序技术检测成功率差异,χ2=10.49,p0.05,异常率的差异有统计学意义。比较染色体核型分析技术、荧光原位杂交、高通量测序技术的异常核型的差异,χ2=8.28,p0.05,差异有统计学意义。结论1.三种方法中,荧光原位杂交技术检测流产绒毛染色体的成功率最高,其次是高通量测序技术,染色体核型分析技术的检测成功率最低。2.三种方法中,高通量测序技术检测流产绒毛染色体的异常检出率最高,染色体核型分析技术与荧光原位杂交技术的异常检出率无差异。3.高通量测序技术不仅能检测出常规的染色体数目及结构异常,而且能最小检测到200kb的染色体片段的微缺失和微重复。
【关键词】：流产绒毛染色体 染色体核型分析 荧光原位杂交 高通量测序技术
【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R714.5
【目录】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-10
• 缩略语/符号说明10-11
• 前言11-12
• 研究现状、成果11-12
• 研究目的、方法12
• 1.对象和方法12-19
• 1.1 应用染色体核型分析检测的研究对象12
• 1.2 应用荧光原位杂交检测FISH的研究对象12-13
• 1.3 应高通量测序技术的研究对象13
• 1.4 实验材料13-15
• 1.4.1 绒毛染色体核型分析所需要的试剂和仪器13-14
• 1.4.1.1 主要试剂13
• 1.4.1.2 主要试剂的配置方法13-14
• 1.4.1.3 主要仪器和设备14
• 1.4.2 FISH所需要的试剂和仪器14
• 1.4.2.1 主要试剂14
• 1.4.2.2 主要仪器和设备14
• 1.4.3 高通量测序所需要的试剂和仪器14-15
• 1.4.3.1 主要试剂14-15
• 1.4.3.2 主要仪器15
• 1.5 实验方法15-19
• 1.5.1 绒毛染色体核型分析的实验方法15-16
• 1.5.1.1 实验步骤15-16
• 1.5.1.2 染色体计数及核型分析16
• 1.5.2 FISH检测实验方法16
• 1.5.2.1 绒毛标本处理16
• 1.5.2.2 FISH检测16
• 1.5.3 高通量测序的实验方法16-19
• 1.5.3.1 标本采集16
• 1.5.3.3 DNA文库的构建16-18
• 1.5.3.4 DNA测序18
• 1.5.3.5 数据分析18-19
• 2 结果19-30
• 2.1 绒毛染色体核型分析的结果19-22
• 2.2 荧光原位杂交技术(FISH)检测绒毛染色体结果22-24
• 2.3 高通量测序检测绒毛染色体结果24-26
• 2.4 三种检测方法的比较26-27
• 2.4.1 三种方法检测成功率的比较26-27
• 2.4.2 三种方法异常核型检出率的比较27
• 2.5 夫妇双方染色体和胚胎染色体的关系27-30
• 3 讨论30-47
• 3.1 早期自然流产的原因30-31
• 3.2 绒毛染色体异常的原因31-32
• 3.3 绒毛染色体数目异常的发生机制32-35
• 3.4 绒毛染色体结构异常的发生机制35-39
• 3.5 绒毛染色体基因异常39
• 3.6 绒毛染色体核型分析技术39-41
• 3.7 荧光原位杂交技术41-43
• 3.8 高通量测序技术43-47
• 结论47-48
• 参考文献48-54
• 发表论文和参加科研情况说明54-55
• 综述 早孕期流产绒毛的检测技术55-65
• 综述参考文献61-65
• 致谢65-66
• 个人简历66

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本文编号：1034814