卵巢癌HELQ蛋白结构和功能的生物信息学工具分析预测

发布时间：2018-02-05 16:49

  本文关键词： 卵巢癌 HELQ基因 HELQ蛋白 三级结构 ATP依赖性解旋酶　出处：《山东医药》2017年35期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的预测卵巢癌抑癌基因HELQ编码蛋白(HELQ蛋白)的结构和功能。方法采用Ex PASy服务器中的工具分析HELQ蛋白的理化特征。分别采用PSORTⅡ和TMHMM预测HELQ蛋白的亚细胞定位和跨膜拓扑结构。采用Signal P 4.0预测HELQ蛋白的信号肽。采用Scan Prosite和SMART分析HELQ蛋白的功能结构域以及结构域分区。采用PSIPRED和I-TASSER预测HELQ蛋白的二级和三级结构以及配体结合位点。采用STRING10.0预测HELQ蛋白与其他蛋白的交互作用。结果 HELQ蛋白主要定位在细胞核(47.8%)和细胞质(39.1%)中,有4个保守结构域DEXDc、HELICc、HHH_5和PRK02362,并包含解旋酶ATP结合区和解旋酶C端结合区两个功能结构域;成功建立了HELQ蛋白的二级和三级结构模型,其中二级结构中α螺旋、无规则卷曲及折叠结构比例分别为54%、31%和6%。三维配体结构分析发现HELQ蛋白包含一个酶活性中心位点His341,催化Ile333、Lys335、Tyr337、Gln340、Pro360、Thr361、Ser362、Gly363、Gly364、Lys365、Thr366、Leu367、Glu464和Ala711等结合位点与配体ATP结合。交联蛋白质分析发现HELQ蛋白可能与RAD51、POLA1、PLON、FANCD2、DHX8等蛋白存在交互作用。结论 HELQ蛋白可能具有ATP依赖性解旋酶的结构和功能,参与DNA损伤的修复过程。
[Abstract]:Objective to predict the expression of ovarian cancer suppressor gene (HELQ) encoding protein HELQ. Structure and functions of the. The tools in PASy server are used to analyze the physical and chemical characteristics of HELQ protein. PSORT 鈪，

本文编号：1492351