子痫前期胎盘中差异表达的长链非编码RNA的研究

发布时间：2018-08-12 20:09

【摘要】：目的通过筛选及验证在子痫前期患者胎盘组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),探讨lncRNA与子痫前期的关系。方法收集18例子痫前期胎盘样本和同期出生的20例正常妊娠产儿胎盘样本,采用lncRNA芯片进行研究,筛选出差异表达的lncRNA及基因,采用国际通用的基因本体(GO)功能注释分析法和KEGG通路分析法,对差异表达基因进行功能注释与分析,并进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。结果检测到显著差异表达的lncRNA共有14个,其中表达上调的有9个,表达下调的有5个;检测到显著差异表达基因212个,表达上调的93个,表达下调的119个。对212个差异表达的基因进行GO功能注释分析,显示差异表达基因主要参与染色质结合、γ-谷氨酰转移酶的活性和SMAD结合等信号途径;KEGG通路分析结果显示,差异表达的基因包括细胞周期相关、补体和凝血级联反应相关、全身性红斑狼疮相关等与信号通路相关的作用基因。对显著差异表达的3个lncRNA:linc-ASCL1-3、linc-KLF6-2和linc-ROBO1-3进行qRT-PCR验证,其结果与lncRNA芯片检测结果相符。结论子痫前期的胎盘组织与正常胎盘组织相比,lncRNA表达谱发生了显著变化,可能与子痫前期的发生有关。
[Abstract]:Objective To investigate the relationship between long-stranded non-coding RNA (lncRNA) and preeclampsia by screening and validating the differentially expressed long-stranded non-coding RNA (lncRNA) in placenta of preeclampsia patients. And the genes were analyzed and annotated by the international gene ontology (GO) functional annotation analysis and KEGG pathway analysis, and verified by real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR). There were 212 differentially expressed genes, 93 up-regulated genes and 119 down-regulated genes. GO functional annotation analysis of 212 differentially expressed genes showed that the differentially expressed genes were mainly involved in chromatin binding, the activity of gamma-glutamyltransferase and the binding of SMAD; KEGG pathway analysis showed that differentially expressed gene packages were mainly involved in chromatin binding, gamma-glutamyltransferase activity and SMAD binding. The results of qRT-PCR were consistent with the results of lncRNA chip detection. Conclusion Preeclampsia placenta tissues and positive placenta tissues were found to be significantly differentially expressed by three lncRNA: linc-ASCL1-3, linc-KLF6-2 and linc-ROBO1-3. Compared with normal placenta, the expression profile of lncRNA has changed significantly, which may be related to the occurrence of preeclampsia.
【作者单位】： 南京医科大学附属苏州医院产科;胜利石油管理局锦苑卫生院;南京医科大学附属苏州医院新生儿科;
【基金】：江苏省自然科学基金资助项目(BK20131151) 苏州市临床诊疗技术专项基金资助项目(LCZX201308) 苏州市临床医学中心(SZZX201505) 苏州市产业技术创新专项基金资助项目(SYS2015104,SYS201568) 苏州市科教兴卫资助项目(KJXW2015022)
【分类号】：R714.244

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本文编号：2180225