基于孕妇血浆对胎儿父源性平衡易位遗传的无创产前检测技术初步研究

发布时间：2020-09-14 20:56

　　 平衡易位是目前最为常见的染色体结构异常,携带者大都无明显的异常表型直至出现不良孕产史,对携带者进行平衡易位精确断点检测,结合胎儿无创产前平衡易位检测可以在早期知道胎儿的遗传情况,具有重要的生育健康指导意义。目前临床主要通过有创伤的穿刺术进行产前检测,仍未有有效的无创伤性产前检测的临床手段。本研究主要使用高通量测序、生物信息学方法及针对游离DNA的分子检测手段尝试开发了基于孕妇血浆对胎儿父源性平衡易位遗传的无创产前检测技术。本研究以已知父亲为平衡易位携带者的家系样本为研究对象,使用高通量测序技术分析父亲平衡易位的精确断点信息,随后根据父亲的平衡易位断点设计适合于孕妇血浆胎儿游离DNA扩增的特异性引物进行扩增。并设立了一套平衡易位阳性模拟样本建立的方法,通过对不同胎儿浓度梯度的阳性模拟样本进行检测,确定检测的最低检出限。结合无创胎儿染色体非整倍体异常及染色体大片段缺失重复的检测,分析胎儿平衡易位遗传的情况,为平衡易位携带者家系提供孕早期的无创胎儿平衡易位遗传的指示。本研究收集了一例父亲为平衡易位携带者的家系作为研究对象。分别收集到孕妇孕早期和孕中期血浆进行无创胎儿染色体非整倍体异常检测并分析胎儿染色体大片段缺失、重复。随后根据丈夫的平衡易位断点设计适合于胎儿血浆游离DNA扩增的特异性引物,通过对不同胎儿浓度梯度的阳性模拟样本进行检测,确定检测的最低检出限可低至3.5%胎儿浓度。对孕妇血浆游离DNA进行特异性扩增,结合胎儿染色体数目异常结果进行分析胎儿平衡易位遗传情况,检测结果显示特异性扩增到与父亲相同的平衡易位片段,判定为平衡易位携带者。后续收集母亲经过羊水穿刺术的胎儿羊水细胞进行验证,与检测结果一致,验证了方法的可行性。本研究提出了一种无创检测胎儿父源性平衡易位的解决方案,在进行胎儿染色体非整倍体异常检测的同时进行平衡易位的检测,可操作性强,可辅助目前临床无创产前检测,为患者提供早期的临床指示。
【学位单位】：华南理工大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：R714.5
【部分图文】：

２．２样本ＤＮＡ制备与提取逡逑２．２．１邋基因组ＤＮＡ提取逡逑研究收集了平衡易位家系中父亲、母亲和一孩的外周血样本，使用ＱＩＡａｍｐＤＮＡ逡逑Ｂｌｏｏｄ邋Ｍｉｎｉ邋Ｋｉｔ邋（ＱＩＡＧＥＮ，Ｌｏｔ．邋１５１０４７４８０）提取试剂盒，按照试剂盒说明书进行外周血基逡逑因组ＤＮＡ提取，用于后续实验。实验流程如下，首先准备５６邋°Ｃ水浴锅、ＥＰ管、枪头、逡逑离心机等《在１．５邋ｍＬ离心管中加入２０邋ｐＬ蛋ｆｔ酶Ｋ邋（ＰｒｏｔｅｉｎａｓｅＫ），加入２００邋ｐＬ全血逡逑样本，随后加入２００逦Ｂｕｆｆｅｒ邋ＡＬ，使用混匀仪振荡１５秒，充分混匀后放置于５６邋°Ｃ水逡逑浴锅中进行裂解，释放出核酸。孵育１０分钟，随后简短离心，使管盖上的液体聚集回逡逑管底。加入２００邋ｐＬ无水乙醇，涡旋混匀１５秒后瞬时离心；小心将上步液体转移到ＱＩＡｍｐ逡逑Ｍｉｎｉ邋ｓｐｉｎ

本文编号：2818638