卵巢上皮性癌癌旁组织肿瘤相关差异表达蛋白的筛选
发布时间：2020-12-22 00:00
目的:对比分析卵巢上皮性癌组织、卵巢上皮性癌近端癌旁组织及正常卵巢组织差异表达蛋白,筛选出卵巢上皮性癌近端癌旁组织中肿瘤相关差异表达蛋白作为标志物,为卵巢癌术后卵巢组织自体移植及卵巢功能重建提供依据。方法:收集卵巢上皮性癌患者手术切除标本癌组织、近端癌旁组织及正常卵巢组织各6例,采用同位素标记的相对和绝对定量（iTRAQ）技术筛选不同组间的差异表达蛋白,结合功能注释及生物信息分析,筛选出卵巢上皮性癌近端癌旁组织肿瘤相关差异表达蛋白。结果:共鉴定出三组共同上调的蛋白有92个;与卵巢上皮性癌和正常卵巢组织相比,变化倍数均在2倍以上且在卵巢上皮性癌近端癌旁组织高表达的蛋白8个,其由6个基因编码:IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、HLF、TNC。结论:卵巢上皮性癌近端癌旁组织存在高表达的差异蛋白;筛选出的差异蛋白有可能成为安全筛选卵巢上皮性癌癌旁待移植组织的分子标志物。
【文章来源】：南华大学湖南省
【文章页数】：47 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
癌旁组织与正常卵巢组织间含量前30差异蛋白显著富集的GOterm统计
11图 2 癌旁组织与癌组织间含量前 30 的差异蛋白显著富集的 KEGG 通路统计3.2.3 差异表达蛋白质聚类分析聚类分析的目的是在相似性的基础上对数据进行分组、归类。因此在聚类分组的结果中，组内的数据模式有较高的相似性，而组间的数据模式差异明显。在聚类分析过程中，聚类算法会对样本（Sample）和变量（Variable，在蛋白质组学研究中通常指蛋白质的定量信息）两个维度进行分类。目标蛋白质的聚类分析结果可以帮助我们从蛋白质集合中筛选出具有相同表达模式的蛋白质子集合，具有相似表达模式的蛋白质可能具有类似的功能或者参与同一个生物学途径，或者
在通路中处于临近的调控位置。图 3 所示为癌旁组织与癌组织差异蛋白的聚类分析结果。图3 癌组织与癌旁组织差异蛋白聚类分析结果3.3 组间筛选出的差异表达蛋白的交叉分析同时与其他两组相比, 卵巢上皮癌近端癌旁组织鉴定出的高表达差异蛋白共92个，将差异倍数提高至2倍以上，得到8个差异表达蛋白,其蛋白序列号分别为：P04430、A0A075B6J9、V9HW68、A0A075B7B8、P24821、Q4LE33、S6C4S2、Q16534由6个基因编码：IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、TNC及HLF，详见表2。表 2 卵巢上皮癌近端癌旁组织与其他两组相比变化倍数 2 倍以上的差异表达蛋白蛋白序列号 基因名称癌旁组织/癌组织变化倍数癌旁组织/正常卵巢组织变化倍数P04430 IGKV1-16 3.470809793 4.202964652A0A075B6J9 IGLV2-18 3.027633851 3
【参考文献】：
期刊论文
[1]假基因及其生物学功能概述[J]. 付春鹏. 生物学教学. 2018(12)
[2]肝硬化合并门静脉血栓患者的差异蛋白筛选[J]. 熊静平,彭媛媛,张跃新. 临床肝胆病杂志. 2018(01)
[3]小分子干扰RNA抑制TNC基因的表达并逆转卵巢癌紫杉醇耐药[J]. 樊蓓,李红霞,吴玉梅,徐小红,邓小虹. 癌症进展. 2017(07)
[4]Tenascin-C表达与卵巢上皮性癌分化、浸润及转移的关系[J]. 刘睿敏,关慧,董立娜,牛悦婷,陈杰. 现代肿瘤医学. 2017(08)
[5]卵巢上皮性癌铂类耐药患者血清中耐药相关的差异表达蛋白质的筛选及其临床价值[J]. 吴文娟,王琪,张玮,李力. 中华妇产科杂志. 2016 (07)
[6]中国2010年卵巢癌发病与死亡分析[J]. 张爽爽,夏庆民,郑荣寿,陈万青. 中国肿瘤. 2016(03)
[7]肌腱蛋白C(Tenascin C)在组织纤维化中的研究进展[J]. 严敏骅. 健康之路. 2016(02)
[8]2006-2014年重庆市恶性肿瘤发病特征及趋势变化[J]. 丁贤彬,吕晓燕,毛德强,焦艳. 现代预防医学. 2016(03)
[9]沉默信号转导和转录活化因子（STAT3）对卵巢癌细胞SKOV-3中肌糖蛋白（TN-C）表达的影响[J]. 蒋艳,蒋荣英,刘洁冰. 现代肿瘤医学. 2016(04)
[10]非B细胞来源的免疫球蛋白促进肿瘤的发生和发展[J]. 邱晓彦. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2015(02)
硕士论文
[1]肌腱蛋白C在直肠癌及胃癌组织中的表达及其与临床分期分化之间的关系[D]. 赵寅生.安徽医科大学 2017
[2]免疫磁性微粒的制备及其在人血浆高丰度蛋白去除中的应用研究[D]. 胡佳.西北大学 2010
[3]卵巢癌中IgG表达的临床意义及应用RNAi技术阻断其表达的研究[D]. 姜海洋.山东大学 2005
本文编号：2930757
【文章来源】：南华大学湖南省
【文章页数】：47 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
癌旁组织与正常卵巢组织间含量前30差异蛋白显著富集的GOterm统计
11图 2 癌旁组织与癌组织间含量前 30 的差异蛋白显著富集的 KEGG 通路统计3.2.3 差异表达蛋白质聚类分析聚类分析的目的是在相似性的基础上对数据进行分组、归类。因此在聚类分组的结果中，组内的数据模式有较高的相似性，而组间的数据模式差异明显。在聚类分析过程中，聚类算法会对样本（Sample）和变量（Variable，在蛋白质组学研究中通常指蛋白质的定量信息）两个维度进行分类。目标蛋白质的聚类分析结果可以帮助我们从蛋白质集合中筛选出具有相同表达模式的蛋白质子集合，具有相似表达模式的蛋白质可能具有类似的功能或者参与同一个生物学途径，或者
在通路中处于临近的调控位置。图 3 所示为癌旁组织与癌组织差异蛋白的聚类分析结果。图3 癌组织与癌旁组织差异蛋白聚类分析结果3.3 组间筛选出的差异表达蛋白的交叉分析同时与其他两组相比, 卵巢上皮癌近端癌旁组织鉴定出的高表达差异蛋白共92个，将差异倍数提高至2倍以上，得到8个差异表达蛋白,其蛋白序列号分别为：P04430、A0A075B6J9、V9HW68、A0A075B7B8、P24821、Q4LE33、S6C4S2、Q16534由6个基因编码：IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、TNC及HLF，详见表2。表 2 卵巢上皮癌近端癌旁组织与其他两组相比变化倍数 2 倍以上的差异表达蛋白蛋白序列号 基因名称癌旁组织/癌组织变化倍数癌旁组织/正常卵巢组织变化倍数P04430 IGKV1-16 3.470809793 4.202964652A0A075B6J9 IGLV2-18 3.027633851 3
【参考文献】：
期刊论文
[1]假基因及其生物学功能概述[J]. 付春鹏. 生物学教学. 2018(12)
[2]肝硬化合并门静脉血栓患者的差异蛋白筛选[J]. 熊静平,彭媛媛,张跃新. 临床肝胆病杂志. 2018(01)
[3]小分子干扰RNA抑制TNC基因的表达并逆转卵巢癌紫杉醇耐药[J]. 樊蓓,李红霞,吴玉梅,徐小红,邓小虹. 癌症进展. 2017(07)
[4]Tenascin-C表达与卵巢上皮性癌分化、浸润及转移的关系[J]. 刘睿敏,关慧,董立娜,牛悦婷,陈杰. 现代肿瘤医学. 2017(08)
[5]卵巢上皮性癌铂类耐药患者血清中耐药相关的差异表达蛋白质的筛选及其临床价值[J]. 吴文娟,王琪,张玮,李力. 中华妇产科杂志. 2016 (07)
[6]中国2010年卵巢癌发病与死亡分析[J]. 张爽爽,夏庆民,郑荣寿,陈万青. 中国肿瘤. 2016(03)
[7]肌腱蛋白C(Tenascin C)在组织纤维化中的研究进展[J]. 严敏骅. 健康之路. 2016(02)
[8]2006-2014年重庆市恶性肿瘤发病特征及趋势变化[J]. 丁贤彬,吕晓燕,毛德强,焦艳. 现代预防医学. 2016(03)
[9]沉默信号转导和转录活化因子（STAT3）对卵巢癌细胞SKOV-3中肌糖蛋白（TN-C）表达的影响[J]. 蒋艳,蒋荣英,刘洁冰. 现代肿瘤医学. 2016(04)
[10]非B细胞来源的免疫球蛋白促进肿瘤的发生和发展[J]. 邱晓彦. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2015(02)
硕士论文
[1]肌腱蛋白C在直肠癌及胃癌组织中的表达及其与临床分期分化之间的关系[D]. 赵寅生.安徽医科大学 2017
[2]免疫磁性微粒的制备及其在人血浆高丰度蛋白去除中的应用研究[D]. 胡佳.西北大学 2010
[3]卵巢癌中IgG表达的临床意义及应用RNAi技术阻断其表达的研究[D]. 姜海洋.山东大学 2005
本文编号：2930757
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