人乳头状瘤病毒相关头颈部鳞状细胞癌关键基因及信号通路分析

发布时间：2020-12-23 04:10

　　目的探索人乳头状瘤病毒（human papilloma virus,HPV）阳性和阴性头颈部鳞状细胞癌（head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC）的差异表达基因及关键通路,为HPV相关HNSCC的诊断和治疗提供候选基因靶点。方法从美国国立生物技术信息中心（Gene Expression Omnibus,GEO）数据库中检索获得序号为GSE3292的HPV相关HNSCC表达谱芯片研究系列（其中HPV 阳性癌组织8例、阴性28例,含口腔癌15例、口咽癌9例、喉癌9例、下咽癌3例）,通过Gene-Cloud of Biotechnology Information（GCBI）分析平台筛选得到差异表达基因,运用DAVID数据库进行基因本体分析和信号通路富集分析。通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络后,利用Cytoscape软件筛选关键基因并进一步行信号通路富集分析,最后使用UALCAN数据分析工具检验关键基因在癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库中的表达差异性。结果从芯片检测的25 000多个基因中... 

【文章来源】：中华口腔医学杂志. 2020年08期 北大核心

【文章页数】：7 页


本文编号：2933044