长链非编码RNA MEG8(Rian)在胎盘发育中的功能及机制研究
发布时间:2021-01-20 17:49
【背景及目的】早期自然流产是妊娠常见不良结局之一,在临床确诊的妊娠中自然流产的发生率达15%左右,目前已知的造成自然流产的病因有很多,包括胚胎染色异常、感染、免疫缺陷等等;而其中仍然有约50%为以上是病因不明的自然流产。胎盘的正常发育是维持妊娠中胚胎存活和生长的必要条件之一,其生长和发育由一系列精密复杂的因素调控,当胎盘的生长发育中任一环节发生异常时常会导致妊娠相关疾病的发生。其中,滋养层细胞作为胎盘的主要组成部分,在胎盘发育过程中扮演重要角色,它参与了胚胎着床、启动胎盘形成、调控血管分化、内分泌以及免疫保护等过程,从而维持妊娠顺利进行。当滋养层细胞的发育或功能异常,则会导致胎盘的发育或功能的缺陷,引起早期妊娠失败等妊娠相关疾病的发生。因此,深入了解调控胎盘滋养层细胞的发育和功能的相关调节机制,阐明造成不明原因流产的因素以及可能参与不明原因流产发生的机制是非常有必要的,这将为解释妊娠相关疾病的发生提供重要理论支持。自lncRNA被发现以来,越来越多的研究证实长链非编码RNA通过不同的分子机制参与调控多种基本生物过程,例如X染色体激活,基因组印记,细胞分化与增殖,细胞迁移以及细胞凋亡等。...
【文章来源】:中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
lncRNA芯片结果
图 5.差异表达基因 STC 分析Figure5. Series Tests of Cluster analysis of differentially expressed genes. Each boxcorresponds to a model expression profile. And the colored profiles have a statistically significannumber of genes assigned (ordered by significance). The same color represents the same trend of thegene expression in the cluster. The fold line represents the gene expression trend, display the geneexpression change over time. In the box, the upper left number was the Profile number, the lower lefwas the P- value of number of genes assigned versus expected.如图所示,每个 Profile 集合包含表达模式相同的多个基因簇。共有 16 个 Profile模型用于描述这些差异表达基因的表达模式,图中每个方块表示一个基因集合,标有颜色的方块代表其差异具有显著意义(P<0.05),相同颜色代表相似表达趋势。其中lncRNAs 的 16 个 Profile 中共有 6 个具有差异显著性,包括下调表达基因集合簇 Profile2、3 和 7;上调表达基因集合簇 Profile 8、12 和 13。mRNAs 的 16 个 Profile 中有 7个有差异显著性,分别为下调表达基因集合簇 Profile 0、2、3 和 7;上调表达基因集合簇 Profile 8 和 13,以及一个表达先上升后下降的基因集合簇 Profile 9。
- 18 -图 2. GO 富集分析Figure2. GO Analysis of different expression genes during placental development. Geneontology (GO) terms for differentially expressed mRNAs during the mouse placental developmentwere analysis by the DAVID Bioinformatics Resources. The top 10 GO terms for mRNAsdifferentially expressed between the groups are shown. (a). The top ten GO terms of biologicalprocess(BP), Cellular Component(CC) and Molecular Function(MF) for upregulated genes. (b).The top ten GO terms of biological process(BP), Cellular Component(CC) and MolecularFunction(MF) for downregulated genes.如图所示,在上调差异表达的 mRNAs 中富集程度最高的前 5 个生物学功能(BP)分别是 oxidation-reduction process、acute-phase response、epoxygenase P450 pathway、metabolic process 和 lipid metabolic process;富集程度最高的前 5 个细胞组分(CC)条目
【参考文献】:
期刊论文
[1]印记基因:发育中的重要调节因子[J]. 吴瑜,冯旭,高岚,焦保卫. 遗传. 2016(06)
[2]长链非编码RNA HOTAIR调节PE滋养细胞功能的研究[J]. 邹艳芬,孙丽洲. 四川大学学报(医学版). 2015(01)
本文编号:2989493
【文章来源】:中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
lncRNA芯片结果
图 5.差异表达基因 STC 分析Figure5. Series Tests of Cluster analysis of differentially expressed genes. Each boxcorresponds to a model expression profile. And the colored profiles have a statistically significannumber of genes assigned (ordered by significance). The same color represents the same trend of thegene expression in the cluster. The fold line represents the gene expression trend, display the geneexpression change over time. In the box, the upper left number was the Profile number, the lower lefwas the P- value of number of genes assigned versus expected.如图所示,每个 Profile 集合包含表达模式相同的多个基因簇。共有 16 个 Profile模型用于描述这些差异表达基因的表达模式,图中每个方块表示一个基因集合,标有颜色的方块代表其差异具有显著意义(P<0.05),相同颜色代表相似表达趋势。其中lncRNAs 的 16 个 Profile 中共有 6 个具有差异显著性,包括下调表达基因集合簇 Profile2、3 和 7;上调表达基因集合簇 Profile 8、12 和 13。mRNAs 的 16 个 Profile 中有 7个有差异显著性,分别为下调表达基因集合簇 Profile 0、2、3 和 7;上调表达基因集合簇 Profile 8 和 13,以及一个表达先上升后下降的基因集合簇 Profile 9。
- 18 -图 2. GO 富集分析Figure2. GO Analysis of different expression genes during placental development. Geneontology (GO) terms for differentially expressed mRNAs during the mouse placental developmentwere analysis by the DAVID Bioinformatics Resources. The top 10 GO terms for mRNAsdifferentially expressed between the groups are shown. (a). The top ten GO terms of biologicalprocess(BP), Cellular Component(CC) and Molecular Function(MF) for upregulated genes. (b).The top ten GO terms of biological process(BP), Cellular Component(CC) and MolecularFunction(MF) for downregulated genes.如图所示,在上调差异表达的 mRNAs 中富集程度最高的前 5 个生物学功能(BP)分别是 oxidation-reduction process、acute-phase response、epoxygenase P450 pathway、metabolic process 和 lipid metabolic process;富集程度最高的前 5 个细胞组分(CC)条目
【参考文献】:
期刊论文
[1]印记基因:发育中的重要调节因子[J]. 吴瑜,冯旭,高岚,焦保卫. 遗传. 2016(06)
[2]长链非编码RNA HOTAIR调节PE滋养细胞功能的研究[J]. 邹艳芬,孙丽洲. 四川大学学报(医学版). 2015(01)
本文编号:2989493
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/fuchankeerkelunwen/2989493.html
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