基于蛋白芯片技术的多囊卵巢综合征患者卵泡液差异蛋白的研究

发布时间：2021-02-11 01:17

　　目的·运用蛋白芯片技术筛选多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome,PCOS）患者卵泡液的差异蛋白,为进一步的PCOS研究提供理论依据。方法·采用AAH-BLG-507芯片检测6例正常体质量指数PCOS患者和6例年龄、体质量指数匹配的非PCOS患者的卵泡液,筛选差异蛋白。采用功能注释分析、KEGG通路分析和蛋白互作网络分析方法对差异蛋白进行生物信息学分析。结果·与非PCOS患者相比,PCOS组患者卵泡液中表达上调蛋白25个,表达下调蛋白49个。根据分子功能分类,差异蛋白主要具有细胞因子活性和趋化因子活性。KEGG通路分析提示差异蛋白富集于细胞因子间受体相互作用和趋化因子信号通路。蛋白互作网络分析得到的核心蛋白主要为趋化因子及其受体。结论·运用蛋白芯片技术能够建立PCOS卵泡液差异表达蛋白谱,细胞因子间受体相互作用和趋化因子信号通路可能与PCOS的发病机制有关。 

【文章来源】：上海交通大学学报(医学版). 2020,40(08)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

卵泡液中差异蛋白的分类

对74个差异表达蛋白进行KEGG通路分析,结果显示,富集到的蛋白数最多的3条通路为细胞因子间受体相互作用通路(P=5.48×10-37)、趋化因子信号通路(P=1.27×10-12)和JAK-STAT信号通路(P=2.79×10-7)。图2展示了分别富集到36个蛋白(48.65%)和17个蛋白(22.97%)的细胞因子间受体相互作用通路和趋化因子信号通路。2.4 差异蛋白的PPI网络分析

运用STRING软件进行差异蛋白的PPI网络分析,并将结果在Cytoscape软件中进行可视化(图3)。使用cytoHubba插件对蛋白节点的度值进行排序,度值前10的核心蛋白从高到低分别为CCR7、CXCR3、CCR1、CXCR2、CXCR1、IL10、KNG1、IL4、CXCL11、CX3CL1(图4),其中CCR7、CCR1、CXCR2、CXCR1、IL10、KNG1、IL4、CXCL11在PCOS患者卵泡液中表达下调,CXCR3和CX3CL1表达上调(图3)。图4 蛋白互作网络中的核心蛋白


本文编号：3028283