癌症信息学研究:前列腺癌拷贝数目变异数据库与卵巢癌诊断标志物

发布时间：2021-03-12 22:23

　　癌症作为世界第二致死率的疾病,已经越来受到人们的重视。在中国,癌症已成为民众死亡的主要原因。癌症的早期诊断对于其治疗具有重要意义。随着现代医疗理念和技术的不断发展,以预测性（Predictive）、预防性（Preventive）、个性化（Personalized）、参与性（Participatory）为核心的P4医学理论被广泛认知。我们针对P4医学中的个性化和预测性医学进行了深入研究。其一,我们构建了有关前列腺癌拷贝数目变异数据库“CNVPC”,设计了基于LAMP技术的B/S构架下的web在线的前列腺癌拷贝数目变异数据库系统。该数据库中的数据来源于Pub Med的文献检索,我们会定期维护并更新数据。该数据库不仅具有自动统计功能,而且有检索功能,用户可以查询需要的信息并下载。这里,个性化医学着重体现在数据库中对每条变异数据信息都有相对应的样本信息、病人信息以及实验平台信息。其二,我们基于micro RNA-m RNA调控网络识别卵巢癌诊断的micro RNA生物标志物。Micro RNA是一类具有调节基因表达功能的非编码RNA,我们通过分析癌症患者和正常人群的micro RNA表达数据找... 

【文章来源】：苏州大学江苏省

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 P4医学理论
    1.2 本文研究
    1.3 本课题探究的目的和意义
第二章 个性化医学分析——前列腺癌拷贝数目变异数据库的构建
    2.1 前列腺癌的拷贝数目及其研究进展
        2.1.1 前列腺癌的拷贝数目的简介及其研究现状
        2.1.2 前列腺癌的拷贝数目变异的相关数据库
    2.2 前列腺癌的拷贝数据变异数据库
        2.2.1 引言
        2.2.2 开发工具介绍
        2.2.3 系统需求分析和设计
        2.2.4 数据结构
        2.2.5 详细设计和用户界面
    2.3 数据收集和统计分析
        2.3.1 数据来源和收集
        2.3.2 数据统计和分析
    2.4 前列腺癌拷贝数目变异生物信息学分析
    2.5 个性化医学分析
第三章 预测性医学分析——基于网络分析识别卵巢癌诊断的MicroRNA标志物
    3.1 引言
        3.1.1 卵巢癌的简介
        3.1.2 MicroRNA和生物标记物的简介及其研究意义
        3.1.3 富集分析的介绍
        3.1.4 流程框架
    3.2 卵巢癌MicroRNA的数据分析
        3.2.1 数据来源与数据收集
        3.2.2 miRNA-mRNA相互作用网络的构建
        3.2.3 MicroRNA的统计方法
    3.3 卵巢癌筛选结果分析
        3.3.1 已发表的作为卵巢癌的Biomarker的MicroRNA分析
        3.3.2 作为卵巢癌生物标记物的miRNA预测结果分析
        3.3.3 聚类分析
        3.3.4 结果预测性分析——ROC曲线分析
        3.3.5 结果富集分析
第四章 总结和展望
参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]microRNAs在卵巢癌的诊断和治疗中的意义[J]. 申志华,马秀梅,赵美荣.  疾病监测与控制. 2015(03)
[2]miRNA与卵巢癌关系的研究进展[J]. 朱爱萍,张洁,吴小华,于晓惠.  临床误诊误治. 2015(02)
[3]miRNA在卵巢癌发病机制研究中的现状与进展[J]. 崔开颖,杨舒盈,朱根海,王雁.  海南医学. 2013(16)
[4]卵巢癌诊断和治疗的现状及进展[J]. 覃利菊.  中外医学研究. 2013(19)
[5]网络大数据:现状与展望[J]. 王元卓,靳小龙,程学旗.  计算机学报. 2013(06)
[6]系统生物学在癌症预测、预防和个体化治疗中的潜在应用价值[J]. 陈恺,杜琰,曹广文.  解放军预防医学杂志. 2013(02)
[7]肿瘤标记物在卵巢癌诊断中的研究进展[J]. 陈立兰,狄文.  国际妇产科学杂志. 2012(04)
[8]PEDF在肿瘤中的研究进展[J]. 向江东,周莉娜,席晓薇.  现代肿瘤医学. 2011(04)
[9]表达谱芯片数据的基因功能富集分析[J]. 刘明,王米渠,丁维俊,毕锋.  生物医学工程学杂志. 2010(05)
[10]卵巢癌早期筛查的争议与展望[J]. 赵霞,钟茜.  西部医学. 2009(01)

硕士论文
[1]整合卵巢癌拷贝数变异和差异表达基因的生物信息学分析[D]. 邓祯祥.南方医科大学 2014



本文编号：3079084