宫颈癌遗传基因变异与放疗敏感性及预后的研究
发布时间:2021-03-28 15:41
宫颈癌在全球女性恶性肿瘤中的发病率排名第四,是女性癌症相关死亡的第二大主要原因。尽管近年来,各国逐渐完善了宫颈癌癌前病变系统性的筛查以及人们进行HPV疫苗的接种,但往往诊断时大多数已是中晚期。同步放化疗是局部晚期宫颈癌的标准治疗方案,部分宫颈癌患者表现出对辐射的抵抗,从而导致不良的预后,因此,如何提高宫颈癌放疗疗效,降低宫颈癌细胞放射抵抗性成为了如今研究的关键切入点。本研究将通过全外显子组测序对宫颈癌放疗敏感及预后相关基因进行分析研究。研究方法:(1)测序分析:筛选并收集2014年至2016年在四川省肿瘤医院进行根治性放化疗的宫颈鳞癌病例信息,经过根治性放化疗后3年内未复发的病例归为未复发组,即放射敏感组,反之,根治性放化疗后3年内局部复发的病例归为复发组,即非放射敏感组。然后通过其年龄,分期以及治疗前肿瘤大小进行一对一匹配。从中挑选匹配后的32例病例进行全外显子测序,根据测序结果对其进行一系列生物信息学分析及与预后相关联的分析,筛选与放射敏感性及预后相关的变异基因。(2)验证分析:根据测序及分析所得的结果利用独立样本对测序的结果进行验证分析。通过免疫组化分析,Sanger测序分析以及...
【文章来源】:电子科技大学四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
组织DNASNV与十大信号通路关联统计图
电子科技大学硕士学位论文16图2-332例组织DNA中TRIM64基因突变结果示意图图2-4组织DNA中组间SNV差异基因结果2.3.3基因拷贝数变异结果(CNV)为了清楚显示每个样品中差异基因的表达,使用R-pheat图对复发组和未复发组DNA中差异基因进行了聚类分析,结果显示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58个基因在复发组和未复发组间有显著差异(秩和检验,p<0.05)(见图2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在复发组发生拷贝数增加,且与未复发组有显著差异(Fisher检验,p<0.05)(见图2-6和图2-7)。图2-5差异基因表达热图
电子科技大学硕士学位论文16图2-332例组织DNA中TRIM64基因突变结果示意图图2-4组织DNA中组间SNV差异基因结果2.3.3基因拷贝数变异结果(CNV)为了清楚显示每个样品中差异基因的表达,使用R-pheat图对复发组和未复发组DNA中差异基因进行了聚类分析,结果显示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58个基因在复发组和未复发组间有显著差异(秩和检验,p<0.05)(见图2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在复发组发生拷贝数增加,且与未复发组有显著差异(Fisher检验,p<0.05)(见图2-6和图2-7)。图2-5差异基因表达热图
本文编号:3105816
【文章来源】:电子科技大学四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
组织DNASNV与十大信号通路关联统计图
电子科技大学硕士学位论文16图2-332例组织DNA中TRIM64基因突变结果示意图图2-4组织DNA中组间SNV差异基因结果2.3.3基因拷贝数变异结果(CNV)为了清楚显示每个样品中差异基因的表达,使用R-pheat图对复发组和未复发组DNA中差异基因进行了聚类分析,结果显示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58个基因在复发组和未复发组间有显著差异(秩和检验,p<0.05)(见图2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在复发组发生拷贝数增加,且与未复发组有显著差异(Fisher检验,p<0.05)(见图2-6和图2-7)。图2-5差异基因表达热图
电子科技大学硕士学位论文16图2-332例组织DNA中TRIM64基因突变结果示意图图2-4组织DNA中组间SNV差异基因结果2.3.3基因拷贝数变异结果(CNV)为了清楚显示每个样品中差异基因的表达,使用R-pheat图对复发组和未复发组DNA中差异基因进行了聚类分析,结果显示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58个基因在复发组和未复发组间有显著差异(秩和检验,p<0.05)(见图2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在复发组发生拷贝数增加,且与未复发组有显著差异(Fisher检验,p<0.05)(见图2-6和图2-7)。图2-5差异基因表达热图
本文编号:3105816
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