基于表达谱数据分析的卵巢癌标志物识别研究及机理分析

发布时间：2021-06-07 10:19

　　基于表达谱数据分析的卵巢癌标志物识别研究及机理分析卵巢癌（Ovarian Cancer）是最致命的妇科癌症,是世界女性癌症相关死亡的常见原因。由于早期症状隐匿和缺乏可靠的早期筛查手段,大多数卵巢癌患者在晚期诊断（III-IV期;国际妇产科联合会,FIGO）。鉴于癌症期别与癌症预后密切相关,对于晚期卵巢癌,预示预后不良。因此探索与卵巢癌期别相关的基因表达特征,发现卵巢癌进展中涉及的生物学机制,识别卵巢癌的有效生物标志物,以便能够评估和预测卵巢癌患者的临床结局是至关重要的。近年来,高通量测序技术在生物学领域正在被越来越广泛地使用,已被用作生命科学研究的非常重要的工具,为疾病的发现、早期干预及预后提供大量有价值数据。基于基因转录组数据,通过计算的方法可以进行精准识别癌症期别相关基因及评估预后。此次的研究是基于卵巢癌基因表达数据,采用生物信息学分析方法进行卵巢癌标志物的识别分析。本文共分5章,主要内容在第3、4章,具体工作如下:（1）卵巢癌期别相关的差异表达基因相互作用网络中预后相关基因的识别及分析研究目的（第3章）:基于TCGA数据库提供的卵巢癌转录组数据而进行,旨在从卵巢癌高通量测序数据中... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：98 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

本文主要工作简易流程图

第 2 章 科研背景、数据来源和相关方法介绍表达数据[60]。GEPIA 提供可定制的功能，如肿瘤与正常组织间差异表达分析症类型或病理分期进行分析，患者生存分析，类似基因检测，相关分析和降图示使用标准处理流程分析来自 TCGA 和 GTEx 项目的 9,736 个肿瘤和 8,587品的 RNA 测序表达数据：

3.1 本章提要识别与卵巢癌期别相关的差异表达基因和代表性生物标志物是非常重要的，这有助于检测卵巢癌发生进展的机制并同时评估卵巢癌患者的预后。本章研究作为对卵巢癌期别相关标志物及其中的预后基因进行识别研究，为卵巢癌早期诊治及预后评估提供了候选基因。本章的主要研究内容包括以下六个方面：（1）TCGA 数据库中卵巢癌期别相关的差异表达基因的计算筛选；（2）卵巢癌不同期别相关差异基因中核心基因的识别；（3）卵巢癌不同期别相关差异表达基因相互作用表达网络模块的构建及分析；（4）卵巢癌期别相关差异基因相互作用表达网络模块中不良预后基因的识别；（5）应用 GEO 数据库中卵巢癌测序数据进一步验证之前的筛选结果；（6）卵巢癌不良预后标志物候选基因的入尿检测预测。本章的主要流程如图 3.1 所示。

【参考文献】：
期刊论文
[1]Cancer bioinformatics:detection of chromatin states, SNP-containing motifs, and functional enrichment modules[J]. Xiaobo Zhou.  Chinese Journal of Cancer. 2013(04)



本文编号：3216396