MiR-203通过抑制VEGFA介导胎盘发育的机制研究

发布时间：2021-12-12 07:10

　　第一部分生物信息学方法比较正常及先兆子痫胎盘组织样本的基因表达谱血管发生和广泛的血管生成对于胎盘发育至关重要。先兆子痫（pre-eclampsia,PE）的发生是胎盘血管异常发育的结果之一。在本部分研究中,旨在通过比较正常发育情况下胎盘的基因表达谱及PE发生条件下的胎盘基因表达谱,从中找到在两者中具有共性的特征基因。从Gene Expression Omnibus数据库中下载不同孕龄的正常人胎盘（GSE9984）和先兆子痫人胎盘微阵列数据（GSE6573）的基因表达谱。差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）分析由GE02R进行。基因组富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）使用GSEA v3.0软件进行。TargetScanHuman数据库、miRTarBase数据库及mirRDB数据库用于分析可靠的miR-203作用靶基因。MiR-203与靶标基因的互作网络可视化由Cytoscape构建。比较两组基因表达谱后得到共同基因10个,包括LNPEP、AKNA、SLC9A7、VEGFA、FUT9、STRBP... 

【文章来源】：武汉大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：79 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．１?Ａ．．?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４数据集价值分布的箱形图；Ｂ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４中ＤＥＧｓ６令重??叠元素；Ｃ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４共同ＤＥＧｓ的热图??

１１１沁１＇〇１＾八５祀向数据库丁２巧＃保俯枺Γ保保保?郏保保保保蓿保薄ⅲ保保必?保倍。Τ觯常担都埃保保必?海保浚保?保常?钪辗直鹪げ猓崳?出ｍｉＲ－２０３的｜Ｅ标基因为９５３，３１１?及７１１?个（表１．１）。运用Ｄｒａｗ?Ｖｅｎｎ?Ｄｉａｇｒａｍ分别??对ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ及ｍｉｒＲＤＢ中的兀素进行比较，筛选三个数据??库均有重叠的特殊基因其３８个（图１．２Ａ＆表１．２）。最后在Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ中构建ｍｉＲ－２０３??与３８个重叠靶向基因的互作图（图１．２Ｂ）。??表１．１通过ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ和ｍｉｒＲＤＢ数据库预測ｍｉＲ－２０３的把向基因??名称?基因数目?可识别基因数目??Ｔａｒｇｅｔｓ?ｃａｎＨｕｍ?ａｎ?９５４?９５３??ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ?３１１?３１１??ｍｉｒＲＤＢ?７１１?７１１??总计基因数?１５８７???表１．２数据库预测ｍｉＲ－２０３的靶向基因的重叠基因???名称?总数?重叠基因名称??ＮＵＦＩＰ２?ＲＡＰ１Ａ?ＺＥＢ１?ＺＮＦ１４８?Ｓ０ＣＳ６?ＬＣＯＲ?ＩＬ２４?ＤＵＳＰ５??ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ?ＫＩＦ２ＡＮＦＹＡＲＡＰＧＥＦ１?ＡＢＣＥ１?ＳＬＣ３９Ａ９?ＢＣＬ７ＡＡＴ?

?ＭｉＲ－２０３通过抑制ＶＥＧＦＡ介导胎盘发育的机制研究???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＰＩ３Ｋ＿ＡＫＴ＿ＭＴ０Ｒ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?９８?－０．２１７０９??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＵＶ＿ＲＥＳＰＯＮＳＥ＿ＵＰ?１５０?－０．２６６３３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＥＰＩＴＨＥＬＩＡＬ＿ＭＥＳＥＮＣＨＹＭＡＬ＿ＴＲＡＮＳＩＴＩＯＮ?１９２?－０．３７６９１??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＰＯＰＴＯＳＩＳ?１５９?－０．２９７９３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＮＯＴＣＨ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?２９?－０．２６０７５???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＬＬＱＧＲＡＦＴ＿ＲＥＪＥＣＴＩＯＮ?１９１?－０．３４６１??ＥＳ：?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ｓｃｏｒｅｓ．??Ａ?Ｂ??

【参考文献】：
期刊论文
[1]胎盘发育过程中的表观遗传学改变及其相关疾病[J]. 刘福林,周瑾,张蔚,汪晖.  遗传. 2017(04)
[2]孕中期血绒毛膜促性腺激素水平异常改变与不良妊娠结局的关系[J]. 刘国成,谢文娟,张秀兰,俞秀美,姚焕春.  中华围产医学杂志. 2002(01)



本文编号：3536233