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子痫前期胎盘组织环状RNA表达谱的鉴定、验证与分析

发布时间:2021-12-15 20:38
  目的:描绘人胎盘组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达谱,发现并验证子痫前期胎盘组织异常表达的circRNA,研究分析其可能的调控网络。方法:利用高通量测序技术对子痫前期和正常胎盘组织中RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行差异性分析。然后利用qRT-PCR在组织水平上对分析结果进行验证。随后利用生物信息学对验证的差异性circRNA进行GO分析和KEGG通路分析。结果:测序结果显示,与正常胎盘组织相比,重度子痫前期胎盘共检测出300种异常表达的circRNA,包括151种高表达和149种低表达。qRT-PCR验证结果显示,hg38circ0014736 (1.418 0±0.106 5 vs. 1.044 0±0.127 1,P=0.035)和hsacirc0015382 (0.895 8±0.180 2 vs. 0.688 8±0.025 3,P=0.025)在子痫前期胎盘组织中高表达,hsacirc0007121... 

【文章来源】:重庆医科大学学报. 2020,45(05)北大核心CSCD

【文章页数】:7 页

【部分图文】:

子痫前期胎盘组织环状RNA表达谱的鉴定、验证与分析


circRNA在子痫前期和正常胎盘组织中的表达

胎盘,子痫,生物信息学,差异性


差异性circRNA在胎盘组织中表达水平验证实验(n=12)

序列,生物信息学,子痫


本研究通过生物信息学分析还发现hsa_circ_0007121、hsa_circ_0015382和hg38_circ_0014736序列中含有一个甚至多个某一miRNA的结合位点。已有的研究表明circRNA可通过结合位点与miRNA结合,可作为一种天然的、内源性的miRNA海绵[8],抑制其对下游靶基因的调控作用,从而参与对细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等功能的调控[5-7,12-13,15]。基于竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)学说[23]的理论和以上研究,推测这3种差异circRNA也可能吸附某些特定的miRNA,进而参与子痫前期的发病。而在本研究预测的可能吸附的miRNA中,miR-21在子痫前期和胎儿宫内生长受限的胎盘组织中表达上调,且跟血管阻力增高相关[24]。此外,miR-101也被发现在调控子痫前期滋养细胞凋亡方面起重要作用[25]。虽然其他预测的miRNA是否跟子痫前期发病相关尚需进一步研究,但GO分析显示受这些miRNA调控的基因跟转录后调节、增殖、缺氧应激有关。与此同时,跟子痫前期发病密切相关的通路包括Wnt信号通路[26]、HIF-1信号通路[27]及凋亡通路[28],在KEGG信号通路富集分析的结果中也出现明显富集现象,以上结果均提示hsa_circ_0007121、hsa_circ_0015382和hg38_circ_0014736可能在子痫前期的发病机制中起重要作用。综上所述,鉴于circRNA在其他疾病所起的作用及生物信息学分析结果,本研究在子痫前期胎盘中检测并验证的差异circRNA可能参与了子痫前期的发病,并有望成为新的干预靶点。这一推测有待后续细胞功能实验和动物实验来进一步验证。


本文编号:3537108

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