PI3K在妊娠期糖尿病发病机制中的作用生物信息分析及验证

发布时间：2022-01-13 12:40

　　目的利用大数据生物信息挖掘算法探讨妊娠期糖尿病（gestational diabetes mellitus,GDM）发病相关基因及其可能生物学功能在GDM发病机制中的作用。方法首先检索基因表达数据库,筛选并下载GDM差异表达芯片数据,采用R软件Lima包对差异表达基因进行筛选（Log2FC>1; P<0.05）;对筛选出的差异表达基因进行功能富集分析。采用数据库STRING构建GDM发病机制蛋白-蛋白相互作用网络,分析差异表达基因编码蛋白间的相互作用关系。利用Cytohubb软件进一步筛选信号通路中关键基因（hub基因）;同时选取30例GDM患者和30名正常分娩孕妇为研究对象,采用免疫组化方法对关键基因编码蛋白在GDM患者胎盘组织及正常妊娠产妇胎盘组织中的表达水平进行检测。结果 2个数据集GSE51546和GSE87295纳入本次分析,2个数据集中共差异表达基因4个[TACSTD2,磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K）,COLEC12和IGFBP6]。差异表达基因蛋白主要位于细胞质和细胞接合器,主要分子功能为磷酸转移酶... 

【文章来源】：转化医学杂志. 2020,9(05)

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

差异表达基因筛选

筛选出的4个差异表达基因的聚类热图

筛选出的4个差异表达基因编码蛋白-蛋白相互作用网络(图3)显示，整个网络中54个蛋白节点，共574个相互作用链接，平均连接度为21.3，聚集度为0.74。2.5 GDM蛋白-蛋白互作网络关键基因筛选

【参考文献】：
期刊论文
[1]血清镁与妊娠糖尿病胰岛素抵抗的关系[J]. 李明,牛秀敏.  现代妇产科进展. 2010(02)



本文编号：3586442