宫颈癌细胞株HeLa与正常宫颈细胞株Ect1/E6E7的微小RNA表达谱的差异
发布时间:2022-12-09 03:10
目的探讨宫颈癌细胞株HeLa与正常宫颈细胞株Ect1/E6E7中微小RNA(miRNA)分子表达谱的差异。方法选取HeLa细胞和Ect1/E6E7细胞各3个样本分别作为实验组和对照组,采用miRNA芯片筛选两者之间差异表达的miRNA,样品间表达变化标准以上/下调4倍作为阈值范围,并运用miRWalk软件预测差异表达miRNA可能调控的靶基因,并对这些靶基因进行信号通路的富集分析。结果在HeLa细胞中,上调超过4倍差异表达miRNA分子7个,下调超过4倍差异表达miRNA分子16个(P<0.01)。生物信息学分析发现hsa-miR-126-3p的靶基因在肿瘤通路、凋亡通路以及Wnt信号通路上出现聚集;而hsa-miR-25-5p的靶基因肿瘤通路和钙离子信号通路出现聚集;且hsa-miR-205-5p靶基因在TGF-β信号通路和EGFR信号通路出现聚集。结论宫颈癌细胞HeLa与正常宫颈细胞Ect1/E6E7之间存在差异表达miRNA分子,他们可能参与宫颈癌的发生发展机制。
【文章页数】:4 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1材料
1.2方法
1.2.1细胞培养
1.2.2总RNA提取与浓度和质量检测
1.2.3荧光标记与ELISA质控
1.2.4 miRNA芯片检测及信号分析
1.2.5 qRT-PCR验证差异表达miRNA
1.2.6靶基因生物信息学分析
1.3统计学分析
2 结果
2.1 miRNA芯片样品总RNA的质量鉴定结果
2.2 miRNA在He La细胞和Ect1/E6E7细胞中的表达
2.5 qRT-PCR验证结果
2.6 hsa-miR-126-3p、has-miR-25-5p和hsa-miR-205-5p靶基因生物信息学预测
3 讨论
本文编号:3714698
【文章页数】:4 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1材料
1.2方法
1.2.1细胞培养
1.2.2总RNA提取与浓度和质量检测
1.2.3荧光标记与ELISA质控
1.2.4 miRNA芯片检测及信号分析
1.2.5 qRT-PCR验证差异表达miRNA
1.2.6靶基因生物信息学分析
1.3统计学分析
2 结果
2.1 miRNA芯片样品总RNA的质量鉴定结果
2.2 miRNA在He La细胞和Ect1/E6E7细胞中的表达
2.5 qRT-PCR验证结果
2.6 hsa-miR-126-3p、has-miR-25-5p和hsa-miR-205-5p靶基因生物信息学预测
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