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子痫前期外周血及胎盘miRNA差异表达谱与生物信息分析

发布时间:2024-03-01 03:55
  目的通过高通量测序技术筛选子痫前期孕妇外周血及胎盘组织中的microRNA,运用生物信息学的分析方法,精确比较样本间microRNA差异表达谱,选择显著差异的miRNA进行靶基因预测,分析功能类别以及基因与相应基因本体(GO)之间的关联。着重分析靶基因的功能分布,确定差异miRNA在子痫前期疾病中的生物学功能。方法1)收集2017年1月至2017年12月在四川省人民医院分娩的年龄、产次相匹配的正常妊娠及子痫前期孕妇外周血、胎盘各3例,共12例,形成正常与疾病对照组。2)从收集的全血中分离血清,提取总RNA后分别连接5’接头和3’接头,进行PCR扩增,凝胶电泳法获取片段在18-40nt左右的cDNA文库;使用Illumina HiSeqTM 2500进行高通量测序,初步过滤数据,得到干净序列(clean reads),对其分布及共有序列进行统计、分类注释,获得样本所含各类sRNA的组分和表达量信息。3)将所得的测序数据与miRNA生物信息数据库(miRBase数据库(version 21))比对,获取miRNA的表达信息:长度、结构、表达水平等,计算其表达量。4)判...

【文章页数】:68 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
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中英文缩略词表
第一章 绪论
第二章 子痫前期血清MIRNA差异表达谱的筛选
    2.1 材料和方法
    2.2 结果
    2.3 讨论
第三章 子痫前期胎盘组织MIRNA差异表达谱的筛选
    3.1 材料和实验方法
    3.2 结果
    3.3 讨论
第四章 子痫前期血清及胎盘差异MIRNA生物信息学分析
    4.1 实验方法
    4.2 结果
    4.3 讨论
全文讨论
综述
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间发表文章



本文编号:3915401

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