新疆汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因多态性与肺结核易感相关性研究

发布时间：2017-09-02 14:18

  本文关键词：新疆汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因多态性与肺结核易感相关性研究

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【摘要】：目的:本研究通过PCR-SBT法对新疆汉族肺结核患者和健康人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1进行等位基因分型,揭示新疆汉族HLA-DRB1、DQB1、DPB1的基因多态性,阐明HLA-DRB1、DQB1、DPB1与肺结核发生的相关性。方法:采用聚合酶链反应-直接测序基因分型(Sequence-Based Typing,SBT),分别对92例新疆汉族肺结核患者与96例新疆汉族随机健康对照者的HLA-DRB1、DQB1、DPB1等位基因分型,使用Arlequin 3.15软件,以最大似然法(Maximum-Likelihood)计算Hardy-Weinberg平衡、各位点等位基因频率、单倍型频率。组间比较采用卡方(χ2)检验,OR值和95%的置信区间用于患肺结核风险的评价。结果:1.病例组和对照组人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1三位点均通过Hardy-Weinberg平衡检验。2.在两组人群中分别检出HLA-DRB1等位基因30个和29个,其中HLA-DRB1*07:01在病例组中的频率显著高于对照组(15.8%vs8.3%,OR=2.058,P=0.027),差异有统计学意义。3.在两组人群中分别检出HLA-DQB1等位基因16个和29个,其中HLA-DQB1*03:01在病例组中的频率显著高于对照组(28.3%vs13.5%,OR=2.515,P=0.0004),差异有统计学意义;与对照组相比,病例组HLA-DQB1*03:03频率明显增高,但差异无统计学意义(P=0.053)。4.在两组人群中分别检出HLA-DPB1等位基因12个和16个,其中HLA-DPB1*05:01(37.5%vs28.1%,OR=1.554,P=0.049)在病例组中的频率显著高于对照组,差异有统计学意义;HLA-DPB1*02:01(16.8%vs27.6%,OR=0.552,P=0.010)在对照组中频率显著高于病例组,差异有统计学意义。5.在两组人群中分别检出DRB1-DQB1单倍型43个和98个,其中DRB1*07:01-DQB1*02:02(10.9%vs 4.7%,OR=2.480,P=0.025)和DRB1*09:01-DQB1*03:03(10.9%vs 5.2%,,OR=2.220,P=0.043)在病例组的频率显著高于对照组,两组差异有统计学意义。6.在两组人群中分别检出DRB1-DPB1单倍型76个和81个,两组人群间单此倍型频率无统计学差异。7.在两组人群中分别检出DQB1-DPB1单倍型56个和83个,其中DQB1*03:01-DPB1*05:01(15.8%vs 7.5%,OR=2.379,P=0.010)和DQB1*03:03-DPB1*05:01(19.8%vs 2.3%,OR=4.055,P=0.004)在病例组的频率显著高于对照组,两组差异有统计学意义。8.在两组人群中分别检出DRB1-DQB1-DPB1单倍型86个和135个,其中DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01(5.4%vs 1%,OR=5.869,P=0.015)和DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01(8.7%vs 1.6%,OR=9.964,P=0.002)在病例组的频率显著高于对照组,两组差异有统计学意义。结论:1.HLA-DRB1、DQB1、DPB1在新疆汉族中存在较为丰富的多态性。2.HLA-DRB1*07:01、HLA-DQB1*03:01可能是新疆汉族肺结核患者的易感基因,HLA-DPB1*02:01可能是新疆汉族肺结核患者的保护性基因,HLA-DPB1*05:01是否为新疆汉族肺结核患者的易感基因有待加大样本量进一步确认;DRB1*07:01-DQB1*02:02、DRB1*09:01-DQB1*03:03、DQB1*03:01-DPB1*05:01、DQB1*03:03-DPB1*05:01、DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01和DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01可能是新疆汉族肺结核患者的易感单倍型。
【关键词】：白细胞分化抗原 肺结核 等位基因 单倍型
【学位授予单位】：石河子大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R521
【目录】：

• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 英文缩略词9-10
• 前言10-13
• 材料与方法13-20
• 1 材料13
• 1.1 主要试剂13
• 1.2 主要实验仪器设备13
• 2 方法13-18
• 2.1 研究对象及临床资料13-14
• 2.1.1 肺结核病例组13-14
• 2.1.2 健康对照组14
• 2.2 实验方法14-18
• 2.2.1 标本的处理和保存14
• 2.2.2 DNA的提取与检测14-15
• 2.2.3 HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因分型15-18
• 3 统计学分析18
• 4 技术路线18-20
• 结果20-31
• 1 PCR实验结果20
• 2 PCR产物的DNA测序结果20-22
• 3 病例组与对照组的HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1三位点平衡检验22-23
• 4 等位基因频率的分布及比较23-26
• 5 单倍型频率的分布及比较26-31
• 讨论31-35
• 结论35-36
• 参考文献36-40
• 文献综述40-45
• 参考文献43-45
• 致谢45-46
• 附录一46-47
• 作者简介47-48
• 导师评阅表48

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本文编号：779056