寨卡病毒包膜蛋白糖环缺失的生物学效应研究
【图文】:
2.2 方法2.2.1 系统发育分析从 Genbank 获取寨卡病毒全长基因组序列,,利用 MEGA7 对基因组进行核苷酸序列比对和系统发育分析。生物系统发生树采用最大似然法计算,核苷酸替代模型采用 GTR+G+I,循环次数执行 1000 次。2.2.2 克隆的构建为构建含有 E 蛋白糖环缺失的寨卡病毒突变体质粒,首先采用融合 PCR 的方法获得带有突变位点的 DNA 片段。然后利用 AvrII/NotI 双酶切体系将带有突变位点的 DNA 片段切下,与同样双酶切的寨卡病毒(FSS13025)全长感染性克隆质粒连接,从而获得含有糖环缺失的寨卡病毒突变体质粒。构建的突变质粒分别包括 E蛋白糖环内缺失 4 个和 6 个氨基酸序列。突变质粒的构建示意图如图 1-1 所示。融合 PCR 引物序列如表 1-2 所示。
图 1-2 寨卡病毒的亚洲和非洲世系中均存在糖环缺失 1-2 Glycan loop deletions are present in both Asian and African lineages of Z缺失寨卡病毒的系统发育分析 MEGA7 采用最大似然法建立生物系统发生树,核苷酸替代I,E 蛋白存在糖环缺失的非洲株和亚洲株分别用黄色和绿色突系统进化树上可以看出,寨卡病毒分为非洲和亚洲两个世系,其分为两个亚支,即亚洲本土株和美洲及太平洋流行株。从图中环缺失株主要分布在寨卡病毒非洲世系,在 1947 年,1963 年 1997 年共分离到 10 株含有糖环缺失的寨卡病毒株(其中一株组序列,其余 9 株含有寨卡病毒全长基因组序列),含有糖环缺分散在非洲世系的不同进化分支中,说明糖环缺失的独立出现 月从韩国分离的两株寨卡病毒株在 E 蛋白糖环区域存在氨基酸
【学位授予单位】:安徽医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R373
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本文编号:2632964
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