piRNA疾病关联数据库及自然衰老不同脑区RNA表达的性别二态性

发布时间：2020-09-17 20:05

　　 PIWI蛋白相互作用RNA(piRNAs),是一种特异的小非编码RNA亚类,2006年首次在果蝇黑色素生殖细胞中被发现。这类RNA的长度约24-31个核苷酸,其特征是5'端是U(尿苷),3'端有2'-O-甲基修饰,第10号位置是A(腺苷),并能够结合特定类别的PIWI家族蛋白。自它们在生殖细胞中发现以来,人们发现piRNA的功能特异性限定于生殖细胞中,能够维持生殖细胞的基因组完整性和结构,尤以在精子发生,排卵过程和早期发育过程中为甚。近些年高通量测序方法(small RNA-seq等)的发展揭示了piRNA在体细胞中也有表达,其表达和功能具有时空特异性。除体细胞之外,piRNA还在发育过程的表观遗传调控中发挥重要的作用。近些年许多疾病相关的研究表明,piRNA能够调控疾病相关的关键基因而发挥重要的作用,与疾病的预后密切相关。目前有一些可用的piRNAs集群的数据库,例如pirnabank,piRNAQuest,piRbase,它们提供了 piRNA在各种生物体中的序列和位置信息,但是还没有与疾病关联的piRNA数据库。因此我们手动收集了文献报道过的疾病相关的piRNA信息,进行审阅,筛选,整理,同步化和分类,从而建立一个基于piRNAs与疾病间联系的新型综合数据库。性别二态性一直是一个亟待解决的问题,1980年的早期研究以表型和生理学方法为基础,发现两性之间存在明显的性别差异。近年来,基因型方法结合高通量方法进一步揭示了与性偏倚基因相关的机制。但性别二态性与衰老有关的性偏倚研究仍然有限,因此我们检测了4个年老和年轻小鼠的嗅球(OB),下丘脑(HT),海马(HC)和小脑(CB),对雄性和雌性中差异表达的mRNA和lncRNA的表达量进行了分析。我们观察到雄性小鼠OB中的mRNAs和lncRNAs的M/F性别偏倚比显著高于雌性,而在其他三个脑区HT,HC和CB中,雌性小鼠的性别偏倚比偏高。后期的表达偏倚,GO,进化和共表达网络分析也进一步揭示了在雄性和雌性小鼠不同脑区中mRNA和lncRNA的表达存在明显的性别二态性。
【学位单位】：中国科学技术大学
【学位级别】：博士
【学位年份】：2019
【中图分类】：R346

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本文编号：2821169