中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征
发布时间:2021-02-01 23:31
目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。荚膜基因簇存在基因反转现象。结论 Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。
【文章来源】:疾病监测. 2020,35(06)
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
基因两侧标注断点位置图2脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇重组事件示意图Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrainsD′区的cps
321565299.5注:a.参考菌株FAM18的2个重复区分别位于全基因组的56138~59432bp和74789~78083bp;b.重复区间序列差异分别为100.0%和62.7%;c.重复区间序列差异分别为30.8%、52.3%和31.5%注:黑色粗线表示参与重组的序列,黑色框代表参与重组的基因,基因两侧标注断点位置图2脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇重组事件示意图Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrains注:黄色表示B区基因,蓝色表示其他区基因,绿色表示cps侧翼基因图3脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇及附近基因排布Figure3GenearrayofthecpsandflankingsequenceofN.meningitidisstrains疾病监测2020年6月30日第35卷第6期DISEASESURVEILLANCE,June30,2020,Vol.35,No.6511www.jbjc.orgDOI:10.3784/j.issn.1003–9961.2020.06.011
本文编号:3013627
【文章来源】:疾病监测. 2020,35(06)
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
基因两侧标注断点位置图2脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇重组事件示意图Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrainsD′区的cps
321565299.5注:a.参考菌株FAM18的2个重复区分别位于全基因组的56138~59432bp和74789~78083bp;b.重复区间序列差异分别为100.0%和62.7%;c.重复区间序列差异分别为30.8%、52.3%和31.5%注:黑色粗线表示参与重组的序列,黑色框代表参与重组的基因,基因两侧标注断点位置图2脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇重组事件示意图Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrains注:黄色表示B区基因,蓝色表示其他区基因,绿色表示cps侧翼基因图3脑膜炎奈瑟菌荚膜基因簇及附近基因排布Figure3GenearrayofthecpsandflankingsequenceofN.meningitidisstrains疾病监测2020年6月30日第35卷第6期DISEASESURVEILLANCE,June30,2020,Vol.35,No.6511www.jbjc.orgDOI:10.3784/j.issn.1003–9961.2020.06.011
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