一株H3N2亚型流感病毒株的全基因序列测定及其分子特征分析

发布时间：2021-04-03 19:09

　　目的了解1株人流感H3N2毒株的全基因组序列特征、遗传进化及生物学特性。方法对浙江省丽水市分离的1株H3N2流感毒株进行全基因组测序,从美国国立生物信息中心（NCBI）和全球倡议分享流感数据库（GISAD）获取其他流感毒株基因组全序列,通过BioEdit7.0.9将该毒株8节段基因与其他序列比对,MEGA7.0软件邻接法构建进化树,并全面分析该毒株的进化、致病力和抗原性等特征。结果测序得到该毒株为人流感分离株A/Homo sapien/China/LS340/2019（H3N2）株（LS340）,LS340为典型的季节性人流感病毒,血凝素基因属于3C.2a1进化分支,具备人际传播能力,部分位点呈现高传播性和高致病性特征,对金刚烷胺耐药。与当季推荐疫苗株相比,抗原区出现涉及A、B两个表位3个位点突变。结论 LS340未出现重组、缺失等较大变异,但与当季推荐疫苗株相比已经发生抗原漂变,应及时更新疫苗,同时加强此类病毒变异监测,防止流感大流行发生。 

【文章来源】：国际流行病学传染病学杂志. 2020,47(04)

【文章页数】：5 页

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3116915