小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化的转录组学分析
发布时间:2021-06-21 04:59
目的探讨小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化(EMT)的机制。方法将小鼠肾小球足细胞分为4组:正糖组(5.5 mmol/L D-葡萄糖)、高糖组(30 mmol/L D-葡萄糖)、记忆组(先30 mmol/L D-葡萄糖,后5.5 mmol/L D-葡萄糖)、渗透压组(5.5 mmol/LD-葡萄糖+24.5 mmol/L甘露醇),除记忆组作用96 h外,其余组均作用48 h。Western blotting及免疫荧光检测各组足细胞EMT指标肾病蛋白(Nephrin)及α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的表达。采用Illumina HiSeq 2000进行正糖组、高糖组及记忆组的转录组测序,DESeq鉴定差异表达基因,并对差异表达基因进行GO及KEGG富集分析。最后采用实时荧光定量PCR检测差异表达基因的表达。结果与正糖组相比,Western blotting与免疫荧光检测均显示高糖组与记忆组的足细胞Nephrin表达减少、α-SMA表达增加(P<0.05),而渗透压组与正糖组,记忆组与高糖组足细胞Nephrin、α-SMA的表达差异无统计学意义(P>0.05)。RNA...
【文章来源】:解放军医学杂志. 2020,45(02)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【图文】:
小鼠足细胞实时荧光定量PCR检测差异基因的表达
分别抽提正糖组、高糖组及记忆组的足细胞RNA,并行转录组测序。热图反映了差异表达基因及样本的垂直聚类结果,红色代表上调,绿色为下调(图3)。与正糖组相比,高糖组共有194个基因存在差异表达,其中119个上调,75个下调(图4A),记忆组共有532个基因存在差异表达,其中316个上调,216个下调(图4B)。因高糖记忆的分子本质系高糖诱导的细胞基因表达异常,在血糖正常后仍然持续存在,故对上述两组差异表达的基因进行再分析,发现108个基因(35个上调,73个下调)在高糖组及记忆组存在相似的表达规律,并将这些基因称为共有差异表达基因。图2 各组小鼠足细胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫荧光染色(×400)
各组小鼠足细胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫荧光染色(×400)
【参考文献】:
期刊论文
[1]地塞米松对内毒素诱导的小鼠葡萄膜炎的治疗效果及转录组分析(英文)[J]. 余鹏,邱一果,林茹,符馨予,郝冰涛,雷博. 南方医科大学学报. 2018(08)
[2]黏着斑信号通路调控肿瘤上皮间质转化的研究进展[J]. 吴艺舟,严雨欣,孙杰. 医学理论与实践. 2015(19)
本文编号:3240027
【文章来源】:解放军医学杂志. 2020,45(02)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【图文】:
小鼠足细胞实时荧光定量PCR检测差异基因的表达
分别抽提正糖组、高糖组及记忆组的足细胞RNA,并行转录组测序。热图反映了差异表达基因及样本的垂直聚类结果,红色代表上调,绿色为下调(图3)。与正糖组相比,高糖组共有194个基因存在差异表达,其中119个上调,75个下调(图4A),记忆组共有532个基因存在差异表达,其中316个上调,216个下调(图4B)。因高糖记忆的分子本质系高糖诱导的细胞基因表达异常,在血糖正常后仍然持续存在,故对上述两组差异表达的基因进行再分析,发现108个基因(35个上调,73个下调)在高糖组及记忆组存在相似的表达规律,并将这些基因称为共有差异表达基因。图2 各组小鼠足细胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫荧光染色(×400)
各组小鼠足细胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫荧光染色(×400)
【参考文献】:
期刊论文
[1]地塞米松对内毒素诱导的小鼠葡萄膜炎的治疗效果及转录组分析(英文)[J]. 余鹏,邱一果,林茹,符馨予,郝冰涛,雷博. 南方医科大学学报. 2018(08)
[2]黏着斑信号通路调控肿瘤上皮间质转化的研究进展[J]. 吴艺舟,严雨欣,孙杰. 医学理论与实践. 2015(19)
本文编号:3240027
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