红鳍东方鲀SIRT3基因的功能研究
发布时间：2021-10-24 18:10
背景Sirtuins家族是赖NAD+依组蛋白去乙酰化酶家族的第Ⅲ类去乙酰化酶,在细胞活动的很多方面都有重要的作用。去乙酰化酶3（SIRT3）是主要的线粒体内的去乙酰化酶,去乙酰化酶能使许多氧化通路活化,从而在细胞的主要代谢中发挥作用。SIRT3能够参与线粒体蛋白的表达与激活,降低氧化应激作用产生的ROS水平,其缺失会导致代谢异常,并引起氧化应激反应和一系列与衰老相关的病理症状。这可能为临床上相关疾病的研究提供重要靶点。在实验中当老鼠血液干细胞灌输SIRT3,将再生形成新的血液细胞,呈现细胞功能性衰老退化的逆转现象。红鳍东方鲀是具有最小基因组大小的脊椎动物,但基因数目却与人相近,外显子/内含子、启动子等调控区域也是非常保守,也是常用的模式生物之一。因此,在本研究我们拟获得SIRT3的重组蛋白,为进一步在动物试验中研究代谢性相关疾病及抗衰老等功能研究提供可靠的基础材料。目的获得红鳍东方鲀SIRT3基因的序列,并与哺乳动物的SIRT3进行生物信息学分析。构建了SIRT3基因的原核表达载体并进行蛋白的表达及纯化,为进一步在活体上研究SIRT3抗衰老等功能奠定基础。方法1.采集红鳍东方鲀肝脏组织...
【文章来源】：新乡医学院河南省
【文章页数】：46 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
红鳍东方鲀SIRT3基因RT-PCR扩增电泳图谱
19一致的、高保守度的和低保守度的氨基酸序列分别用“*”“:”“.”标出；KIV、GIP基序用方框标明图2 红鳍东方鲀与其他物种SIRT3的氨基酸比对表 1 红鳍东方鲀与其他物种 SIRT3 的同源性物种 同源性% 氨基酸序列号大黄鱼(Larimichthys crocea) 78.3 XP_010752299.1尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus) 76.5 XP_005470975.1梭子鱼 (Esox lucius) 73.8 XP_010888638.1半滑舌鳎 (Cynoglossus semilaevis) 69.5 XP_008310223
及人的同源性分别为78.3%、76.5%、73.8%、69.5%、55.1%、55.1%、49.5%、49.4%、48.0%、47.1%及46.6%（表1）。利用Mega5.0构建NJ系统进化树（图3）发现：分子进化利分为两支，一支为鱼类的，另一支为非洲爪蟾和哺乳动物类。鱼类这支首先红鳍东方鲀SIRT3与大黄鱼及梭子鱼聚为一小支然后再与半滑舌鳎及尼罗罗非鱼构成一分支。故红鳍东方鲀SIRT3与大黄鱼、梭子鱼的亲缘性最为亲密，与哺乳动物及非洲爪蟾的亲缘性较为疏远。图3 红鳍东方鲀SIRT3与其他生物的系统进化树2.1.3 红鳍东方鲀SIRT3蛋白的亲/疏水性分析图4 红鳍东方鲀SIRT3基因编码蛋白的亲/疏水性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]Sirtuin蛋白家族和糖脂代谢[J]. 周犇,翟琦巍. 生命科学. 2013(02)
[2]Sirt3在心肌保护方面的研究进展[J]. 邬云斌,刘新伟,刘玲. 临床麻醉学杂志. 2012(10)
[3]SirT3调节氧化应激作用[J]. 王国恩,翟羽佳,何蓉蓉,栗原博. 中国药理学通报. 2012(10)
[4]SIRT3抗癌变作用的研究进展[J]. 陈凤华,樊飞跃. 中华肿瘤防治杂志. 2012(15)
[5]红鳍东方鲀Sirt1基因的克隆及其原核表达[J]. 张伟,杨志军,王群,渡部终五. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2012(08)
[6]Sirtuin:依赖NAD+的去乙酰化酶[J]. 霍晓芳,张俊武. 生命的化学. 2005(03)
[7]河鲀鱼综合利用研究初探[J]. 林连升,彭珊,缪为民. 北京水产. 2005(01)
[8]河豚鱼与人类基因组计划[J]. 周巍,杨焕明,刘国仰. 遗传. 1997(06)
[9]21世纪医学、生物学的蓝图──人类基因组计划[J]. 杨焕明. 科技导报. 1996(09)
硕士论文
[1]河豚鱼肝肾蛋白组技术体系的建立及蛋白表达谱初步分析[D]. 郑建洲.江苏大学 2010
本文编号：3455739
【文章来源】：新乡医学院河南省
【文章页数】：46 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
红鳍东方鲀SIRT3基因RT-PCR扩增电泳图谱
19一致的、高保守度的和低保守度的氨基酸序列分别用“*”“:”“.”标出；KIV、GIP基序用方框标明图2 红鳍东方鲀与其他物种SIRT3的氨基酸比对表 1 红鳍东方鲀与其他物种 SIRT3 的同源性物种 同源性% 氨基酸序列号大黄鱼(Larimichthys crocea) 78.3 XP_010752299.1尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus) 76.5 XP_005470975.1梭子鱼 (Esox lucius) 73.8 XP_010888638.1半滑舌鳎 (Cynoglossus semilaevis) 69.5 XP_008310223
及人的同源性分别为78.3%、76.5%、73.8%、69.5%、55.1%、55.1%、49.5%、49.4%、48.0%、47.1%及46.6%（表1）。利用Mega5.0构建NJ系统进化树（图3）发现：分子进化利分为两支，一支为鱼类的，另一支为非洲爪蟾和哺乳动物类。鱼类这支首先红鳍东方鲀SIRT3与大黄鱼及梭子鱼聚为一小支然后再与半滑舌鳎及尼罗罗非鱼构成一分支。故红鳍东方鲀SIRT3与大黄鱼、梭子鱼的亲缘性最为亲密，与哺乳动物及非洲爪蟾的亲缘性较为疏远。图3 红鳍东方鲀SIRT3与其他生物的系统进化树2.1.3 红鳍东方鲀SIRT3蛋白的亲/疏水性分析图4 红鳍东方鲀SIRT3基因编码蛋白的亲/疏水性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]Sirtuin蛋白家族和糖脂代谢[J]. 周犇,翟琦巍. 生命科学. 2013(02)
[2]Sirt3在心肌保护方面的研究进展[J]. 邬云斌,刘新伟,刘玲. 临床麻醉学杂志. 2012(10)
[3]SirT3调节氧化应激作用[J]. 王国恩,翟羽佳,何蓉蓉,栗原博. 中国药理学通报. 2012(10)
[4]SIRT3抗癌变作用的研究进展[J]. 陈凤华,樊飞跃. 中华肿瘤防治杂志. 2012(15)
[5]红鳍东方鲀Sirt1基因的克隆及其原核表达[J]. 张伟,杨志军,王群,渡部终五. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2012(08)
[6]Sirtuin:依赖NAD+的去乙酰化酶[J]. 霍晓芳,张俊武. 生命的化学. 2005(03)
[7]河鲀鱼综合利用研究初探[J]. 林连升,彭珊,缪为民. 北京水产. 2005(01)
[8]河豚鱼与人类基因组计划[J]. 周巍,杨焕明,刘国仰. 遗传. 1997(06)
[9]21世纪医学、生物学的蓝图──人类基因组计划[J]. 杨焕明. 科技导报. 1996(09)
硕士论文
[1]河豚鱼肝肾蛋白组技术体系的建立及蛋白表达谱初步分析[D]. 郑建洲.江苏大学 2010
本文编号：3455739
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