基于炎症反应的阿尔茨海默症基因通路研究

发布时间：2018-03-17 06:09

  本文选题：阿尔茨海默症　切入点：基因表达数据　出处：《安徽医科大学学报》2014年11期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的融合基因表达数据和蛋白质交互作用数据(PPI),同时考虑到炎症反应是阿尔茨海默症(AD)核心病理机制之一,构建基于炎症因子核因子-κB(NF-κB)的AD相关信号传导通路。方法首先,使用线性回归模型进行显著基因提取;然后,使用整数线性规划方法(ILP)融合基因表达数据和PPI数据,构建信号传导通路。结果得到以NF-κB为起点的预测通路,通路中包含6个已确定的AD致病基因,并探寻出与AD密切相关的T/B细胞受体信号通路,发现多个与炎症相关的基因。结论证明炎症反应是AD产生和发展的重要因素之一。
[Abstract]:Objective to construct an AD related signal transduction pathway based on inflammatory factor-魏-魏 B (NF-魏 B), considering that inflammatory response is one of the core pathological mechanisms of Alzheimer's disease (AD) by fusion of gene expression data and protein interaction data. Using linear regression model to extract significant genes, then using integer linear programming (ILP) to fuse gene expression data with PPI data to construct signal transduction pathway. There are six identified AD pathogenetic genes in the pathway, and the T / B cell receptor signaling pathway closely related to AD has been found, and many genes related to inflammation have been found. Conclusion the inflammatory reaction is one of the important factors in the production and development of AD.
【作者单位】： 上海海事大学信息工程学院;美国罗文大学生物化学系;
【基金】：国家自然科学基金(编号:61271446、61003093) 上海市科委青年科技启明星计划(A类)(编号:11QA1402900)
【分类号】：R749.16

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：1623480