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中国汉族人群精神分裂症和2型糖尿病共享易感基因及其致病机制研究

发布时间:2020-07-26 13:19
【摘要】:精神分裂症与2型糖尿病都是世界公认的重大公共卫生问题。二者都属于遗传异质性多基因疾病,精神分裂症患者容易出现2型糖尿病症状,40%的精神分裂症患者有2型糖尿病家庭史,精神分裂症患者2型糖尿病的患病率明显高于一般人群,但是两者潜在的相关性未知。分子遗传学和GWAS研究也提示二者之间可能存在共同的遗传学基础,即存在共享易感基因。现至今对于精神分裂症和2型糖尿病共享易感基因的研究主要是通过全基因组扫描,转录组和蛋白组表达,虽获得不少阳性结果,但两者疾病关系极其复杂,在不同地区和种族中重复性较差,结果争议很大。 目的 本项目利用生物信息学、分子遗传学及生物统计学方法,以GWAS鉴定的2型糖尿病易感基因作为候选基因,以中国汉族人群单纯精神分裂症、单纯2型糖尿病、精神分裂症合并2型糖尿病和健康对照为研究对象,在gDNA和mRNA水平分别研究这些候选基因与精神分裂症、2型糖尿病发病的相关性,鉴定共享易感基因并探讨其可能的致病机制。 方法 本研究以中国北方汉族人群837例精神分裂症患者(SCZ组);166例精神分裂合并2型糖尿病患者(SCZ+T2DM组);229例单纯2型糖尿病患者(T2DM组),1109例健康对照个体(Control组)为研究对象。所有精神分裂症患者要符合ICD-10的诊断标准,2型糖尿病患者符合2型糖尿病诊断标准。 受试者在知情同意的情况下,采集外周静脉血5ml,用DNA提取试剂盒提取全血中基因组DNA。以GWAS鉴定的IGF2BP2(rs4402960)、SLC30A8(rs13266634)、FTO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)等8个2型糖尿病易感基因作为候选基因,分别采用PCRRFLP和高通量TaqMan探针方法(ABI PRISM7900HT sequence detectionsystem)进行基因分型,建立基因分型数据库。 采用Real-time QPCR方法检测检测外周血中IGF2BP2基因及其2种选择性剪切产物isoform a和isoform b表达水平。以GAPDH作为内参基因较正RNA含量的变异,每份样品均进行3次重复独立实验。采用相对定量方法(2-Δ Δ Ct)分析IGF2BP2基因及其2种选择性剪切产物isoform a和isoform b的mRNA表达量。应用在线遗传统计SHEsis软件计算基因型频率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;分析候选基因SNPs位点与精神分裂症的关联性;分析基因各个位点与2型糖尿病的关联性;应用SPSS17.0软件分析IGF2BP2基因及其2种选择性剪切产物isoform a和isoform b表达水平在精神分裂症组与对照组之间的差异。 结果 1Hardy-Weinberg平衡检验 IGF2BP2(rs4402960)、SLC30A8(rs13266634)在病例组和对照组中基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。 FTO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、 CDKAL1(rs7754840)、 HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)位点基因型分布在健康对照组、单纯精神分裂症组、精神分裂症合并2型糖尿病组以及单纯2糖尿病组等4个群体中大部分符合Hardy-Weinberg为平衡定律(P>0.05),说明本研究抽样样本来自随机婚配的群体。其中rs1387153位点的基因型分布在健康对照组中偏离H-W平衡;在单纯精神分裂症组中的rs5219位点以及单纯2型糖尿病组中的rs7754840位点,也均偏离H-W平衡;说明这些位点可能是疾病易感SNPs位点或与易感SNPs连锁。 2IGF2BP2(rs4402960)和SLC30A8(rs13266634)与精神分裂症、2型糖尿病的遗传学关联研究 采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,检测790例中国北方汉族精神分裂症患者和1083例健康人对照组的IGF2BP2基因rs4402960位点和SLC30A8基因rs13266634位点基因型。遗传学分析结果示:SLC30A8基因rs13266634位点等位基因、基因型频率在病例组和对照组中差异均不显著(P>0.05),提示SLC30A8基因与中国汉族人群精神分裂症发病无关联。 IGF2BP2基因rs4402960位点基因型和等位基因频率在病例组和对照组中差异显著(χ2=7.316,P=0.026;χ2=7.056,P=0.008,OR=1.221)。性别分组示:男性rs4402960位点基因型频率和等位基因频率(χ2=8.39,P=0.015;χ2=8.08.P=0.004,OR=1.324)在病例组和对照组中也差异显著,提示IGF2BP2基因与中国汉族人群精神分裂症发病相关联。 精神分裂症病人IGF2BP2基因表达水平及isoform a表达水平与健康人相比较呈增高趋势,但差异不显著。而isoform b在精神分裂症病例组(1.136±0.324)显著高于健康对照组(0.885±0.227,t=3.540,P=0.0008或Z=-3.532,P=0.0004)。提示IGF2BP2基因选择性剪切产物isoform b表达增加可能是其导致精神分裂症的机制之一。以IGF2BP2基因总体表达(isoform a+isoform b)作为自身对照,则精神分裂症病人isoform a表达水平与健康对照组比较无显著差异,而isoform b表达水平在精神分裂症病例组(1.090±0.271)显著高于健康对照组(0.916±0.180,t=2.981,P=0.004或Z=-2.779,P=0.005)。 3FTO、CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX、KCNJ11和MTNR1B与精神分裂症、2型糖尿病的遗传学关联研究 (1)候选基因与精神分裂症的关系 研究发现,FTO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)等6个2型糖尿病易感基因位点可能与中国汉族人群精神分裂症无关联(all, P>0.05)。CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)位点与中国汉族人群2型糖尿病相关联,与精神分裂症合并2型糖尿病相关联(rs10811661:χ2=10.09,P=0.002;OR=0.723; rs7754840: χ2=9.372,P=0.002,OR=1.364;rs1111875:χ2=4.853,P=0.028;OR=1.273)。 (2)候选基因与2型糖尿病的关系 CDKN2A/B基因rs10811661位点基因型和等位基因频率在糖尿病组和非糖尿病组中差异显著(χ2=10.821,P=0.004;χ2=10.821,P=0.001,OR=0.744)。CDKAL1基因rs7754840位点基因型和等位基因频率在糖尿病组和非糖尿病组中差异显著(χ2=9.704,P=0.008;χ2=8.534,P=0.003,OR=1.296)。HHEX基因rs1111875位点基因型和等位基因频率在糖尿病组和非糖尿病组中差异显著(χ2=11.769,P=0.003;χ2=12.018,P=0.001,OR=1.395)。FTO基因rs8050136位点和KCNJ11基因rs5219位点等位基因、基因型频率在2型糖尿病各组对比中差异均不显著(P>0.05),提示FTO和KCNJ11基因与中国北方汉族人群2型糖尿病发病无关联。 结论: 1.2型糖尿病易感基因IGF2BP2(rs4402960)与中国北方汉族人群精神分裂症相关联,可能是中国汉族人群精神分裂症和2型糖尿病的共享易感基因之一。 2. IGF2BP2基因选择性剪切产物isoform b表达增加可能是其导致精神分裂症的机制之一。 3.2型糖尿病易感基因SLC30A8(rs13266634)可能与中国北方汉族人群精神分裂症发病无关联。 4. CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX基因与中国北方汉族精神分裂症合并的2型糖尿病相关联,而与中国北方汉族人群精神分裂症发病无关联。 5. CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX基因与中国北方汉族2型糖尿病相关联。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R587.1;R749.3

【参考文献】

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本文编号:2770811

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