不同pH条件下高低致龋性变异链球菌sRNA SpR19及其潜在靶标GroEL的表达变化

发布时间：2019-02-16 16:08

【摘要】：目的研究在不同pH培养条件下,变异链球菌菌株的sRNA SpR19及其潜在靶向的GroEL蛋白在不同致龋力菌株中的表达变化,探讨其作为高致龋变异链球菌的分子鉴别标志物的可能性。方法提取高致龋性变异链球菌的临床分离株(菌株17)和低致龋性变异链球菌的临床分离株(菌株5)的总RNA,建库后进行高通量测序获得差异表达的sRNA;结合生物信息学与文献,挑选关键sRNA与蛋白进行不同致龋菌株表达水平的研究:qRT-PCR验证目的sRNA SpR19在pH5.5和pH7培养条件下不同致龋能力菌株中的表达水平;合成变异链球菌GroEL蛋白抗原多肽并制备多克隆抗体,Western blotting鉴定不同pH培养条件下高、低致龋菌中GroEL的表达水平;qRT-PCR验证不同pH培养条件下不同致龋能力菌株GroEL的mRNA的表达水平。结果生物信息学提示SpR19可能靶向GroEL的mRNA及上下游基因间区;不同pH条件下,相较于低致龋菌,高致龋菌中sRNA SpR19表达下降(P0.05),而GroEL蛋白与mRNA高表达(P0.05),二者表达趋势相反。结论不同pH条件培养的高致龋性变异链球菌中,sRNA SpR19均低表达,GroEL的蛋白水平与RNA水平均存在高表达,结合生物信息学分析提示sRNA SpR19可能通过靶向GroEL负调控变异链球菌的致龋能力。
[Abstract]:Objective to study the expression of sRNA SpR19 and its potential target GroEL protein in different cariogenic strains of Streptococcus mutans under different pH culture conditions, and to explore the possibility of using them as molecular markers for identification of Streptococcus mutans with high caries. Methods the total RNA, of the clinical isolates of Streptococcus mutans with high caries (strain 17) and the clinical isolates of Streptococcus mutans with low caries (strain 5) were obtained by high throughput sequencing. Combined with bioinformatics and literature, the key sRNA and protein were selected to study the expression level of different caries causing strains: qRT-PCR was used to verify the expression level of sRNA SpR19 in different cariogenic strains under pH5.5 and pH7 culture conditions. Streptococcus mutans GroEL protein antigen peptide was synthesized and polyclonal antibody, Western blotting was prepared to identify the GroEL expression level of high and low cariogenic bacteria under different pH culture conditions. QRT-PCR was used to test the mRNA expression level of different cariogenic strains GroEL under different pH culture conditions. Results Bioinformatics suggested that SpR19 might target the mRNA and the upstream and downstream regions of GroEL. Compared with low cariogenic bacteria, the expression of sRNA SpR19 in high cariogenic bacteria decreased (P0.05), but GroEL protein and mRNA were highly expressed (P0.05) under different pH conditions. Conclusion in Streptococcus mutans with high caries induced by different pH conditions, the expression of sRNA SpR19 is low, and the protein level of GroEL and RNA level are high. Combined with bioinformatics analysis, sRNA SpR19 may negatively regulate the cariogenic ability of Streptococcus mutans by targeting GroEL.
【作者单位】： 解放军总医院口腔科;军事医学科学院基础医学研究所;解放军总后勤部第一门诊部口腔中心;
【基金】：军队十二五面上项目(CWS12J126)
【分类号】：R780.2

【参考文献】

相关期刊论文 前8条

1 肖斌;陈瑜;李林海;罗树红;郝文波;;兔抗弓形虫CorA家族Mg~(2+)转运蛋白多肽抗体的制备及鉴定[J];生物技术通讯;2016年06期

2 王一舟;张雅琪;牛雪微;张志民;;变异链球菌groE操纵子及其表达与调控[J];国际口腔医学杂志;2016年03期

3 夏丽;王成龙;储冰峰;;生物信息学在预测和鉴定变形链球菌非编码RNA中的应用[J];中华老年口腔医学杂志;2015年04期

4 何胜平;陈雅华;赵瑛瑛;王继德;白杨;;肝螺杆菌甲基基团趋化信号转导蛋白多克隆抗体的制备及鉴定[J];南方医科大学学报;2013年09期

5 王成龙;胡丹阳;刘佼佼;李少华;苏东华;席庆;储冰峰;夏伟;赵强;丁红梅;罗燕萍;杨继勇;邓斌;徐娟;邵宁生;;不同致龋性变形链球菌临床分离株差异ssDNA配基的筛选和鉴定[J];南方医科大学学报;2013年05期

6 王成龙;刘佼佼;苏东华;储冰峰;李少华;夏伟;罗燕萍;杨继勇;丁红梅;赵强;邓斌;席庆;徐娟;邵宁生;;高致龋性变异链球菌临床分离株的初步筛选[J];华西口腔医学杂志;2013年02期

7 王立贵;赵雅琳;李伍举;;细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展[J];微生物学报;2009年01期

8 赵兴福;黄晓晶;蔡志宇;闫福华;钟声;邱明;;高龋患者与无龋健康人口内变形链球菌蛋白表达差异的初步分析[J];口腔医学研究;2008年02期

相关硕士学位论文 前1条

1 闫啸;分子伴侣GroEL/GroES介导重组蛋白可溶表达及折叠与组装初步研究[D];浙江大学;2012年

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 胡桐楠;郑伟;李少华;董洁;王心玲;王成龙;邵宁生;储冰峰;;不同pH条件下高低致龋性变异链球菌sRNA SpR19及其潜在靶标GroEL的表达变化[J];南方医科大学学报;2017年06期

2 胡桐楠;储冰峰;;变形链球菌环境应激反应研究[J];口腔颌面修复学杂志;2017年02期

3 靳贵晓;李娟;杨黄浩;;核酸适体的筛选及其在生物医学领域的研究进展[J];福州大学学报(自然科学版);2016年06期

4 崔伟;王成龙;;变形链球菌蛋白质组学研究进展[J];中华老年口腔医学杂志;2016年06期

5 王静芳;黄利华;伍勇;杨林飞;任瑶;邢晓为;;SUN5特异性抗体的制备及其应用[J];南方医科大学学报;2016年05期

6 赵兴福;江山;黄晓晶;闫福华;;变异链球菌临床株表面相关蛋白表达差异的初步分析[J];国际口腔医学杂志;2016年03期

7 陈泽文;黎静;李恺得;邱传彬;谯跃银;薛晶;李雨庆;;不同pH值对变异链球菌ffh基因表达的影响[J];华西口腔医学杂志;2016年01期

8 肖梅;;口服益生菌促进儿童早期龋损再矿化临床研究[J];海南医学;2016年02期

9 王天齐;陈颖钰;郭爱珍;;结核分枝杆菌相关非编码RNA研究进展[J];中国奶牛;2015年14期

10 赵兴福;江山;黄晓晶;闫福华;;酸性条件下变异链球菌临床株表面相关蛋白表达差异分析[J];天津医药;2015年07期

相关硕士学位论文 前2条

1 何姝颖;重组大肠杆菌D-1,2,4-丁三醇合成中副产物途径的敲除及关键酶的强化表达[D];江南大学;2017年

2 黄寿锟;巯基微球协助含二硫键蛋白质体外复性研究[D];浙江大学;2013年

【二级参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 王静芳;黄利华;伍勇;杨林飞;任瑶;邢晓为;;SUN5特异性抗体的制备及其应用[J];南方医科大学学报;2016年05期

2 门颖丽;王小龙;丁聪;王晓东;汲振余;王婷;康巧珍;刘鑫;;兔抗小鼠IL-23p19多克隆抗体的制备和鉴定[J];细胞与分子免疫学杂志;2016年05期

3 徐永娟;李马超;陈双双;肖诗琪;刘海灿;赵秀芹;吴移谋;万康林;;中国结核分枝杆菌五种特异性抗原人B细胞表位多态性分析[J];中华结核和呼吸杂志;2016年05期

4 周佼佼;陶莉莉;;无锡地区孕妇弓形虫感染及危险因素调查[J];中国血吸虫病防治杂志;2015年06期

5 沈继龙;王林;;弓形虫的基因型及其主要效应分子的致病机制[J];中国寄生虫学与寄生虫病杂志;2015年06期

6 张佳凤;郝文波;肖斌;廖小青;罗树红;;抗弓形虫水通道蛋白多肽抗体的制备及鉴定[J];中国人兽共患病学报;2015年10期

7 佟澄碧;郝文波;罗树红;肖斌;程莎莎;廖小青;潘迪;;兔抗弓形虫Ⅰ型液泡型质子焦磷酸酶多克隆抗体的制备及鉴定[J];南方医科大学学报;2015年08期

8 华倩倩;李相志;万玉静;陈弟;赵徐寒晖;蒋凯;胡昕;潘长旺;谭峰;;刚地弓形虫自噬相关蛋白3基因的克隆表达与多抗制备[J];中国寄生虫学与寄生虫病杂志;2014年06期

9 王成龙;刘佼佼;苏东华;储冰峰;李少华;夏伟;罗燕萍;杨继勇;丁红梅;赵强;邓斌;席庆;徐娟;邵宁生;;高致龋性变异链球菌临床分离株的初步筛选[J];华西口腔医学杂志;2013年02期

10 王成龙;苏东华;刘佼佼;储冰峰;李少华;夏伟;罗燕萍;杨继勇;丁红梅;赵强;邓斌;席庆;徐娟;邵宁生;;不同基因型变异链球菌临床分离株的分离和鉴定[J];华西口腔医学杂志;2013年01期

相关硕士学位论文 前1条

1 王红寅;疏水性电荷诱导层析分离抗体的分子模拟研究[D];浙江大学;2011年

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 陆史俊;魏昕;;变异链球菌耐酸分子机制的研究进展[J];国际口腔医学杂志;2008年05期

2 李小明;苟建重;;变异链球菌黏结素的提取及检测[J];陕西医学杂志;2009年05期

3 李小明;苟建重;;全唾液中变异链球菌受体的检测[J];西安交通大学学报(医学版);2010年02期

4 刘朝一,范生尧;营养变异链球菌的分离及鉴定[J];临床检验杂志;1992年01期

5 崔岩,李世杰,朱姝媛,李玉军;变异链球菌致亚急性感染性心内膜炎一例[J];中华医学检验杂志;1999年05期

6 田晓蓓;何永红;万呼春;;变异链球菌蛋白质组研究进展[J];国际口腔医学杂志;2008年03期

7 赵莉;林焕彩;;口腔变异链球菌表面蛋白与转肽酶的关系[J];国际口腔医学杂志;2008年05期

8 何永红;田晓蓓;万呼春;温艳丽;张菲菲;马琴睿;;变异链球菌蛋白质提取方法研究[J];华西口腔医学杂志;2009年01期

9 霍丽s，

本文编号：2424612