HIV感染者口腔唾液中真菌微生物组分析

发布时间：2022-02-19 23:18

　　目的:利用二代测序技术（next-generation sequencing,NGS）比较分析人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus,HIV）感染者和HIV未感染者口腔唾液中真菌微生物物种组成和多样性差异。方法:收集30例HIV感染者（HIV组）和30例HIV未感染者（对照组）的非刺激性口腔全唾液,采用Illumina NGS测序技术分析其物种多样性和群落组成差异。结果:Illumina NGS高通量测序共获得3450194条有效序列,采用Unoise3降噪得到4374个z OTU（zero-radius operational taxonomic units）。经物种注释获得11个门,279个属和298个种水平的物种。HIV组的Alpha多样性指数Chao1和Shannon显著高于对照组。轮枝孢属、曲霉属、伊萨酵母属、链格孢属等在对照组显著富集,念珠菌属、被孢霉属、马拉色氏菌属、青霉属、拟青霉等在HIV组显著富集。结论:HIV感染组口腔唾液中真菌微生物物种丰富度和多样性显著高于HIV未感染组。两组真菌微生物的门水平和属水平优势物种均存在较大差异。H... 

【文章来源】：临床口腔医学杂志. 2020,36(03)

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
材料和方法
    1 样本来源
    2 样本采集
    3 DNA提取和测序
    4统计学分析
结果
    1二代测序所得样本信息
    2微生物多样性分析
    3 门水平上的分布
    4 属水平上的分布
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]口腔微生物组学与口腔个体化医疗研究进展[J]. 马姝祺,周秦.  临床口腔医学杂志. 2016(10)
[2]HIV感染者伴口腔念珠菌及其它真菌感染[J]. 王园园,陈建钢.  临床口腔医学杂志. 2014(02)



本文编号：3633816