山东地区汉族人群类风湿关节炎与IRF5基因多态性的关联研究及Meta分析

发布时间：2019-02-16 01:54

【摘要】：背景：类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis, RA)是一种以慢性、对称性、进行性、侵蚀性关节炎为主要临床表现的系统性自身免疫性疾病。RA分布广泛,全球各个地区,各人种可出现。RA可于各个年龄段发病,根据不同类型,治疗医从性,进展程度及预后可各不相同,严重者可造成关节畸形甚至致残的。目前病因不清,发病机制尚不清楚。多项研究证实多种细胞因子交互作用,参与了RA的发生发展。miRNA (microRNA)是一类长度约22个核苷酸的具有调节生理病理过程的非编码RNA。机制可能是通过调控mRNA的转录、翻译或降解,来参与细胞发育、增殖、分化等生理过程,还可参与包括自身免疫性疾病、癌症等疾病发生发展。多项研究证实miR-155 (microRNA-155)与免疫系统密切相关,并在RA患者滑膜组织细胞和PBMC中表达升高。干扰素调节因子(interferon regulatory factors, IRFs)是一类在干扰素(Interferon, IFN)信号通路中起重要调控作用的转录因子,调控下游干扰素基因顺式元件。同时还可调节干扰素刺激性应答基因(interferon stimulated gene, ISG)的表达,调控ISG序列中的刺激性反应元件(IFN stimulated response element, ISRE)的转录,广泛参与免疫识别、免疫提呈及免疫防御过程。IRF5 (interferon regulatory factors 5, IRF5)被证实可能通过Toll样受体(toll-like receptor, TLRs)通路,诱导炎性因子表达,可能在RA发病中起关键的作用。目的：探讨山东地区汉族人群中miR-155靶基因IRF5(rs752637、rs3807306)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与RA易感性及病情活动度的关联,进一步明确RA的发病机制,有利于RA的早期诊断和治疗,并为基因型-表型的转化医学研究积累样本。方法：应用miRanda, targetScan、PicTa、RNA22、PITA等生物信息学软件,对miR-155的靶基因进行预测,取各生物信息学预测软件的交集汇总,最后获得分值最高且研究较多的靶基因IRF5。进一步通过Haploview软件选取IRF5标签SNP(tagSNP)位点,查询NCBI的dbSNP数据库选取IRF5的tagSNP (rs752637、rs3807306),采用高分辨率熔解曲线(high resolution melting, HRM)对322例RA患者及412例健康对照者进行基因分型,计算基因型和等位基因频率,应用SPSS19.0比较组间差异。应用SHEsis软件构建单倍体型并比较组间差异,并比较不同基因型别性别、年龄、血沉(ESR)、C反应蛋白(CRP)、类风湿因子(RF)及抗环瓜氨酸肽抗体(抗CCP抗体)组间差异。结果：rs752637以GA型杂合子常见,GG型纯合子次之,AA型纯合子较少。rs752637组间基因型频率差异有统计学意义(χ2=9.09、P=0.011), RA组GG基因型较健康对照组显著升高。rs38073063以CA型杂合子常见,CC型纯合子次之,AA型纯合子较少。rs38073063组间基因型频率差异无统计学意义(χ2=2.3、P=0.315)。rs752637和rs3807306等位基因频率：rs752637 G, A等位基因组间差异有统计学意义[χ2=7.12、P=0.008、OR (95%CI)=1.374 (1.088～1.736)], RA组G等位基因频率较健康对照组显著升高。rs3807306 C、A等位基因组间差异无统计学意义[χ2=1.104、P=0.293、OR (95%CI)=1.122 (0.906～1.389)]。IRF5基因2个SNPs连锁不平衡分析显示,rs1800796与rs1524107表现出部分的连锁不平衡(r2=0.422),2个SNPs(rs752637、rs3807306)之间,主要组成4种单倍体型,分别为AC、AA、GC、GA (SNPs顺序为rs752637、rs3807306)。其中,AA单倍体型组间差异有统计学意义[χ2=6.553、P=0.010、OR(95%CI)=1.480 (1.095～2.002)], AA单倍体型于RA组较健康对照组显著升高。RA组rs752637基因型与ESR、RF差异有统计学意义(P=0.021、P=0.040), GG基因型RA患者ESR较快,RF滴度较高；与性别、年龄、CRP、抗CCP抗体差异无统计学意义(P0.05)。rs3807306基因型与各指标差异均无统计学意义(P0.05)。结论：在山东地区汉族人群中miR-155靶基因IRF5 rs752637位点与RA易感性存在关联；2个SNPs (rs752637、rs3807306)的AA单倍体型可能是RA的易感因素；rs752637位点GG基因型RA患者ESR较快,RF滴度较高,与RA病情活动度可能存在关联。rs3807306基因型和等位基因频率在RA组和健康对照组间差异无统计学意义,其基因型与临床资料及实验室指标之间差异无统计学意义。rs3807306可能与RA易感性无关,基因型与RA病情活动度可能不存在关联。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：山东大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R593.22

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本文编号：2423927