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TXNIP基因甲基化及多态性与2型糖尿病的关联研究

发布时间:2020-03-31 21:50
【摘要】:目的旨在探索TXNIP基因(Thioredoxin-interacting protein)甲基化及多态性与2型糖尿病(Type 2 diabetes mellitus,T2DM)发病风险之间的关联强度;探索TXNIP基因甲基化及多态性与环境因素之间的交互作用对T2DM发病风险的影响;分析TXNIP基因甲基化、多态性与代谢指标之间的关联。方法本研究采用巢式病例-对照研究设计,按照年龄、性别、婚姻状况、种族和居住地五个条件进行1:1匹配,纳入病例、对照各286人。采用飞行时间质谱法检测甲基化水平和SNP分型;采用条件logistic回归模型筛选环境因素并分析TXNIP基因甲基化及多态性与T2DM之间的关联;采用分类与回归树模型和条件logistic回归联合分析TXNIP基因与环境因素之间的交互作用对T2DM发病风险的影响。在对照组人群中,采用中位数回归模型分析TXNIP基因甲基化与基因多态性和代谢指标之间的关联;采用非条件logistic回归分析TXNIP基因多态性与代谢指标之间的关联。结果1.T2DM组和对照组两组人群基线时期的身体质量指数(Body mass index,BMI)、收缩压、舒张压、空腹血糖、甘油三酯(Triglyceride,TG)、高密度脂蛋白胆固醇(High-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)、肥胖、高甘油三酯血症(Hypertriglyceridemia,HTG)、低HDL-C血症、高血压人群和T2DM家族史的分布存在统计学差异(P0.05)。2.单因素条件logistic回归显示,肥胖、HTG和高血压的个体发生T2DM发病风险分别增加119%(Odd ratio[OR],95%Confidence interval[CI]:2.19[1.43-3.35]),139%(2.39[1.51-3.77]),88%(1.88[1.28-2.75])。3.T2DM组TXNIP基因各CpG位点甲基化水平均低于对照组(P0.05)。调整潜在混杂因素后,CpG1、CpG3和CpG4低甲基化均可显著增加T2DM的发病风险(OR[95%CI]:CpG1,1.18[1.00-1.39];CpG3,1.32[1.04-1.69];CpG4,1.20[1.01-1.42])。4.在显性、共显性和隐形遗传模型下,rs7211和rs7212位点突变与T2DM之间的关联均无统计学意义(P0.05)。5.交互作用结果显示,肥胖、HTG和TXNIP基因低甲基化之间存在交互作用。与高TXNIP基因甲基化及正常BMI和TG水平的个体相比,HTG、肥胖和TXNIP基因低甲基化交互作用显著增加T2DM发病风险。6.在对照组中,rs7211和rs7212位点突变个体的CpG2、CpG3和CpG4甲基化水平均低于野生纯合子个体(P0.05);HTG患者的CpG3和CpG4甲基化水平低于TG正常个体(P0.05);与rs7212位点野生纯合子个体相比,突变个体发生肥胖的风险更高(P=0.044)。结论本研究发现,TXNIP基因甲基化水平降低可以增加T2DM发病风险,但该基因突变可能对T2DM发病风险无影响。同时,TXNIP基因低甲基化、肥胖和HTG交互作用可以影响T2DM发生。此外,TXNIP基因甲基化水平与该基因突变和TG水平有关,且该基因突变也与肥胖密切相关。
【图文】:

基因甲基化,甲基化,鸟嘌呤,胞嘧啶


a、初始化后,抬起样品臂,将 1μL 水加到检测基座上。放下样品臂,点击“Blank”进行调零。b、调零后,抬起样品臂,用无尘纸擦拭干净,并将 1μL 样本品加到检测基座上,点击“Measure”开始检测。c、待所有样品检测完后导出数据。当 OD260/280 值小于 1.7 或大于 2.0,或 OD260/230 小于 2.0,重复 DNA 提取步骤。2.2.7 TXNIP 基因甲基化及多态性位点的选择本研究选择的 DNA 甲基化目标片段位置为 chr1:145441299-145441624,详情见图 2.1,并采用 sequenom EpiDesigner 软件设计引物。

基因甲基化,对照组,甲基化水平,血症


图 3.1 T2DM 组和对照组之间 TXNIP 基因甲基化水平的比较注:*与对照组相比,P<0.05TXNIP 基因 DNA 甲基化水平与 T2DM 发病风险的关联分析见表 3.3。单素模型分析发现,各位点的甲基化水平降低均显著增加 T2DM 发生风险(P0.05),每降低 5%的甲基化水平各 cOR 值(95% CI)分别是 1.31(1.15-1.491.27(1.12-1.44)、1.55(1.28-1.88)、1.31(1.15-1.50)和 1.39(1.13-1.70)。因素条件 logistic 回归模型调整了基线吸烟、饮酒、体力活动、FPG、肥胖、TG 血症、低 HDL-C 血症和 T2DM 家族史,CpG1、CpG3 和 CpG4 位点与 T2D发生风险之间仍然具有统计学意义,aOR 值(95% CI)分别是 1.18(1.00-1.39)1.32(1.04-1.69)和 1.20(1.01-1.42),然而,,CpG2 和 CpG5 位点的甲基化水与 T2DM 发生风险之间的关联无统计学意义(P>0.05)。表 3.3 TXNIP 基因甲基化水平与 T2DM 发病风险的关联分析 位点未调整模型 调整模型*β 值 cOR(95% CI)#P 值 β 值 aOR(95% CI)#P CpG1 0.27 1.31(1.15-1.49) <0.001 0.17 1.18(1.00-1.39) 0.0
【学位授予单位】:郑州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R587.1

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本文编号:2609627

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