SLE患者PBMC中lncRNAs的表达及其临床表现相关性研究
发布时间：2020-04-28 05:07
【摘要】：[目的]长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类位于细胞核和(或)细胞质内长度超过200个核苷酸单位且缺乏编码蛋白质功能的功能性RNA分子。它可以在表观遗传水平、转录水平及转录后水平调节基因的广泛参与机体的生理、病理过程。lncRNA在细胞分化及机体的免疫反应中表现出显著的调节作用,随着各种测序技术的发展显著促进了 lncRNA在人类疾病中的研究。在SLE患者中定义与疾病相关的lncRNA有助于建立新的生物标志物和潜在的治疗靶点,同时为进一步研究lncRNA与SLE之间的具体机制及寻找疾病易感基因奠定奠定一定的理论基础。本课题将探索SLE患者外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMC)中差异性表达的lncRNA并分析其与疾病之间的关系。[方法]本研究分两个组,SLE组(SLE)和健康对照组(NC)。分别收集13例SLE患者和健康参与者空腹外周静脉血20ml,提取两组研究对象PBMC的总RNA后,结合前期高通量测序技术(RNA-seq)及HISAT、String Tie和Blotting分析后筛选出的在SLE患者中差异性表达的linc00861,进一步进行qRT-PCR对linc00861进行进一步验证,并分析其与SLE疾病临床表现的相关性。[结果]1.RNA-seq共分析63677个ensembl gene ID的基因表达矩阵,最后得到11044个有gene symbol的表达矩阵,lncRNA有1584个,我们将该表达矩阵进行对数转化,最后筛选出在SLE患者中显著性差异性表达的lncRMA主要为 linc00861;2.进一步对linc00861进行qRT-PCR验证,结果提示SLE患者(SLE组)较健康对照组(NC组)linc00861的表达水平显著降低,差异具有统计学意义(P0.05);3.进一步分析SLE患者PBMC中linc00861表达水平与其临床表现的相关性,发现SLE患者PBMC中linc00861的表达水平与SLEDAI积分负相关;尿蛋白阳性的SLE患者linc00861表达水平显著低于尿蛋白阴性的SLE患者;SLE低补体患者linc00861表达水平低于SLE正常补体患者。[结论]SLE患者PBMC中linc00861表达水平显著低于正常对照组,并与疾病活动及肾脏受累程度相关,提示linc00861可能参与SLE的发病,为SLE发病机制的研究提示新的方向,有助于建立新的生物标记和提供潜在的治疗靶点。
【图文】：
ＩｎｃＲＮＡ是一类不编码蛋白的ＲＮＡ分子，长度在２００ｂｐ以上，无逡逑阅读框架，通常呈现二级茎环样结构或是更多的二级结构［１１］，起初被认为是逡逑ＮＡ聚合酶ＩＩ转录的副产物，，不具有生物学功能；近期的研究表明ＩｎｃＲＮＡ具逡逑保守的二级结构，可以与蛋白、ＤＮＡ和ＲＮＡ相互作用，参与多种生物学过程逡逑调控，尤其在各类肿瘤疾病中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激逡逑和抑制、转录后调解以及作为ｍｉＲＮＡ的诱导分子千扰基因的表达等多种重要逡逑调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系［１２］。随着高通量测逡逑技术的发展，越来越多的ＩｎｃＲＮＡ被注释，但是绝大多数的ＩｎｃＲＮＡ的功能仍逡逑不清楚，因此ＩｎｃＲＮＡ的研究是一片非常广阔的未知领域，具有极大的研究价逡逑和意义。根据染色体上与编码基因的相对位置将ＩｎｃＲＮＡ分为反义型（ａｎｔｉｓｅｎｓｅ逡逑ｃＲＮＡｓ）、内含子型（ｉｎｔｒｏｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ邋）、基因间型（ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ）、反逡逑型（ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ邋ＩｎｃＲＮＡｓ）、X椙孔有停ǎ澹睿瑁幔睿悖澹颍╁澹郏保常保矗荨ｅ义希粒睿椋睿睿铮
本文编号：2643099
【图文】：
ＩｎｃＲＮＡ是一类不编码蛋白的ＲＮＡ分子，长度在２００ｂｐ以上，无逡逑阅读框架，通常呈现二级茎环样结构或是更多的二级结构［１１］，起初被认为是逡逑ＮＡ聚合酶ＩＩ转录的副产物，，不具有生物学功能；近期的研究表明ＩｎｃＲＮＡ具逡逑保守的二级结构，可以与蛋白、ＤＮＡ和ＲＮＡ相互作用，参与多种生物学过程逡逑调控，尤其在各类肿瘤疾病中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激逡逑和抑制、转录后调解以及作为ｍｉＲＮＡ的诱导分子千扰基因的表达等多种重要逡逑调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系［１２］。随着高通量测逡逑技术的发展，越来越多的ＩｎｃＲＮＡ被注释，但是绝大多数的ＩｎｃＲＮＡ的功能仍逡逑不清楚，因此ＩｎｃＲＮＡ的研究是一片非常广阔的未知领域，具有极大的研究价逡逑和意义。根据染色体上与编码基因的相对位置将ＩｎｃＲＮＡ分为反义型（ａｎｔｉｓｅｎｓｅ逡逑ｃＲＮＡｓ）、内含子型（ｉｎｔｒｏｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ邋）、基因间型（ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ）、反逡逑型（ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ邋ＩｎｃＲＮＡｓ）、X椙孔有停ǎ澹睿瑁幔睿悖澹颍╁澹郏保常保矗荨ｅ义希粒睿椋睿睿铮
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