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使用表示模型对糖尿病和肥胖症的关系发现和热点分析

发布时间:2020-05-05 13:21
【摘要】:随着人们生活水平的提高与生活方式的不健康,肥胖症成为了当前一种相当普遍的疾病。由于遗传基因上的关联,糖尿病和肥胖症之间存在着密切的关系,它们不但危害人类的健康,而且对社会造成了巨大的经济损失,已经成为世界上最严峻的健康挑战之一。为了帮助研究人员从大量的文献数据中快速有效地发现糖尿病、肥胖症和其他疾病之间的密切关系,寻找更加有效的治疗方式,我们提出了一种基于隐含狄利克雷分配主题模型和表示学习的新模型,命名为基于表示学习的糖尿病和肥胖症关系发现模型。我们下载了发表于2007至2016年的337,000余篇糖尿病和肥胖症相关研究文献的题目和摘要作为数据集,使用我们的新模型去发现糖尿病、肥胖症和其他疾病之间的关系。为了更清晰地分析实验结果并展示发现的疾病之间的关系,本实验使用了两种可视化工具,分别是词云统计图和弓弦图。从近10年的生物医学文献中,我们得到如下实验结果:与糖尿病之间存在关系的疾病共有26种,包括抑郁症、老年痴呆症、高血压、视网膜病变、肿瘤等;与肥胖症之间存在关系的疾病则有17种,包括哮喘、胃病、心脏病等;与两种疾病之间同时存在关系的疾病共有15种,分别是抑郁症、焦虑症、结核病、下丘脑疾病、肾上腺疾病、呼吸疾病、肺部疾病、肝炎、肝脏疾病、精神分裂症、心脏病、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、心肌梗塞、心血管疾病、高血压。为了验证实验结果的可信度和评估新模型的效果,我们从不包含于实验数据中的医学临床报告和研究文献中寻找研究事实作为证据。令人满意的是,实验发现的全部的疾病之间的关系都找到了证据支持。最后,我们借助可视化工具对近10年的研究热点进行分析,根据潜在的趋势和当前的研究现状预测肿瘤坏死因子、肿瘤、高血压、炎症、青少年肥胖症和糖尿病以及从细胞生物学机制研究致病原理可能会成为未来几年对糖尿病和肥胖症的研究热点。相信我们的实验能够为生物医学工作者调整他们的工作重点和研究方向提供帮助。
【图文】:

文献,肥胖症,糖尿病,去重


DM2 adiposityMODY adipositasurophthisis adiposisglycuresis corpulencecorpulencyfatnesspolysarcia我们使用相同的检索方式分别下载从 2007 年到 2016 年每年发表的糖尿病和肥胖症相关研究文献。得到的原始数据是 XML 格式的,需要经过解析格式转换成纯文本,才能够应用到我的实验模型。由于我对糖尿病和肥胖症相关研究的文献是分别进行检索下载的,所以两个数据集合里面必定有与两者相关的重复的文献。经过对文献数据进行去重复后,糖尿病和肥胖症相关研究的每年的文献数据量如表 4.2 所示,去重复文献后的总量为 337,881 篇。

折线图,肥胖症,糖尿病,数量变化


713 20,423 332 49,804为了更加清楚地观察 2007~2016 共 10 年间糖尿病和肥胖症相关研究文献数量的变化,我将表 4.2 中的数据进行了统计,并制作成折线图,,如图 4.2 所示。图表中,红色折线表示糖尿病相关研究文献数量,绿色折线表示肥胖相关研究文献数量,紫色折线表示两个数据集合去重复后的总量。图 4.2 2007~2016 年糖尿病与肥胖症相关研究文献数量变化图从图 4.2 中数据来看,2007 年到 2016 年糖尿病和肥胖相关研究文献数量逐年增长,尤其在 2016 年,紫色折线陡然上升,说明近年来对糖尿病和肥胖症的研究热度有明显上升,更多的研究成果被发表。这也显示了生物医学正在迅速发展,并且生物医学工作
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R587.1;R589.2;TP391.1

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