自身免疫性甲状腺疾病患者甲状腺组织组蛋白甲基化修饰研究

发布时间：2020-10-22 06:30

　　 目的:观察自身免疫性甲状腺疾病患者甲状腺组织组蛋白甲基化的修饰水平。方法:选择桥本甲状腺炎患者4例,健康对照者4例,提取甲状腺组织,分别加入特异性酶抗体,形成蛋白质-DNA免疫复合物,并通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq法)检测甲状腺组织中组蛋白甲基化的表达水平,比较病例及对照组之间组蛋白的甲基化的水平的高低。结果:(1)分析甲状腺组织中的组蛋白的甲基化水平,发现病例组组蛋白甲基化水平低于对照组。(2)HT组和正常对照组相比,组蛋白的甲基化有差异,HT组甲基化的水平与对照组相比是低的。(3)对于组蛋白位点在基因组上的分布,进行功能富集分析后发现,参与分子功能的主要是在组蛋白表达上有差异的甲基化基因,并富集在核糖体信号通路上。结论:通过对自身免疫性甲状腺疾病患者甲状腺组织的组蛋白的甲基化的组学的分析可知:HT组和健康对照组相比存在组蛋白的甲基化的差异,当进行功能富集分析后可以看到,在分子功能上主要还是有差异的甲基化的基因,它们主要是在核糖体的信号通路上。这项研究表明,表观遗传学机制可能与自身免疫性甲状腺疾病的发展有关系。
【学位单位】：新疆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：R581
【部分图文】：

TT07- k4 10344329 29635 2 22172 251 330745 9961524 10292269 99.50%TT08-In 10624985 32555 0 45000 518 315066 10231846 10546912 99.27%TT08- k4 10241908 21967 65 111989 918 411267 9695702 10106969 98.68%TT09-In 11485040 20593 103 103584 901 403273 10956586 11359859 98.91%TT09- k4 10934975 17704 321 23788 683 370544 10521935 10892479 99.61%TT12-In 14161014 28083 0 55401 699 484628 13592203 14076831 99.41%TT12- k4TT13-InTT13- k4TT14-InTT14- k4TT15-InTT15- k41651403415889277151752721475386113506511164023191279536628111 561 52422 464 58353327314 520 26537 94 52535229187 483 27424 142 52477828910 507 20449 105 47813333551 453 57224 512 49586036122 549 50940 418 57033427810 449 34027 265 43043415848943 16432476 99.66%15309460 15834812 99.66%14593258 15118036 99.62%14225757 14703890 99.66%12918911 13414771 99.32%15743956 16314290 99.46%12302381 12732815 99.51%

图 2 比对质量分布图Fig.2 Compare the mass distribution注：横坐标是 MAPQ（reads 和参考序列之间比对结果的质量值），纵坐标是 reads 数。2.2.3 reads 在基因组上的分布统计对各组样本比对到基因组上各个染色体的密度进行统计，发现所有样本在 22 对常染色体和 1 对性染色体上均有分布，在 X 染色体上亦表现出较高的密度分布，这也从一方面说明了桥本甲状腺炎患者多数为女性的原因。

图 2 比对质量分布图Fig.2 Compare the mass distribution注：横坐标是 MAPQ（reads 和参考序列之间比对结果的质量值），纵坐标是 reads 数。2.2.3 reads 在基因组上的分布统计对各组样本比对到基因组上各个染色体的密度进行统计，发现所有样本在 22 对常染色体和 1 对性染色体上均有分布，在 X 染色体上亦表现出较高的密度分布，这也从一方面说明了桥本甲状腺炎患者多数为女性的原因。
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本文编号：2851230