小鼠高脂血症模型的竞争性内源RNA调控网络研究

发布时间：2021-02-23 05:02

　　目的基于高通量测序数据,探讨小鼠高脂血症模型中长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）的表达特征及竞争性内源RNA（competitive endogenous RNA, ceRNA）调控网络,筛选lncRNA介导的参与血脂异常发生发展的关键调控通路。方法应用正常饮食和高脂饮食分别诱导ApoE-/-小鼠12周,建立高脂血症模型;进行肝脏全转录组测序,筛选差异表达的lncRNAs、微小RNAs（microRNAs, miRNAs）和信使RNAs（messenger RNAs, mRNAs）;对差异表达的mRNAs进行基因功能（Gene Ontology, GO）分析和信号通路（KEGG）注释;结合并分析lncRNA-mRNA共表达关系、miRNA-mRNA靶向关系、lncRNA-miRNA共表达和靶向关系,构建lncRNA介导的ceRNA网络并筛选关键ceRNA调控轴。结果高脂血症小鼠肝脏全转录组测序筛选出117个差异表达lncRNAs、53个差异表达miRNAs和1689个差异表达mRNAs;差异表达的mRNAs主要参与脂质代谢过程、脂肪酸代谢过程和类... 

【文章来源】：中国分子心脏病学杂志. 2020,20(01)

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 研究对象及材料获取
    1.2 血脂（TC、TG、HDL-c和LDL-c）检测
    1.3 肝脏RNA的提取和质量控制
    1.4 测序数据的获取
    1.5 差异表达lnc RNAs、mi RNAs和m RNAs的筛选
    1.6 差异表达m RNAs的功能富集分析
    1.7 ceRNA调控网络的构建及关键调控轴的筛选
2 结果
    2.1 小鼠高脂血症模型的建立
    2.2 小鼠高脂血症模型的肝脏全转录组测序分析
    2.3 差异表达m RNAs的基因功能和通路注释
    2.4 小鼠高脂血症模型的ce RNA调控网络
3 讨论



本文编号：3047058