中国汉族人群多基因遗传位点与高原肺水肿易感性的关联研究

发布时间：2017-08-11 10:37

  本文关键词：中国汉族人群多基因遗传位点与高原肺水肿易感性的关联研究

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【摘要】：背景：高原肺水肿(High-altitude pulmonary edema,HAPE)是高原性疾病中主要的致死性疾病,属于肺水肿疾病中的一种罕见类型,主要发生在数天内到达海拔2,500-3,000米的人群中,使人们的健康受到严重的威胁。近年来,基因组研究已经发现很多单核苷酸多态性位点(SNPs)与HAPE的发病风险相关,然而在中国人群中关于SNPs和HAPE的关联性却鲜有报道。因此,本研究选取中国汉族人群为研究对象,重复验证这些SNPs与HAPE的相关性,并检测其他位点是否也存在这种相关性；此外,本研究还筛选了先前报道的与端粒长度相关基因上的一些遗传位点,并检测了它们与HAPE的相关性。方法：选取267个HAPE病例和304个正常对照的样本,对109个基因多态性位点进行了分型,进而来评估它们与HAPE发病风险之间的相关性。结果：关联分析结果表明7个多态性位点(AGTR1基因位点rs275651,rs275652, rs4524238和rs385338,ADRB2基因位点rs1042718,GSTP1基因位点rs749174,GNB3基因位点rs4963516)和2个单体型(AGTR1基因单体型AG和AA)和HAPE显著相关(rs275651,A vs.T,p=0.017;rs275652,G vs.T,p=0.016;rs385338,CG/CC vs.GG,p= 0.045；rs4524238,AA vs.AG/AG vs.GG,矫正后p=0.040；rs1042718,A vs.C,p.0.045； rs749174,A vs.G,p=0.042;rs4963516,G vs.T,p=0.006;Haplotype AG vs.TT, p= 0.018;Haplotype AA vs.GG,p=0.040)。在对端粒长度相关基因的分析中,发现ACYP2基因位点rs6713088和rs17045754,TSPYL6基因位点rs12615793和rs11896604, RTEL1基因位点rs6089953,rs6010621,rs4809324和rs2297441和HAPE存在显著的相关性(rs6713088,GG vs.CC,p=0.049;rs17045754,CC vs.GG,p=0.044；rs12615793, AA vs.GG,p=0.035;rs11896604,GG vs.CC,p=0.026;rs6089953,G vs.A,p=0.009; rs6010621,G vs.T,p0.001；rs2297441,A vs.G,p=0.021；rs4809324,CT vs.TT,p= 0.022)；以及后续的单体型分析显示,GT和AT(rs6089953-rs6010621)是引起HAPE发生的主要风险单体型(GT,p=0.013;AT,p=0.008),而GG(rs6089953-rs6010621)则是主要的保护性单体型(p0.001)。结论：为研究中国汉族人群中特定多态性位点和HAPE之间的显著相关性提供了可靠的依据,这些位点可用作HAPE的诊断和预后的分子标志物,在临床研究中具有重要生物学意义。
【关键词】：高原肺水肿 基因多态性 单体型 中国汉族 分子标志物
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R594.3
【目录】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-8
• 缩略语对照表8-12
• 第一章 绪论12-23
• 1.1 高原肺水肿12-13
• 1.1.1 高原肺水肿的概述12-13
• 1.1.2 高原肺水肿的诊断标准13
• 1.1.3 严重程度分级13
• 1.2 高原肺水肿的临床表现13-15
• 1.2.1 流行病特征13-15
• 1.2.2 临床检查15
• 1.3 高原肺水肿的治疗和预防15-16
• 1.3.1 治疗15-16
• 1.3.2 预防16
• 1.4 高原肺水肿的病因16-18
• 1.4.1 急性高原病(AMS)和低氧血症16
• 1.4.2 肺毛细血管通透性的可变性16
• 1.4.3 先天性异常16-17
• 1.4.4 运动17
• 1.4.5 炎症因素17-18
• 1.5 高原肺水肿的分子遗传学研究18-19
• 1.6 单核苷酸多态性研究19
• 1.7 立题依据19-23
• 1.7.1 HAPE易感基因的位点选择依据19-20
• 1.7.2 端粒长度相关基因的位点选择依据20-22
• 1.7.3 实验技术路线22-23
• 第二章 材料和方法23-31
• 2.1 实验仪器设备23
• 2.2 主要试剂23-24
• 2.3 研究人群24-25
• 2.3.1 研究人群的来源24
• 2.3.2 人群筛选标准24-25
• 2.4 样本采集与DNA提取与纯度检测25-26
• 2.4.1 采样25
• 2.4.2 DNA提取25
• 2.4.3 DNA纯度检测25-26
• 2.5 SNP位点选择26-27
• 2.5.1 HAPE相关基因位点选择26
• 2.5.2 端粒相关基因位点选择26-27
• 2.6 SNP分型27-28
• 2.7 统计分析28-31
• 2.7.1 人群特征的统计学分析29
• 2.7.2 哈迪-温伯格平衡检验29
• 2.7.3 单SNP位点分析29
• 2.7.4 单体型分析29-31
• 第三章 结果31-64
• 3.1 Massarray分析31-33
• 3.2 HAPE对照和病例的主要人群特征33
• 3.3 候选SNP位点在等位基因模型下与HAPE的相关性33-39
• 3.4 候选SNP位点在各个模型下(基因型,显性,隐性和加性模型)与HAPE的相关性39-47
• 3.5 高原肺水肿易感基因上检测的SNP位点连锁不平衡与单体型的构建47-49
• 3.6 端粒长度相关基因上检测的SNP位点在等位基因模型下与HAPE的相关性49-52
• 3.7 端粒长度相关基因上检测的SNP位点在各个模型下(基因型,显性,隐性和加性)与HAPE的相关性52-62
• 3.8 端粒长度相关基因上检测的SNP位点连锁不平衡与单体型的构建62-64
• 第四章 讨论64-71
• 4.1 AGTR1基因位点和HAPE的相关性分析65-66
• 4.2 ADRB2基因rs1042718位点和和HAPE的相关性分析66-67
• 4.3 GSTP1基因rs749174位点和HAPE的关联性分析67-68
• 4.4 GNB3基因rs4963516位点和HAPE的关联性分析68
• 4.5 RTEL1基因位点和HAPE的关联性分析68-69
• 4.6 其他基因位点和HAPE的关联性分析69-70
• 4.7 本研究的不足之处70-71
• 第五章 结论71-72
• 参考文献72-82
• 附录82-88
• 攻读硕士学位期间取得的科研成果88-89
• 致谢89

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前4条

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本文编号：655669