RNA结合蛋白UNR促进人神经胶质瘤细胞的迁移并调控RPL9的表达
发布时间:2020-06-02 10:44
【摘要】:RNA结合蛋白种类较多,其可以结合单链或者双链RNA,在众多的细胞生物学进程中扮演重要角色,特别在转录后水平对基因表达有很重要的调控作用。它几近完全地参与了 RNA的代谢过程:经由构成核糖核蛋白复合物,它可以调控RNA的成熟,剪接,运输,多聚腺苷酸化,mRNA(message RNA)的稳定性,mRNA的翻译等等。目前有报道指出,当一些RNA结合蛋白表达异常或者发生突变,其可能参与一些恶性肿瘤的发生发展。UNR(Upstream-ofN-Ras),在哺乳动物中也被称作是 CSDE1(Cold Shock Domain containing E1)是一种具有五个保守冷休克结构域的RNA结合蛋白,其主要参与调控细胞生理进程中mRNA的稳定性,mRNA的翻译等过程。然而最近一些报道指出,UNR在人黑色素瘤中具有较高的蛋白表达水平并促进黑色素瘤的侵袭和转移;其较高的表达水平可以作为胰腺导管腺癌预后理想的分子标志物。但是,UNR是否在人神经胶质瘤中具有功能还是未知的。在我们的研究结果中,发现UNR在神经胶质瘤细胞和病人组织样本中呈较高的表达水平。并且,敲低UNR可以明显的抑制肿瘤细胞的迁移能力但不影响其细胞增殖。通过分析已公开的UNR在人黑色素瘤中的iCLIP-seq,RNA测序和核糖体印记测序这一系列测序数据,我们在神经胶质瘤细胞中通过RNA免疫沉淀和生物素标记的RNA pull down实验验证了 UNR可以结合PTEN和核糖体蛋白RPL9mRNA的3'UTR。同时,我们发现敲低UNR可以抑制RPL9的表达。RPL9在人神经胶质瘤中高表达,利用siRNA敲低RPL9,肿瘤迁移侵袭有关的标志物Vimentin的表达有明显的下调。这提示RPL9可能通过一定的机制参与调控了胶质瘤细胞的侵袭迁移。本研究首次在胶质瘤细胞中揭示了 RNA结合蛋白UNR的功能,并且发现了它可以调控核糖体蛋白RPL9的表达。这为我们更进一步研究胶质瘤的发展提供了新思路。
【图文】:
是这在_+/-杂合小鼠的表型上并没有所表现[6]。另一方面,iV-rm基因的表逡逑达变化对WVi?基因的表达也没有影响[7]。现代生物测序技术发现,t/M?具有六逡逑个转录本,它们在2号,,3号和6号外显子上有所不同,如图2所示。之前的一逡逑项研究发现,缺少6号外显子的2号转录本与1号转录本相比在除了大脑以外的逡逑一些实验所用组织中均具有较高的表达水平[8]。除此之外,UNR的2号蛋白异逡逑构体,其对应的转录本缺少6号外显子而使得蛋白异构体缺少31个氨基酸[9]。逡逑该异构体与1号异构体相比,在发挥刺激人类鼻病毒(HRV-2)邋IRES处的翻译逡逑起始过程中具有更高的生物学活性[1()]。逡逑Transcript邋variant逦Exon邋structure逡逑4逦1邋1邋|逦2逦1邋3邋1邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1逦8-21逦|邋4330邋nt逡逑3逦1邋1邋|逦2逦1邋3邋1邋4邋[邋S邋1邋7邋|逦8-21逦|邋4237邋nt逡逑1逦1邋1邋j邋2邋I邋4邋1邋5邋I邋6邋1邋7邋1逦8-21逦丨邋4183邋m逡逑2逦1逦1邋|逦2逦1邋4邋1邋5邋|邋7邋1逦8-21逦\邋4090邋nt逡逑5邋|邋1邋j邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1逦8-21逦 ̄|邋3796邋nt逡逑6逦1逦1邋1邋4邋1邋5邋1邋7邋1逦8-21逦1邋3703邋nt逡逑图2邋MVi?各转录本的情况逡逑2.邋UNR的生物学功能逡逑UNR在基因表达调控中兼备着多种功能
蛋白(SXL)邋—起,要抑制剂量补偿复合物中msl-2的翻译,它们通过结合在逡逑msl-2的3’UTR来抑制其翻译,进而来抑制雌性生物中X染色体的剂量补偿[15,16],逡逑如图3所示。逡逑3'邋UTR逡逑"P,0逡逑43S逦1逦elF4G邋|逡逑5.UTR逡逑图3邋UNR作用于msl-2邋mRNA的3’UTR模式图逡逑除此之外,在近期的一项研宄中,通过利用UNR在人黑色素瘤中的iCLIP-seq,逡逑RNA测序和核糖体印迹测序这一系列测序数据的生物信息学分析,发现UNR逡逑可能在翻译的延伸或者终止中发挥着重要作用[17]。总而言之,UNR作为一个逡逑mRNA调节因子,其发挥什么样的功能取决于其靶向结合哪种mRNA和细胞的逡逑类型。逡逑UNR也介入一些正常的生理过程中。近年来一些报道指出,UNR参与神经元逡逑的迁移,敲低UNR会阻滞小脑前神经元朝目标区域的迁移UNR参与维持人逡逑类胚胎千细胞处于未分化的状态[19];邋UNR还阻滞小鼠胚胎干细胞向原始内胚层逡逑的分化[2()]。逡逑3.UNR与疾病逡逑UNR与某些疾病的发生发展也有密切关系
【学位授予单位】:北京协和医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R739.4
本文编号:2693036
【图文】:
是这在_+/-杂合小鼠的表型上并没有所表现[6]。另一方面,iV-rm基因的表逡逑达变化对WVi?基因的表达也没有影响[7]。现代生物测序技术发现,t/M?具有六逡逑个转录本,它们在2号,,3号和6号外显子上有所不同,如图2所示。之前的一逡逑项研究发现,缺少6号外显子的2号转录本与1号转录本相比在除了大脑以外的逡逑一些实验所用组织中均具有较高的表达水平[8]。除此之外,UNR的2号蛋白异逡逑构体,其对应的转录本缺少6号外显子而使得蛋白异构体缺少31个氨基酸[9]。逡逑该异构体与1号异构体相比,在发挥刺激人类鼻病毒(HRV-2)邋IRES处的翻译逡逑起始过程中具有更高的生物学活性[1()]。逡逑Transcript邋variant逦Exon邋structure逡逑4逦1邋1邋|逦2逦1邋3邋1邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1逦8-21逦|邋4330邋nt逡逑3逦1邋1邋|逦2逦1邋3邋1邋4邋[邋S邋1邋7邋|逦8-21逦|邋4237邋nt逡逑1逦1邋1邋j邋2邋I邋4邋1邋5邋I邋6邋1邋7邋1逦8-21逦丨邋4183邋m逡逑2逦1逦1邋|逦2逦1邋4邋1邋5邋|邋7邋1逦8-21逦\邋4090邋nt逡逑5邋|邋1邋j邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1逦8-21逦 ̄|邋3796邋nt逡逑6逦1逦1邋1邋4邋1邋5邋1邋7邋1逦8-21逦1邋3703邋nt逡逑图2邋MVi?各转录本的情况逡逑2.邋UNR的生物学功能逡逑UNR在基因表达调控中兼备着多种功能
蛋白(SXL)邋—起,要抑制剂量补偿复合物中msl-2的翻译,它们通过结合在逡逑msl-2的3’UTR来抑制其翻译,进而来抑制雌性生物中X染色体的剂量补偿[15,16],逡逑如图3所示。逡逑3'邋UTR逡逑"P,0逡逑43S逦1逦elF4G邋|逡逑5.UTR逡逑图3邋UNR作用于msl-2邋mRNA的3’UTR模式图逡逑除此之外,在近期的一项研宄中,通过利用UNR在人黑色素瘤中的iCLIP-seq,逡逑RNA测序和核糖体印迹测序这一系列测序数据的生物信息学分析,发现UNR逡逑可能在翻译的延伸或者终止中发挥着重要作用[17]。总而言之,UNR作为一个逡逑mRNA调节因子,其发挥什么样的功能取决于其靶向结合哪种mRNA和细胞的逡逑类型。逡逑UNR也介入一些正常的生理过程中。近年来一些报道指出,UNR参与神经元逡逑的迁移,敲低UNR会阻滞小脑前神经元朝目标区域的迁移UNR参与维持人逡逑类胚胎千细胞处于未分化的状态[19];邋UNR还阻滞小鼠胚胎干细胞向原始内胚层逡逑的分化[2()]。逡逑3.UNR与疾病逡逑UNR与某些疾病的发生发展也有密切关系
【学位授予单位】:北京协和医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R739.4
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1 田宁宇;RNA结合蛋白UNR促进人神经胶质瘤细胞的迁移并调控RPL9的表达[D];北京协和医学院;2018年
本文编号:2693036
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