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Hcy代谢相关基因甲基化与缺血性脑卒中的相关关系

发布时间:2020-11-03 02:32
   目的为了评估Hcy代谢相关基因S-腺苷高半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase,AHCY)基因、胱硫醚β合成酶(cystathionineβ-synthase,CBS)基因、二氢叶酸还原酶(dihydrofolate reductase,DHFR)基因、亚甲基四氢叶酸脱氢酶1(methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 1,MTHFD1)基因、丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase 1,SHMT1)基因启动子区DNA甲基化是否与缺血性脑卒中相关,进一步研究AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1、SHMT1基因启动子区甲基化是否可以作为诊断缺血性脑卒中的潜在的生物标志物。方法选择152例脑梗死患者为病例组和152例性别、年龄相匹配的健康对照者为对照组,应用荧光定量甲基化特异性PCR(qMSP)检测AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1、SHMT1基因启动子区甲基化水平,进一步分析其与缺血性脑卒中的相关关系。结果1、病例组AHCY启动子区DNA甲基化水平是0.16%(0.07%,0.32%),对照组是0.25%(0.02%,0.67%),差异无统计学意义(P=0.115,Z=-1.577)。2、病例组CBS启动子区DNA甲基化水平是70.20%(49.19%,94.87%),对照组是104.10%(74.65%,132.30%),差异具有统计学意义(P=3.71E-10,Z=-6.266)。按性别进行亚组分析,病例组男性CBS启动子区DNA甲基化水平是64.33%(47.72%,85.66%),对照组是105.00%(73.23%,128.85%),差异具有统计学意义(P=2.667E-08,Z=-5.562)。病例组女性CBS启动子区DNA甲基化水平是78.05%(51.81%,107.90%),对照组是102.80%(86.11%,149.90%),差异具有统计学意义(P=0.003,Z=-2.990)。按年龄进行亚组分析,青年组(≤44岁)中病例组CBS启动子区DNA甲基化水平是(69.97±13.61)%,对照组是(114.71±59.62)%,差异具有统计学意义(P=0.015,t=-2.636)。中年组(45~59岁)中病例组CBS启动子区DNA甲基化水平是56.04%(48.07%,76.23%),对照组是91.71%(68.28%,118.58%),差异具有统计学意义(P=6.744E-06,Z=-4.502)。老年组(≥60岁)中病例组CBS启动子区DNA甲基化水平是81.60%(49.37%,127.45%),对照组是119.35%(87.71%,167.90%),差异具有统计学意义(P=2.644E-04,Z=-3.648)。基于病例组和对照组之间CBS启动子区甲基化水平的研究结果,我们建立了ROC曲线,ROC曲线下面积(AUC)是0.713(95%CI:0.652-0.773),以87.1%为甲基化截取值可获得最佳的灵敏度和特异度,分别是67.4%和74.0%。3、病例组DHFR启动子区DNA甲基化水平是28.37%(13.40%,50.82%),对照组是44.22%(19.55%,77.78%),差异具有统计学意义(P=1.648E-04,Z=-3.768)。按性别进行亚组分析,病例组男性DHFR启动子区DNA甲基化水平是27.06%(9.55%,50.83%),对照组是44.81%(23.47%,77.74%),差异具有统计学意义(P=9.455E-05,Z=-3.904)。病例组女性DHFR启动子区DNA甲基化水平是31.35%(17.64%,50.70%),对照组是40.30%(8.98%,78.07%),差异无统计学意义(P=0.375,Z=-0.887)。按年龄进行亚组分析,青年组(≤44岁)中病例组DHFR启动子区DNA甲基化水平是14.36%(0.44%,25.11%),对照组是59.11%(42.47%,104.92%),差异具有统计学意义(P=9.068E-04,Z=-3.318)。中年组(45~59岁)中病例组DHFR启动子区DNA甲基化水平是24.77%(5.90%,45.91%),对照组是44.99%(14.81%,76.63%),差异具有统计学意义(P=0.007,Z=-2.700)。老年组(≥60岁)中病例组DHFR启动子区DNA甲基化水平是42.87%(19.75%,55.19%),对照组是39.38%(23.12%,74.29%),差异无统计学意义(P=0.268,Z=-1.107)。4、病例组MTHFD1启动子区DNA甲基化水平是3.48%(2.47%,8.68%),对照组是4.66%(1.88%,7.00%),差异无统计学意义(P=0.827,Z=-0.219)。5、病例组SHMT1启动子区DNA甲基化水平是39.53%(29.05%,58.61%),对照组是41.46%(25.87%,56.17%),差异无统计学意义(P=0.683,Z=-0.409)。结论1、AHCY和MTHFD1甲基化水平可能与脑梗死发病不相关。2、CBS和DHFR低甲基化与脑梗死的发病相关,并且CBS低甲基化可能作为诊断脑梗死的潜在的生物标志物。3、SHMT1甲基化水平与脑梗死发病不相关。
【学位单位】:郑州大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R743.3
【部分图文】:

正态分布,甲基化水平,片段,测序


用 Q50(Q25,Q75)表示;在 Log 转化后 c 符合正态分布,用( x ±s)示存在缺失样本。加粗表示 P<0.05。候选基因甲基化水平检测结果1 AHCY 甲基化结果在本研究中,我们采用 qMSP 方法对脑梗死组和对照组中 Hcy 代谢相HCY、CBS、DHFR、MTHFD1、SHMT1 甲基化水平进行定量分析,并数(四分位间距)表示甲基化水平。如图 1.1 所示,测试片段位于 AH区(chr20:34303211-34303334)的 CpG 岛(CGIs)。病例组 AHCY甲基化水平是 0.16%(0.07%,0.32%),对照组是 0.25%(0.02%,0.6 1.2 所示,我们的研究结果表明病例组中 AHCY 启动子区甲基化水平与间无明显差异且无统计学意义(P>0.05)。

甲基化水平,病例,启动子区,对照组


图 1.2:病例组和对照组 AHCY 甲基化水平的比较BS 甲基化水平结果 1.3 所示,测试片段位于 CBS 启动子区(chr21:43076986-43 岛(CGIs)。病例组 CBS 启动子区甲基化水平是 70.20%(49.19%, 104.10%(74.65%,132.30%)。如图 1.4 所示,我们的研究结CBS 启动子区甲基化水平明显低于健康对照组,并且差异有统计.01)。

甲基化水平,启动子区,片段,测序


图 1.2:病例组和对照组 AHCY 甲基化水平的比较CBS 甲基化水平结果图 1.3 所示,测试片段位于 CBS 启动子区(chr21:43076986-430G 岛(CGIs)。病例组 CBS 启动子区甲基化水平是 70.20%(49.19%,9是 104.10%(74.65%,132.30%)。如图 1.4 所示,我们的研究结 CBS 启动子区甲基化水平明显低于健康对照组,并且差异有统计0.01)。
【参考文献】

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本文编号:2867966

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