基于二代测序靶向捕获技术的遗传性痉挛性截瘫一家系致病基因的研究

发布时间：2021-01-01 16:47

　　目的:遗传性痉挛性截瘫（Hereditary spastic paraplegias,HSPs）是一组具有临床和遗传异质性的神经退行性疾病,伴有进行性下肢痉挛和无力。本研究旨在应用靶向捕获二代测序技术（Targeted-Capture Next Generation Sequencing,TCNGS）为一个中国HSP家系所患疾病做出准确的基因诊断,并为家系成员遗传咨询等提供依据。方法:以该HSP家系3代共11人为研究对象,绘制家系图谱。获取知情同意后,采集II代4人,III代5人的外周血样,抗凝并提取全血基因组DNA（g DNA）。同时对他们进行详细的病史采集及体格检查,并着重对3名患者收集包括颅脑磁共振检查（Magnetic Resonance Imaging,MRI）、肌电图（Electromyogram,EMG）等在内的其他临床辅助检查资料。首先,我们对先证者（II-1）的g DNA样本进行靶向捕获二代测序,将得到的结果与Human参考基因组数据库、千人基因组数据库、db SNP142数据库等有关数据库进行对比、过滤、筛选,再运用SIFT、Poly Phen2、FATHMM等生物... 

【文章来源】：华中科技大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

遗传性痉挛性截瘫家系图谱，黑色箭头代表先证者（II-1）

18 2 家系内 3 名患者的颅脑磁共振图像。 a、c、e 图为矢状面 T1 加权成像f 图为横断面 T2 加权成像，II-1 (a，b)、II-3 (c，d)、II-4 (e，f) 三人均可轻度萎缩，而胼胝体均表现正常。基因检测结果

22图 3 正常者（上）和患者（下）的 SPG7 基因突变位点的电泳图谱。突变位点用红色箭头显示。a 图示四个碱基插入杂合突变(c.1150_1150+1insCTAC)。b 图示两个相邻位点的错义突变（c.2062C>T,p.Arg688Trp 和 c.2063G>A, p.Arg688Gln）共同导致了一个终止密码子突变(p.Arg688Ter)。

【参考文献】：
期刊论文
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[5]脐血干细胞移植成功治疗遗传性痉挛性截瘫一例[J]. 杨华强,张荣环,杜玲,李东升,袁雅红.  中国全科医学. 2011(03)
[6]遗传性痉挛性截瘫治验1则[J]. 吕慧青,齐瑛,宋艾云.  北京中医药大学学报. 2001(05)
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[8]遗传性痉挛性截瘫[J]. 栗灵,王承武,范源.  中华骨科杂志. 1997(12)

硕士论文
[1]应用全外显子测序对一个遗传性痉挛性截瘫家系致病基因的研究[D]. 井忠翠.青岛大学 2017
[2]靶向捕获二代测序检测不明原因儿童失神癫痫的致病基因分析[D]. 苏文婷.山西医科大学 2017



本文编号：2951645