丙型肝炎病毒部分蛋白区段T、B淋巴细胞抗原表位的研究
发布时间:2021-02-28 23:31
HCV是输血后肝炎的主要病因之一,感染后慢性化率高,部分慢性感染者可发展成为肝硬变及肝癌。HCV属黄病毒科,为单股正链RNA病毒。由于RNA复制酶的差错率较高,HCV基因组表现出很高的变异率。变异可能是HCV逃避获得性免疫系统的压力,在宿主体内持续感染的机制之一。我们对两例慢性HCV携带者及一例HCV RNA转阴者的HCV HVR1及NS3区部分区段测序,研究包含B细胞抗原表位(HVR1)和CTL抗原表位区段(NS3)的演变规律。 本研究选择两例HCV持续感染者,一例HCV RNA转阴者,分三个时间点对两个区段进行五年随访研究。采用单链手工测序的方法,连续观察HCV两个区段5年中的变异情况(HVR1平均每个时相测27个克隆,NS3每个时相测5个克隆的序列)。三例感染者用抗体进行HLA分型。分析序列资料时,建立了通用软件和免费序列分析软件相结合的分析方法。编写了预测T细胞抗原表位的软件GUOTIF(http://www.fmmu.edu.cn/GUOTIF.htm)。 研究有如下发现: 1.三例感染者的HCV基因分型为1b,三者感染源可能相同,或存在交叉感染。 2...
【文章来源】:中国人民解放军空军军医大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
Ⅰ 中文摘要
Ⅱ 英文摘要
Ⅲ 缩写词、常用名词及符号表
Ⅳ 前言
Ⅴ 文献回顾
1 丙型肝炎基本情况
2 丙型肝炎病毒的分子生物学
3 RNA病毒相似株的概念及理论
4 丙型肝炎病毒持续性感染与免疫逃避
5 T淋巴细胞抗原表位预测
6 生物信息学
Ⅵ 材料与方法
1 实验材料
2 实验方法
3 测序资料的分析方法
Ⅶ 结果
1 HLA分型
2 核酸序列测定及注册
3 序列资料初步分析
4 多序列对齐
5 遗传距离及进化树分析
6 变异对螺旋酶高级结构的影响
7 T细胞抗原表位预测
Ⅷ 讨论
1 HCV相似株
2 CTL抗原表位
3 序列分析
4 T细胞抗原表位预测
Ⅸ 小结
Ⅹ 致谢
Ⅺ 附图
Ⅻ 附录
ⅩⅢ 参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]用计算机程序预测可与HLA-A2分子结合的HCV抗原肽[J]. 周红超,董明清,徐德忠,闫永平,张景霞,宋宏彬,李远贵. 细胞与分子免疫学杂志. 1996(04)
[2]中国人丙型肝炎病毒基因组的一级结构及其变异[J]. 毕胜利,白宪鹤,丛勉尔,田厚文,孙得贵,H.S.Margolis,刘崇柏. 病毒学报. 1993(02)
本文编号:3056612
【文章来源】:中国人民解放军空军军医大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
Ⅰ 中文摘要
Ⅱ 英文摘要
Ⅲ 缩写词、常用名词及符号表
Ⅳ 前言
Ⅴ 文献回顾
1 丙型肝炎基本情况
2 丙型肝炎病毒的分子生物学
3 RNA病毒相似株的概念及理论
4 丙型肝炎病毒持续性感染与免疫逃避
5 T淋巴细胞抗原表位预测
6 生物信息学
Ⅵ 材料与方法
1 实验材料
2 实验方法
3 测序资料的分析方法
Ⅶ 结果
1 HLA分型
2 核酸序列测定及注册
3 序列资料初步分析
4 多序列对齐
5 遗传距离及进化树分析
6 变异对螺旋酶高级结构的影响
7 T细胞抗原表位预测
Ⅷ 讨论
1 HCV相似株
2 CTL抗原表位
3 序列分析
4 T细胞抗原表位预测
Ⅸ 小结
Ⅹ 致谢
Ⅺ 附图
Ⅻ 附录
ⅩⅢ 参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]用计算机程序预测可与HLA-A2分子结合的HCV抗原肽[J]. 周红超,董明清,徐德忠,闫永平,张景霞,宋宏彬,李远贵. 细胞与分子免疫学杂志. 1996(04)
[2]中国人丙型肝炎病毒基因组的一级结构及其变异[J]. 毕胜利,白宪鹤,丛勉尔,田厚文,孙得贵,H.S.Margolis,刘崇柏. 病毒学报. 1993(02)
本文编号:3056612
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