MassARRAY定量分析法与普通亚硫酸盐测序法检测心肌梗死大鼠模型低甲基化基因序列的效果比较

发布时间：2017-09-08 20:40

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【摘要】：目的通过比较MassARRAY定量分析法与普通亚硫酸盐测序法(BSP)检测心肌梗死大鼠乙醛脱氢酶(ALDH2)基因启动子甲基化的效果,为确定适用于低甲基化基因序列检测的最佳方法提供依据。方法取10只平均体重为(200±10)g的雄性Sprague-Dawley大鼠,将其随机分入对照组和实验组,每组5只。实验组行心脏冠状动脉左前降支结扎术,制备心肌梗死模型。常规饲养7d后,取实验组大鼠心脏梗死边缘区心肌组织,同时在对照组的相同区域取材。提取边缘区心肌组织DNA,分别采用MassARRAY定量分析法和普通BSP检测两组大鼠ALDH2基因核心启动子上游同一段DNA序列甲基化情况。结果 BSP可检测显示目标区域12个CpG位点,但检测结果示对照组和实验组均无DNA甲基化发生;MassARRAY定量分析法可检测显示目标区域10个CpG位点(2号至11号位点),实验组和对照组10个CpG位点均有低度DNA甲基化(30%),且两组间5号、6号和7号CpG位点甲基化水平的差异均有统计学意义(P值均0.05)。结论对于低甲基化基因序列,MassARRAY定量分析法较BSP拥有更好的DNA甲基化检测精度和检测效率。
【作者单位】： 山东大学;复旦大学附属中山医院上海市心血管研究所;复旦大学生物医学研究院;
【关键词】： DNA甲基化 MassARRAY定量分析法 普通亚硫酸盐测序法 低甲基化基因序列
【分类号】：R542.22;R-332
【正文快照】： DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,组行心脏冠状动脉左前降支结扎术制备心肌梗死DNA甲基化水平变化会影响靶基因的表达水模型。术后行心脏超声检查确定手术成功,常规平[1-2]。随着DNA甲基化在生命科学研究中地饲养7d后,对两组大鼠同时实施安乐死取材。实位的上升,在方法学

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本文编号：816219