湖北2013年部分柯萨奇A16型肠道病毒VP1基因分子特征分析
本文关键词:湖北2013年部分柯萨奇A16型肠道病毒VP1基因分子特征分析
【摘要】:目的全面研究和了解2013年湖北省柯萨奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型别及分子进化分析。方法对2013年湖北省21株CVA16病毒流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析。结果2013年湖北省21株CVA16型病毒流行株的VP1区核苷酸序列全长均为891bp,VP1区核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为90.0%~100.0%和96.3%~100.0%。VP1区基因系统进化分析表明,湖北CVA16流行株主要位于ligeage1和3分支上,分属于B1a和B1b基因亚型。结论 2013年湖北省21株CVA16型流行株主要为B1b基因亚型,其次为B1a基因亚型,在同一地区有两种基因亚型的CVA 16病毒同时存在,在不同的地区存在同一种亚型的CVA16病毒。
【作者单位】: 湖北省疾病预防控制中心;
【关键词】: 柯萨奇病毒CVA型 VP区 基因特征
【基金】:国家科技重大专项课题(No.2012ZX10004207)~~
【分类号】:R373
【正文快照】: 国家科技重大专项课题(No.2012ZX10004207)手足口病(Hand-Foot-Mouth disease,HFMD)是由肠道病毒引起的传染病,多发生于5岁以下儿童。引发手足口病的肠道病毒有20多种(型),以柯萨奇病毒A16型(CVA16)和肠道病毒71型(EV 71)最为常见[1]。虽然CVA16与EV71型病毒在遗传上有一定的
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