人源α-烯醇化酶B细胞表位鉴定及其与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应预测

发布时间：2017-09-18 08:44

  本文关键词：人源α-烯醇化酶B细胞表位鉴定及其与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应预测

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【摘要】：目的:预测鉴定人源α-烯醇化酶蛋白的B细胞抗原表位,探讨人源α-烯醇化酶与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶之间的交叉反应性。方法:以人源α-烯醇化酶蛋白序列为基础,综合应用多个软件预测B细胞线性表位;再以人源α-烯醇化酶的蛋白晶体结构为基础,采用4个生物信息学软件综合预测B细胞构象表位;利用原核表达系统对人源α-烯醇化酶蛋白进行表达、亲和层析法进行,纯化抗原免疫BALB/c小鼠,化学合成预测的线性表位片段检测抗体反应,确定人源α-烯醇化酶蛋白B细胞表位。利用Clustal X进行蛋白质序列比对和Swiss-Model进行同源模建,研究人源α-烯醇化酶和牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应性。结果:人源α-烯醇化酶线性B细胞表位优势区域为9-25aa,28-43aa,70-85aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;构象性B细胞表位优势区域为:1-4/24-30/77-86/124aa,9-16/51-59aa,250-254/262-268/271-274aa;合成的线性表位片段中9-25aa免疫应答反应最强烈,其次是70-85aa,再次为28-43aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶氨基酸序列同源性高达50.11%,两者在线性B细胞表位优势区域的9-24aa和32-42aa序列高度相似;空间构象比对结果显示牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶之间的RMSD值为1.055姒,且两者在3个构象性B细胞表位优势区域的空间构象高度相似,推测二者可能在上述区域发生交叉反应。结论:预测并鉴定了人源α-烯醇化酶蛋白的B细胞抗原表位,比较其与牙龈卟啉单胞菌的烯醇化酶可能发生交叉反应的位点,为研究人源α-烯醇化酶蛋白的自身抗原性和类风湿性关节炎发病机制提供了理论基础。
【作者单位】： 华中师范大学生命科学学院 湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室;华中科技大学附属协和医院风湿免疫科;
【关键词】： 抗原表位 人源α-烯醇化酶 牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶 交叉反应
【基金】：国家自然科学基金(No.30972693,21473065) 湖北省自然科学基金重点项目(2014CFA079) 中央高校科研业务费专项资金(CCNU13F011)基金资助
【分类号】：R392.11
【正文快照】： 1本文受国家自然科学基金(No.30972693,21473065)、湖北省自然科学基金重点项目(2014CFA079)和中央高校科研业务费专项资金(CCNU13F011)基金资助。2华中科技大学附属协和医院风湿免疫科,武汉430022。类风湿关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)是一种以滑膜炎症、关节软骨损坏为主

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 黄艳新;鲍永利;李玉新;;抗原表位预测的免疫信息学方法研究进展[J];中国免疫学杂志;2008年09期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 张莹;李敏;刘宇;韩忷s，

本文编号：874536