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果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析

发布时间:2017-09-20 08:40

  本文关键词:果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析


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【摘要】:目的利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能。方法基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析。结果Tap蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜区和信号肽,在细胞核中发挥生物学效应,具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域。Tap蛋白与来源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致,Tap蛋白与人类和啮齿动物的编码产物高度同源,在系统发生树中距离最近。结论果蝇Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型结构,可能在果蝇胚胎发育早期的神经发生、分化等过程中发挥作用。
【作者单位】: 河南科技大学医学院生物医学实验教学中心/神经遗传实验室;河南科技大学医学院人体解剖与组织胚胎学教研室;
【关键词】Tap蛋白 螺旋-环-螺旋构型 分子结构 计算生物学 果蝇 黑腹
【基金】:国家自然科学基金面上项目(31171256) 自然科学基金河南科技大学配套经费(09001504) 河南科技大学博士启动基金(13530057)
【分类号】:R384.2
【正文快照】: 碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)蛋白家族广泛分布于生物界,存在较高的保守性。大部分bHLH蛋白以同源二聚体或异源二聚体发挥转录因子作用,主要调节各种干细胞向终末细胞的分化,在骨骼肌、胰腺发育、血液发生、果蝇神经干细胞分化以及脊椎动物脊髓、端脑皮层的

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前6条

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4 周雅;高贝;张道远;;齿肋赤藓早期光诱导蛋白ELIPs的生物信息学分析[J];生物信息学;2014年04期

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6 沈建英;林玲;郑志z,

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