霍乱弧菌中VSP-Ⅰ岛的分布和变异特征研究

发布时间：2017-10-01 15:05

  本文关键词：霍乱弧菌中VSP-Ⅰ岛的分布和变异特征研究

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【摘要】：目的探讨霍乱第7次大流行基因岛1(VSP-Ⅰ)在霍乱弧菌中的分布和变异特征。方法从美国国立生物技术信息中心的Gen Bank数据库中下载所有霍乱弧菌基因组数据,以霍乱第7次大流行代表菌株N16961的VSP-Ⅰ作为参考序列,筛查所下载霍乱弧菌基因组中的VSP-Ⅰ。使用MUMmer软件进行单核苷酸多态性(SNP)分析,Orth MCL软件进行同源基因分析,BLAST软件进行序列结构变异分析和功能注释。结果 VSP-Ⅰ广泛存在于霍乱弧菌中,其中霍乱第7次大流行的105株菌株中均携带VSP-Ⅰ,且其序列高度保守;其中94株菌的VSP-Ⅰ完全一致,仅在11株菌中分别存在1~14个SNP位点。而2株非O1非O139群菌株携带VSP-Ⅰ,但和大流行菌株相比,存在插入缺失等序列变异。同时,VSP-Ⅰ有9个共有保守基因,VC0183虽在所有菌株中均存在,但在2株非O1非O139菌株中长度发生改变。此外,VSP-Ⅰ携带5个与该岛的转移和整合相关的基因(VC0181~VC0185),VC0178编码马铃薯糖蛋白类似物,VC0180编码蛋白水解酶,二者可能与毒力相关。结论作为霍乱第7次大流行菌株中的特异性基因簇,VSP-Ⅰ已转移至非O1非O139群菌株中,并发生序列的变异。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】： 霍乱弧菌 VSP-Ⅰ岛 分布 变异
【基金】：国家传染病重大专项(No.2012ZX10004215)~~
【分类号】：R378.3
【正文快照】： 霍乱是一种烈性肠道传染病,在我国作为法定甲类传染病进行管理。其病原体为霍乱弧菌(Vibriocholerae)。目前已发现霍乱弧菌有超过200个血清群,其中只有O1和O139血清群能引起霍乱暴发[1]。历史上已有7次世界性霍乱大流行,其中前6次由O1血清群古典生物型引起,目前所处的第7次大

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4 记者 叶明e，

本文编号：954103